Blg02955.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg02955.0
Unique NameBlg02955.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000127:168618..181412+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg02955.0 ID=Blg02955.0|Name=Blg02955.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=12795bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:168618..181412+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGTTTTCTTTTGATTTTTAGTTCAACTATTTCAAGTCAATAAGTTTTGCT ATCAAAGCTTTGCATACAAAGTGTTGAATAGCACTTGAGTGTGAGTGAAT GTAATTTATGATTCTTTCTTGCAACTCATATGGAAAGACTGTACAAGATA AGAGTATTCAGTGAAATCCTCTGCCATTTCTCCTCAGTTATCACTTCATC TCCGTCATCCTTCCTGCATTTTTTAAGGATTTTATCTGATCTCATTTTTC TACAAGTCAGATCGGTGTACTCCCTGCCAGCGCCTTAGGCTAGAATTCCC AACAATTCCCTATTGTTTAAGAATATTTGAACTGATTCCTAGGGCCAAAT ATACATCCAGGTCTGTTCAAAACACTTCTTTTAATGGGGAAAGCCAACAT ACTGTCAAACGATCATGAACTTACATGACGTATATATACACTTTTTGTGG TATCTGGGAAACACACAGTTACATTCATTCAGGGCTGCCACCAGCTTTAA ATTTTTTTCCGCCCCACTTATTGTTTGGGAGCCAATTTTCTTAATTATCA TTGTTGAATTTGTCATTTTAAGCTTGAAAAAAATTTCATCAGTTTTATGA AATTGATATGTTGGGGACGGAAGGGGTTGAATTTTTTTCTGTCACAACAA GCAAATTTCCATCCTGGGACAAAAGGACAGGTCCTGGAGACAGCCCTGCT TCATTGTACACATGCACACACACACATACAGGTACACACACACACACAGC ACACATACATACAATACACAAACACACACACATCACACATACATACATAC ATACACACACACACACACACACACACGAACGCACATAGTCAACAAGATTG GCAACATAAAAAGATGTTGCCATGGCGACGGTGGTCTCTGTTAACGTTTT CGTTTTTAGCCGACATGCAAATAAGGACCTCGCATAAATCATATCAGTCG ATCACCTTCTTTACCAAATTAACACAAGTTGTCCAATGTATGAAAATCTT GTTTTCACAAAAAAAGATATCGTACCATTTCCTCATAAATTATGTAAATG AGGCCCTCTATGCATGATTTGTGTCTAATAGTGGCCACATTTACTTAACT TCCAAATGGTGCAAAAATGAAATCCCCATCATTTACCACTATGGATTTAA AGTATTTTGTTATTAATTATGCAAATTAAGTATCAATTTGCATAATTGAT ATCTATCGATATTTATCTCTTTCTCAGTTACATATGTCATGTGTTTGAGA GTCCTATAATAGAATTCAGCTGATTTATTAACTGTCCTCATTAATTATGC AAATCAGATATTGATTTGCATAATTGNACACAAAATTATGATGATCCGTC ATCGCCTTCTTGCGTTATTCTCTTTCAAAGTTTGAGTCAAAATCAGCTCC TGCAGTTCCAAAAAAAGCATCAAGGGGGTCCAAATCTACAGGACATATTT TCCTAACAAAGAGCTATCCACCACTTAAAAATCATGACTATAGCATGTTC AGAAGACGAGATTTGAAAAGTGAAATTTCCCCTGCAGTACAATAGAAAGT CGCTAGGGGGCCCAAAATCCAATCATTACAAGGTCTCCCACAGACAGACC TACCCACCTACAAAATATGAAGACAATACATCCAGGCATTCTTGAGTTAT CGTCCCATGGACTTTCACATTCCTGTACAATTCCTAGAATTCTTGCAATC TGCACACAATATAGTAAAAATTTGGCTCGCCCCTGAGGCGTCGCCAAAAA NATTCTTGAGTTATCGTCCCATGGACTTTCACATTCCTGTACAATTCCTA GAATTCTTGCAATCTGCACACAATTTAGTAAAAATTTGGCTTGCCCCTGA GGCGTCGCCAAAAATATAACCTCCTTGCCACGGTAATATATGAACCCCAC TTCCTTCATTGGTCCACAGAGACAGACACTGCAGGAATGTAAGACACCCT ATAAACCATGTCAGAACTTCAAACAGACCTCAAGCTAAGCCTAAGTCCTC CCGGAGACATCAGGCAAACGTACTGCTATCAACAATTTGTCGCCAGGTCT TATCCTGATGAATCAGTCTAAGCAAGATTATTGGAAGTAAGCTTAGGGTT GCTGTGCATGTGGTTTCTATAGCATATGTCACTGTCAGAAGGCAGACGTT CTTGCTTCCTAATCTGCTGATGTTTAATGAGGGATTCAGGGTCTTAGTCT GTTTTTGCCTTTCTTGTTCATCCCTGCTCGATTTAGACAAATGTCTGTTA CCTAACTGGTAAGATGCATTGATTAACATCATTCTGCTATAGGCATCCAG TTCTCAGAAAATTTCCTATAGTTATGATGGCTTAGCATATCAGACAACAA AGTCTCGTAGCTCATATTATTTGGAAACTTCAAATGAGCAAAAATTAACG TGAAACCCTTTGCCAAGCAGGTTATGTTTTTCTTGCCGTTTGTGTGTGCA