Blg02836.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview


Name	Blg02836.0
Unique Name	Blg02836.0
Type	mRNA
Organism	Branchiostoma lanceolatum (Amphioxus)

Full-screen view

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000037:75206..80635-
coding sequence from alignment at Sc0000037:75206..80635-

mRNA from alignment at Sc0000037:75206..80635-

Legend: CDSpolypeptideexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Blg02836.0 ID=Blg02836.0|Name=Blg02836.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=5430bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000037:75206..80635- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGGCTTGGGCAGCAGATGCACAGTGGGGAGCGCCTGACAAGCCTCCA
TTCTCGCCTTCAAAAGGAAGCAGAAAAGATCAACAAATGGAAACATCAGA
CAGAGATGCAAATCCAGCAGAGAGAAAGGAAGATCCAGGACACCCAGCAA
ACCATTGATTCACAACGCAAGTCCATTCTTGAGCTGCAGCTTCAGAATGA
GAATCTCAGCTCCAAGCTGCAGGAGGAGATAGATGGCCGTGTGGAGATCA
TGAAGAAGATCACTGCCACTCGAGACATGTGCTACCTGCTCAAAGATCAT
GCTGCTAATGTTGAGGAGAGGATGGGAAAGTGTGAAGCCAACCGAGATGA
GCTACAGTCCTTACAGCATGACACGGTGTTCCAACTCCAAGAGTTGACAT
CTAAATTCAACAACCTTCGCATCAATCATACTGAGGCAGAAAAAGTTCTC
GGAAACAAGGTGAAGGAAAGTGTGAGTGAGCTCAACCAGGTTAAGTGTGA
TTACCAAAATGAGAAGGTGAACATGGAGAAAAGGCTTGAAGGTTTGATAC
AGCAATGTTCTGAGAAAGAGATGGAAATTTCAAAGCTCACAGGTGCACTC
ACAGATAAGCAAGCTCAGCTCAGTGACCTGAAGCAACAGTGCAGCATGCT
GGAGGAACATGTTGCAAAGCTGGAAGATGAGGTCAAGTCTCTTCAAGATC
AGCTGCAAGAGGCAAGTGACAAGATCTTCAGCAAGGATAAGGAGATGGAG
AAGATCTCGGGAGAGTTGGCCAATACTGAGGCACAGCTGCAAAAAGTGTC
CAATGATTGTGAGCAACTTGAGTCACACATTGGACTGTTGAAAGAACAGC
ATTCAATCGAAGTGACCAAGATTAATCATCAGCTGGATACAGTTGAGGAA
AAGTTGAATGTAGAGAAAACGAAGACAAAGGACATGTCTTCCAGGCATCT
CAGTGCTGAGCAAAGAATTGGTGAGTTGCAAGCATCAATAAATGAGCAAG
AGAAAAAGTATGAAAATCTGATAGAGGAAAAGTCTAAAGTGGAAGAAGAA
AAGGCATCAGTTGAGGCTGAAGGAGTGCTGTTGAAGGAAAATATCATGGC
GCTTGAAACAGAGCAGAAGAACATGAAAGATCAAATGTCACAACTACGCA
CCACGGTGGCGGTCCTGACAGATGCAAAAATACACGCAGAGGAACAGTTG
TCAATGCTTGAGAAAGAAAAGAAAGTAACAGGAGACGAAGTGAAAGTCCT
CACTAACACTACTGCTGCAAGGGATAAGGAAATCAAGAAATTGCAAGATG
ACTTGAAGAAGGCAGCTGAGCGCCAAAAAGAGGCAAAGAAGCAGGAGAAA
GAATTGAAACAGCAACTGAAGACTAAAGATGCCGAAGTTGACCAGACCTC
TGCAAAGCTTAAGAAAGTGCAGAGTGATCTTGAGGAGATTCAGACTATAA
TGGCTTCCTTGCAGAGAGACAATGAGGAATTAAAAGAAAAATTGAACGCA
GCAGATCTACAACGATCCACACTTCAGTCGTCACTTGATGAGGTCAACCA
AGAGAGGGTATCTTTAAACGACACATTGAAACAGTTAGAAGAAAGCCTTA
AGGCACAAGATAAAGAGGCAGTGGGGAAGATACATCAACAGCAGGAGAGT
ACCAAAGCCCTTCAGACCGAACTAGACAGCAACAAGAAGTCCATGGCTAA
ACTCGAAAACCGTGTAAAGTCACTAGAGAAACAAGTGGCTGAAAAGACAA
ACAAACTAAAAGATCTTCAGCAAGATAACAAAACCGTGAAGAAAGAGCTT
GGTATTCACCTTAAACTGTCAAATGGATTTGAAGAAAAGGCCAAGTCCCT
TGAGGAAGAGATCGCACAGGTGAAAAAGACAGCTGAAGACATAAAGATCG
AATTGTCCACCGCAAAAGATGAAGTACAACGTGTGACGACGGATAAAAAA
CAGGTTCAAGCACATTGTGAGCAGCAGATTATGGAAATGACGGCCACACT
GGAAAAGTACAAAGCCGAGAATCAGAAAATAGTCAACCAGAAAGACAAGG
AGATCGAGAAGATGAGGAAAGAGCACCAAACCTCCAAGAAACAGGATGTG
CAAGTAGCTGACTTGATGTCACAACTGCAAAGCGTGCAACAGCAGTTAGA
AGACGTTAAGAAGGAGAAAGACGAGATTGCGAAAGGACAAAAGGAGTACC
AACAGCAAGTCGACATGCTGAAGAAAACCATCGAAGATAAAGAAGGCCAG
TTGAAAGAACTCCGAACAGATCTTGAGAAAGCCAAAGCTGATGCTCTCTC
TCCTACAACGCCAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNTGTCACAACTACGCACCACGGTGGCGGTCCTGACAGATGCAAAAAT
ACACGCAGAGGAACAGTTGTCAATGCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000037:75206..80635-

