Blg02465.33 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg02465.33
Unique NameBlg02465.33
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000329:157487..172163-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg02465.33 ID=Blg02465.33|Name=Blg02465.33|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14677bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000329:157487..172163- (Branchiostoma lanceolatum)
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GGGACGAGGACGAGCGACTCATCACCAGGCTGGAGAACACACAGTTCGAC GCAGCTAACGGTATCGACGGGGACGACGAGTTTGGGGGATCCCCCGCCGT CAACAACAGCTCATGGGGAAACCCACCGACATCCAACCAGGGGAAGGACC CCAGCCAGAGTCACCAGGAGGACCCCACCCACCAACCAGCCCACCAGGAC TAGTCCACTGTACAGTAGGGGTGGCGCGGTAGGTGGGAGGGATTCTCTTT GTCCTCAAGTGAACTGCTTAGTCTAACTGTCTTGGAATAACATAGATGTT GATCTGACCCTACCCGGTTCACATGGTGCATTCTCCAACTGTCCGTCTTT AACCAATGTCTTGTATTGTGACAGAGGAGCACCTTTGAGGGAAGGTAGCT AGAGTGTTCTTCCAAGACTGTTATGCTTTGTCCTCCTCCTTGTACATCCA AACCTCTCCTCTATCTGCAAAGGTAGGGGATCTCCCAGTCTAACATCATT GAGACCATCAGTATGGTAATGTAGGATAGATCACCATAGGTTTCCATGGT AACTCAGACATTACCATGGAGACCATCACTATGGTTACATAGGGTAGGGT GTTCAGTGCATTCCAGTTGACTACCACTAAACAGCAATTGCAGAATATCT TTGTCACAAACAGTACAGTTATACCCCAGCAGCCTTTTTAATGACAACTT CTCTTTTGAAATAAAAATGTGGTGTTTGCCTCCACATTTTCAGTTTTGTT CATCTGAGATAAAGTTGTTTAAGTTATACTAGCATTTAAGAAACACGGAT GATAATTTCAATATATTTATGAATATATCATTTTTATTAATCAGTAGCTT GACTCTTGAATATGTGTTTTTTTATAGTCAATATTCATGAAAATGATGGT ATGTGGCATATTTACTTTATATGTAATTTCTTACTGATTTTTTTGTGGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000329:157487..172163-

>Blg02465.33 ID=Blg02465.33|Name=Blg02465.33|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=783bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000329:157487..172163- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGACCACTCACCATGGCAAACCCACCTTTACAAAGGTGTGTACAGATGG
AAGGCTGATGTTGGAGTTCACCTACGACGACCTGATGAGAATTAAGAACT
GGCACTTTGCCATCAGACAGCACACAGAGATGATCCCCCGCAGTGTTATA
GCCATGCACGACCCTGCCATGTTGGAACAGCTGTCGAAGAACATCACACG
ACAGGGTCTCACCAGCTTCACACTCAACTATCTCAGGCTTTGTGTGATCC
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CCGCGGGACTGTCTCAAGACAACCCTGTTCCAGAAGTGGCAGCGCATGGT
CGCTCCGCCAGCAAACACAGAACGTCCTCCCAGCAAACGGAGAAAGCGGA
AGGCGTCTCAGAGCGGCCAGGGCAGTGGCAACAGCAGTAACAACCAGTCA
GGGGGAGGGGGATCCAAGAAGAAGTTCCCTACAGCAGGGCGCAAGCGATC
TGCAGAAAGCGACCTGGTCCTTCCTTTGGACGAGGACGTGATGGTAGTGG
GAGAACCTTCGCTGATGGGGGGAGAGTTTGGGGACGAGGACGAGCGACTC
ATCACCAGGCTGGAGAACACACAGTTCGACGCAGCTAACGGTATCGACGG
GGACGACGAGTTTGGGGGATCCCCCGCCGTCAACAACAGCTCATGGGGAA
ACCCACCGACATCCAACCAGGGGAAGGACCCCAGCCAGAGTCACCAGGAG
GACCCCACCCACCAACCAGCCCACCAGGACTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02465.33Blg02465.33-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:171034..172163Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:171034..172163Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:167744..167916Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:167744..167916Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:167123..167245Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:167123..167245Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:166658..166735Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:166658..166735Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:166048..166171Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:166048..166171Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:165433..165560Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:165433..165560Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:163990..164034Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:163990..164034Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:159504..161759Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:159504..161759Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:157487..159266Blg02465.33-exon-Sc0000329-1570713199:157487..159266Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000329genomeSc0000329:157487..172163 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg02465