TTTGTCTGTGTGTTGGCAGCATAACTAGTTTTGAGAAGCTATGGATGGAT CATTATGATATTTGCTAGGTTGGTAGGGGTTGGGAAAAGGCAGGTTGAGT TCCATAATGGGCCTCCTAGCGGGTTTCTACGGTACTGCAGCAGAATGTCC AGTTTTGAATATCTCTGGACATGCTATGGTCATGATTTTTCAGTGGTAGA TACATTTAGCTCTTGTAGCTGACTAAAATGGGTCATCTAGCTGCAATCAC TTAAAAGTCAAATGAAATGCCACAAAACTAGAACTTGTGACCAATTCAAT TAGAGGTAAAAGACTTTGTTGCTAGTATTCATAACTGTTGCCATTATTCA AACCTTAATTACATATTGGTACAGCGCAGACAATTAGACTGAAAGTGATA 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AAATACATTTTTGTAAGTTTTATGTCATGAAGTTCAGATTGTTTGACAGA AGGGGGGAAATTTATGTCCGTCCTGATAAACAATTTCCGTCATGGGACGG AGGGACGAGTCCTGGATCGGAGACAGCCCTGCATATATAGTCAGTCTTTT CTATTTGTGCTTTCATGTATATTATTTCTTGTTACACTAGCTTTCCTTCA TTTGTTGTACCCTATCCCTGTTCTTGTCTTCATGTCTAAGAACAAATTTA CATGATTGTATATCAGGTGAGTTTGAATTAGCAGTGAACAAAATTCTACA ACATTTGTACTATTATATGAACTGCTAATGGCTGAAATACAGTGTTTGAG CCTAAGTTACTAAATACATACAATATCATCATGACACTTGAGGGTACATC CTCGATACTGTCACATGTTCCAATGGTGGCAAGATAAGTATGCCCAAGAC TAAGGGTTCAAAAGCTCTGATATAAAACATACTTGACAGTTGCCATAGGA CAGTGTAATAACTTACTGTAACTGTTGACATTTTTGCGATGGTGTGATAT GTAAACTTTTTTCACGGTTACCTCTTTTCTAAGAACTTAAAACCACCACA GAATATCTTGTTCTGTTTTATACCTGCCTTCCTCCCTGTTTCAACCGCAT ACTAAAAACTACCGCAAGATTTTCTCCCTAACACGAAATTAATTCCCCGC AAACTTAAATGAATTTACAGTATTGGAGCTTGTTGTTGGGATTGTAACCC TCTAAGGCTTGATTTAATAAACTAAAATTTGTGGCATACGTGTGGGTATT TAGGAATTGAGCTTATTCCTTTTGTAACCAATGCTGATGCTATCATGTAA TGCATATTTTGTAAGCACTGACATGAAAATTCCTTCTGTGGCCCTGCCTG AAGCATCATGCATCGATAATAGGGGTCATGCAGGGTCAAGTGGATAAAAG CATTAGCTGTGTAGGTGTCTTACAATACTGGACTTCCTGCAAACCAACAC TGGATAAAAATACCTTAAAGGTACCCAGAGCATTTTATGAGGCTTGAAAA TTGAAAATATTCTAGTTGCAGTATTTGTTATTAAATTGACATTTAATGCC ACCGTCTACCACATTCGTGTGGTTATTTCAGATCAAAAGCGATGCAAAAA TAAGCTACACAGTGATCACATAAGTTTCACATGCCTAGTGTAATAGACCA ATCCCATAGCCCCACCTACCTCCATCAAAACATACAGTTGCAAAATAAAA ACATAGAAATGCAAATTATTTGATGGACATCCATCCACTCTCTCATCGGT CAAGCTGAATCTTTTCATTTTCTCATTGGCTAAATTGCTAATTGTGATGG ACAGTCAGGATCAGTCTAATAGACTGAAACAGAACGGGATTTTCTATCAG TTCTCACCACACAACGACATCGCATCTTTGCTCCTTAAATGTTGATATGT AGAAATGACAAGAAATTTTGGATTCGAGTTTCAAGCCCCATAACATGCTC TGGGTGCCTTTAAGTTTCTTTTCCAAGGACTGAGAAGAATTTCTTCTGAC CTATATGTATCTTGTGGGGCGGGTTCCGGTGGTGTAGTGGTCTGCGCCGC TGTCACCACATCTGGTTCAAATTATGAGGAGCCAGAAGGCCCGATTTCGT GCCCCGGGTAGGACATAACTGAATGAGGTGCACCGAGCCTCAGTCATACC AAAGACTTTATAAAAATGGTACATACTTCTGGAACAGTATGGAAGTTAAA CACACTCCACTGCCAGTGGACTAGCCCCCTGCTGCAGTGATTGCACCTCA GTGTGTCCCATGGCCACCGAAACGGAGATGAGCTCCGCCCTAAACACCTT ATGGTGTGGGACGACTTTAACTTTAACTCTAACATGTATCTTGTATCTCC CCCAGAATCAGGACAGCAGATGTGGCTGTGCTGCGAAACCTTCACAGCAG CTGACATCGCGCTGTCCACCCTGCTACACCGGCTGACATTCCTGGGGCTG TCCCGCCGTTACTGGGGCAACGGGATCCGCCCCCACATCCAGAACTACTA CACCAGGGTACAGGAACACCCGTCCTTCAAACAGGTGGGACCCCCTGCCA AGGGTTTTATATTGTTTATATTTGTTTGTTTATTTCTTTATTTGGATTTT TCATACAGGTCATCAGTAGGGGTATCAAAACATTTGTAAAAACACCTCTG CTAGTTACCGCCCCTCTAAATGATACAGAATCAAATTATATCATTCACAT TGTTTTAGGGTGTAAAATGAACATCAATTAGCCTTTAAGTGCAATTTTAG ATACAGCTTGGACATAAAGAACATTTAAATGCAATTTAAGCATGATGACA CAGTTCAATCTTTGACTGCTACATGTATGTCTGTTGTGAATGATACATTG ATTGATCAATTGATTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTAAGT TCGTTGATTGATTGTTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA TTGATTGATTGATTGATTGACATGTGCTGGGGAACATGAACAGCCTTGAG CTGCAATATCTGTTGAGGAATAATGCAATTGATTAATTGATTGATTGATT GGTTGGTTGATTGACATGTGCTGGGGAACATGAACAGCCTTGAGCTGCAA TGTCTGTAGAGAAATAATGCAATTGATTGGTTGGTTTGGTTTGATTGACA GGTGCTGGGGAACGTGAACAACATTCTCTGGTCAGCCGTCATGCCCACAA TATTCCGTATGGTCAAGCGGAGGAGTCCACACATAATGACCGGGGCGTCG GTTCTCGCTCTCTCAGCTTCACTCATGTACATGTATTTCAAGAGGAAGTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000127:168618..181412+

>Blg02955.0 ID=Blg02955.0|Name=Blg02955.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=951bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:168618..181412+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCACGACTGGCCCTTATAGAGAAGCGTCTTAAGTACGATGAGCATGA
CGTCAGCCTGCCGCTCAACGAGAACACGGAACCGTGGTTCATGCGTATCA
ACCCATCGGGCGAGGTTCCCGTCCTGGTACACGGCGAGCAAATCCTGGCC
GATGCCAACAGCATCATCAACTATATAGAGGAAACCTTCACTGATGACTC
TGTACCGAGGCTCGTTCCTCCCGAGGACACCACGGCGGGAAGGCGCGTCC
GATATTTCCGTGAGATCCTGGATAACCTCCCTGTGGCTGCGTACACCCAT
GGCTGTATCCTCCATCCACAGCTGACAGCAGACAGCATGATCCCCAGCTA
CGCTACCGCAAAACTAAAAGGCATGATCGCGCAGACAGAACAGACGCTGA
CAAAGCGAGCGAGCGAACACCCGGACCTGAGCGAGGCGTACATGAAGAAA
CAGAAGCAGCTCCAGCAGCAGCTGCAGCAGCACGACGACATCAACTACAT
GAAGAGGCTGCTGCACGACCTGGAGGAGACCCTGGACTTTGTGGAGAGGG
AACTGGTCCTCAGGTTCAAGGACACACACGAATCAGGACAGCAGATGTGG
CTGTGCTGCGAAACCTTCACAGCAGCTGACATCGCGCTGTCCACCCTGCT
ACACCGGCTGACATTCCTGGGGCTGTCCCGCCGTTACTGGGGCAACGGGA
TCCGCCCCCACATCCAGAACTACTACACCAGGGTACAGGAACACCCGTCC
TTCAAACAGGTGCTGGGGAACGTGAACAACATTCTCTGGTCAGCCGTCAT
GCCCACAATATTCCGTATGGTCAAGCGGAGGAGTCCACACATAATGACCG
GGGCGTCGGTTCTCGCTCTCTCAGCTTCACTCATGTACATGTATTTCAAG
AGGAATTGCAGAAAACTGCCAAATCTCAGTCGACAGGCTGAAGCCATTTA
A
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:168618..168620Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:168618..168620Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:169913..170105Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:169913..170105Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:171753..171926Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:171753..171926Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:173020..173229Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:173020..173229Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:180023..180201Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:180023..180201Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:180819..180964Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:180819..180964Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:181367..181412Blg02955.0-exon-Sc0000127-1570713199:181367..181412Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02955.0Blg02955.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000127genomeSc0000127:168618..181412 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg02955