>Blg02836.0 ID=Blg02836.0|Name=Blg02836.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=5430bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000037:75206..80635- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGGCTTGGGCAGCAGATGCACAGTGGGGAGCGCCTGACAAGCCTCCA
TTCTCGCCTTCAAAAGGAAGCAGAAAAGATCAACAAATGGAAACATCAGA
CAGAGATGCAAATCCAGCAGAGAGAAAGGAAGATCCAGGACACCCAGCAA
ACCATTGATTCACAACGCAAGTCCATTCTTGAGCTGCAGCTTCAGAATGA
GAATCTCAGCTCCAAGCTGCAGGAGGAGATAGATGGCCGTGTGGAGATCA
TGAAGAAGATCACTGCCACTCGAGACATGTGCTACCTGCTCAAAGATCAT
GCTGCTAATGTTGAGGAGAGGATGGGAAAGTGTGAAGCCAACCGAGATGA
GCTACAGTCCTTACAGCATGACACGGTGTTCCAACTCCAAGAGTTGACAT
CTAAATTCAACAACCTTCGCATCAATCATACTGAGGCAGAAAAAGTTCTC
GGAAACAAGGTGAAGGAAAGTGTGAGTGAGCTCAACCAGGTTAAGTGTGA
TTACCAAAATGAGAAGGTGAACATGGAGAAAAGGCTTGAAGGTTTGATAC
AGCAATGTTCTGAGAAAGAGATGGAAATTTCAAAGCTCACAGGTGCACTC
ACAGATAAGCAAGCTCAGCTCAGTGACCTGAAGCAACAGTGCAGCATGCT
GGAGGAACATGTTGCAAAGCTGGAAGATGAGGTCAAGTCTCTTCAAGATC
AGCTGCAAGAGGCAAGTGACAAGATCTTCAGCAAGGATAAGGAGATGGAG
AAGATCTCGGGAGAGTTGGCCAATACTGAGGCACAGCTGCAAAAAGTGTC
CAATGATTGTGAGCAACTTGAGTCACACATTGGACTGTTGAAAGAACAGC
ATTCAATCGAAGTGACCAAGATTAATCATCAGCTGGATACAGTTGAGGAA
AAGTTGAATGTAGAGAAAACGAAGACAAAGGACATGTCTTCCAGGCATCT
CAGTGCTGAGCAAAGAATTGGTGAGTTGCAAGCATCAATAAATGAGCAAG
AGAAAAAGTATGAAAATCTGATAGAGGAAAAGTCTAAAGTGGAAGAAGAA
AAGGCATCAGTTGAGGCTGAAGGAGTGCTGTTGAAGGAAAATATCATGGC
GCTTGAAACAGAGCAGAAGAACATGAAAGATCAAATGTCACAACTACGCA
CCACGGTGGCGGTCCTGACAGATGCAAAAATACACGCAGAGGAACAGTTG
TCAATGCTTGAGAAAGAAAAGAAAGTAACAGGAGACGAAGTGAAAGTCCT
CACTAACACTACTGCTGCAAGGGATAAGGAAATCAAGAAATTGCAAGATG
ACTTGAAGAAGGCAGCTGAGCGCCAAAAAGAGGCAAAGAAGCAGGAGAAA
GAATTGAAACAGCAACTGAAGACTAAAGATGCCGAAGTTGACCAGACCTC
