Blg02978.33 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg02978.33
Unique NameBlg02978.33
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000127:738974..759219+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg02978.33 ID=Blg02978.33|Name=Blg02978.33|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20246bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:738974..759219+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGTTGTTACAGTTTCTTGTTCGAGGACACAAAACTACCACAACTTCTGCC GCATTCCGCATTGAAATGTGTGTTTTCTCGGGTGAGTATGGCCATAAAAT ACAACACGTTGTATTCCGCATCACCCACGGTCCCAGCCCTCCCGCGGGCC GGACCTACCTATGGCCGTCAGGCGATCAGAACCGCGGTCGGGCTGGTACC TCGGGTGATACGGAATACCCCGTGTTGTATTTTATATGTATATCTAACAA AAACACAGGCATCTTCAAATTAAATCTGTATCTTTTCCTGGTACCATGAC ACAATGGATTGTGTGCTTGGACTTTCAAATACTGAAATATATAAATCTTT TTTTTATTTTTACAGACAAATTTACAACAGTAAACAGACATATTGAGTTG TGATTTTATTTCAAATGGACAAGAAAAAAGACACTAGAAGTAGAAGATAT GTCTTTGGTAGGTGTGTCATCCCTTGTATGTTGAAATTGCAATGTGTGTT TGTGGGTGGTATCATGTGTGTTGTCTAGAATTTATTTCAGCCAGGGATAT CTCCATGGCAACACGTCTCCATGGCAACACGTTTCCATGGCAACATTAAG TCCACTAGCTGAGATTCTCCCAATTCTCGATATGACGTTATGTCCCTTTT TTCCACATATGGCAGACTGTTTTGTCTTTGTTGTTGCTGTGTAACTGTGC AAACTGTAACTGCCACCAGAAAATTAATTAAGACAATTTTGAAGACTACG TTTCAAAACAGATGTCCAACCGCCATGTATGATTCTACTGTCACATTTGA ATAATAAAGATATTAAAGAAAATACAGAAGTGTTCAAGATATTTCCCGAA TTTTTATATAGATGACATGGACCAAATGACTGAACTATGCACATGAAGTA ATTTAAATTTGACTGGTACATTATGGCTGTGTGAATGTGTCTTCTACATT GTATGAAAGTATAGTCTTTGTGAGAGAAAGTTGTGCTTTTGTGTTTTTTG TCCACTCTCCTTCTTAAGACTTTAGATCTTACTTACGTTAGAAACTTTGA TTTTGCTTTTGTTTTTAGCTTCATTTTTCTTTCAACTGCGACACAGCAGT AACTAAGTTTCTTCTGGTCTATGTGTGTGTGTGTGTTGCCTTTTTTCTTA GGCTCTGGCTAAGGGGAAGACCAATGTATTCAAGTTGGAAACCAGCACCC CACCGCCTCGCAAATCTGTGTCCGCGCCGTCAATCGTTAAAAGAGTGCCC GCGAGACCAATTAAAGTAAATATTTCTGTCCAGGTGGCATCCCCGAGCAT GGTTTGGACTGACTCTGTAACTACCAGAACTCTGTTTTCTTGTTGTTGAG AAACTCAAAGTGTTGCATTTGTCTTCCAAAAGCCTGTGTTGATCTCAAGT GGTCTTCTGTTTCTTTACATTTGTGAAGAAGAATAGTAAAGTGGTAATTA CCATTCTCTTAAGTACATGTTGTCAATGTGCATTGTGCCGACATGCGACG ATTTCATCTTAAGACAGACATTTTTGTTATCCGTAAAAAAAATTGTCTTT GAAAGCGAGATGAAAGTTTGTTTTATACAAGCCTCATACACATAGAAAGC CTTTTAATATTGTATTCTTATGAAATTGTAAATTTGTAAGGATAATATGA ATCTATACTGTGATGGAAATGCTAGAAACATCATGTTTTCAATGAAATTC TCTTTTGACAGAAACATAAACATAATTCCTTTTTTTGCAAAAGATCCTTT TAAACTTGTTTATTAGGAGGAAAATGACACAACAAATCTTGCTTCCATTC CAAAACCATAAAGAAGAATGTGATAGCAGTACAGTGGCATCCATGTGTAA ATATGAAAACAAATGCACATTGAACATAATTGATAAAGAAAACCTGAAAT ATTATTTTGTAGTTTTGAAAAGGGATATTCCAAGGATCAAACCCCACCAT AAGACAAATGCAACACTATCATGTGCTACTGACAAAGGAAAAACACAACA TACTTTCACTAAATCGTGTTTCGAATGCTGTGTGTTTTGTGAATGCTTTG TGTTGTACCTTTGGCATGCACCTTTCTTACCAGTGTGTGGCTAAGAATTG TTTGAATCTTGAAATTAGATATAGAACTTTTTGTGTTATGACAAGAACTT CTCAAAATTTGTTGCCCAAAGTATGTTTATTGGAAGAAGTTATGAA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000127:738974..759219+

>Blg02978.33 ID=Blg02978.33|Name=Blg02978.33|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=600bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:738974..759219+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTCGAAGCTGGAGCAAGTGTTAATCCTAGAACCTTCCGGGGAGCTAAA
ATTCAAAGGACCTTTCACCGAAGTAGTAACATCAAATTTGAAGTTGAACA
ACCCAACAGACAAGCGGGTATGTTTCAAAGTCAAGACCACAGCTCCGCGG
AGATACTGCGTGCGGCCCAACAGCGGGGTAGTCGAGCCTTCATCTTCCAT
AAATGTCTCAGTGATGCTTCAGCCCTTTGACTACGACCCCCAGGAGAAGA
ACAAGCACAAGTTCATGGTGCAGTCCATGTTCGCGCCCGAGGGCGGCATC
GACAACGAGACGATGCTCAATATGTGGAAAGATGCAGACCAGACCCAGCT
GATGGACTCTAAGCTGAAGTGTGTGTTTGAGCTGCCTCCAGAAGCCCTAG
AGGCTCTGGCTAAGGGGAAGACCAATGTATTCAAGTTGGAAACCAGCACC
CCACCGCCTCGCAAATCTGTGTCCGCGCCGTCAATCGTTAAAAGAGTGCC
CGCGAGACCAATTAAAGTAAATATTTCTGTCCAGGTGGCATCCCCGAGCA
TGGTTTGGACTGACTCTGTAACTACCAGAACTCTGTTTTCTTGTTGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02978.33Blg02978.33-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:738974..739146Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:738974..739146Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:743840..743992Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:743840..743992Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:753086..753198Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:753086..753198Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:756703..756780Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:756703..756780Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:758175..759219Blg02978.33-exon-Sc0000127-1570713199:758175..759219Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000127genomeSc0000127:738974..759219 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg02978