TGCAAAGCTTAAGAAAGTGCAGAGTGATCTTGAGGAGATTCAGACTATAA
TGGCTTCCTTGCAGAGAGACAATGAGGAATTAAAAGAAAAATTGAACGCA
GCAGATCTACAACGATCCACACTTCAGTCGTCACTTGATGAGGTCAACCA
AGAGAGGGTATCTTTAAACGACACATTGAAACAGTTAGAAGAAAGCCTTA
AGGCACAAGATAAAGAGGCAGTGGGGAAGATACATCAACAGCAGGAGAGT
ACCAAAGCCCTTCAGACCGAACTAGACAGCAACAAGAAGTCCATGGCTAA
ACTCGAAAACCGTGTAAAGTCACTAGAGAAACAAGTGGCTGAAAAGACAA
ACAAACTAAAAGATCTTCAGCAAGATAACAAAACCGTGAAGAAAGAGCTT
GGTATTCACCTTAAACTGTCAAATGGATTTGAAGAAAAGGCCAAGTCCCT
TGAGGAAGAGATCGCACAGGTGAAAAAGACAGCTGAAGACATAAAGATCG
AATTGTCCACCGCAAAAGATGAAGTACAACGTGTGACGACGGATAAAAAA
CAGGTTCAAGCACATTGTGAGCAGCAGATTATGGAAATGACGGCCACACT
GGAAAAGTACAAAGCCGAGAATCAGAAAATAGTCAACCAGAAAGACAAGG
AGATCGAGAAGATGAGGAAAGAGCACCAAACCTCCAAGAAACAGGATGTG
CAAGTAGCTGACTTGATGTCACAACTGCAAAGCGTGCAACAGCAGTTAGA
AGACGTTAAGAAGGAGAAAGACGAGATTGCGAAAGGACAAAAGGAGTACC
AACAGCAAGTCGACATGCTGAAGAAAACCATCGAAGATAAAGAAGGCCAG
TTGAAAGAACTCCGAACAGATCTTGAGAAAGCCAAAGCTGATGCTCTCTC
TCCTACAACGCCAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNTGTCACAACTACGCACCACGGTGGCGGTCCTGACAGATGCAAAAAT
ACACGCAGAGGAACAGTTGTCAATGCTTGA

Gene-mRNA-Prot

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Blg02836.0-exon-Sc0000037-1570713199:75206..80635	Blg02836.0-exon-Sc0000037-1570713199:75206..80635	Branchiostoma lanceolatum	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Blg02836.0	Blg02836.0-protein	Branchiostoma lanceolatum	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
Sc0000037	genome	Sc0000037:75206..80635 -

Properties


Property Name	Value
GeneID	Blg02836

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Blg02836.0 (mRNA) - B. lanceolatum