Blg01944.6 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01944.6
Unique NameBlg01944.6
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000487:61854..73005+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01944.6 ID=Blg01944.6|Name=Blg01944.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11152bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:61854..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
CCTGAATCTGCCACGTATTTTTGCCGATTGCAAAGGATCATGTGATGATG CCATTGTTTACAGACTGTGATTGACATGAGTTGTCATGGTTTTACGTTCT GGTTCAGAGATATTACTAAGAAAAATCCGATAAGAGTCAACTTCGGGAGT AAACATATCGCATCGAACTACCTATCTCGCTAAGATATAACGAAAAAATA TACCCATATTTTTATGCAACGAAATTCATAATTCTAGCTACCTTTAAATC ATCATTTTGAACCGCCCGTTTTTTTTCTAAGCGCTGTTCCATCCGCTTGT CCCCTCCCCATCCGTGTAGCGCCCGCACTTACACACCCTCACGAGCAAGA ACTTCTTCCCCCCTACCGTGTATTTCCGCCATCTACAGTGCCCGTAGTGT ATCTCGTACCCGTCCATGTTCTGTCCGTACGTGTTGAGAAGATACCGACG GTCCGCGAGCTTCCCGCAGTAGCACACGCGTACAAGATGCCTTAGGAAAA ATATCTGCCGCCCAAACTCGTCTTCTCTCCACTTCGAGATCATTTCGTTG GTGGCGTACTTACATCTTCTGTCCCGGTGAGTTTCTTCGCTGTCTTCTTC GTCTTCTGTGGCAGAGTGGCTTGGTTCGTTCCAAGCGTACGCCATTTTCC GTTAAGGGTACGTATTCAGTGCCCGATTAGACGACCAAAATGTTAATATA ATTACATTTCCATGTCCTACCATCATGCCTTCTTTCTTATCTTTTTTAAA GGAAAGACGCCATATTTGTGACTCTAATCTATGTTACTTAAGTATCTATG TTAGACATCCACACTGTTTACCGCCATTTTAGTAACCATAAAGAGAAGCG AACGAGTCAGAAATATAGAATTTAATTGTCCCCGCCGCGCAAAGAAAAAT CGGATTGTAAGCTAATTTCCCCTCAACGAAATATCCCGGTACAAACAACA 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TTTGTCCTCTCCCTATAGCGCTAATAATATTTTGCCAACCATATGTACCT ATCCCTCCATGTATATGTGCGGGGTTAGTGTATGCTGCAAGCATGCAAAC AAATACTCTCCGCCACCAAAATAGTCCCCCAATACATTCGATATCAGTTA TCAATAGAAAATGACTTTTATTTCTGAATGAATGTTCATGATTTTCACTC AATACCCGTCAGCGCTTGCCATATTTGTGACCCTACGATATATTCAATTT AATAACAACGCCACCCTTTCTAATATCCTAGCCTTCCTCCGTCCAGTTTT GCCCAACTCATTTCTATTAATGGCGGGATATTTTCTACATATTCATGTAT CCAGTCTGTAGGTGTTGTTGTTTCTAGTTCCACCATCGTGGTTCCGAGGT TTGTAGCAGAAACCCTTGGCCTCCCGCCTAGTCAGACCATAGTTTGCCTC CGTCGGCTGAAACCTTCACTCGCCCCGCCGGCGAGNATAATACATGTGTG ACGTTGTTCCCAACACTGCCCCTGTACAATATTACAAAACTGTCATGGCG CCCGCCTTCCTTACAGTTACCCGCCCGCCATATTCAGAAGCCGTTCTGGC GCCCGCCGTTTTCCCTTTCCGTCGCTGACAACGTTCCCGCCCCATGTACA TGTACCCACTCCGCTATAGAACGCCCGTGTTTTTCACCGCAACTGGCCGC GATACATGTAAGTACGCAGTCTGCTACAATTGTACGTTTGTATGTCCAAC CATTACATCCACTGAAACGACTCTATATGTGGTGTACAGTATTTGTTCTA TTTTACCTCAGTTTACCGTCTTAATAAGGATTTGTTCATTTTGTGCCGTT TAGATGACAAATTCTGGACCCCATGTAACAAATACTTCACTACACGGGCA CTGTTGTGGCGCAATCTCTATTCTTTGTAGCGAAAACAGAAAACCGGCAG TCTATTTCAAGTAAAACTGTTTATTTTGGGTAAATATCGTTCTTCCAACC CGTTCAAAATGTCAGAAAACGTTGGCGAACCATCTTTCTACATGCAGCTA GCCTTCCAAAGCCTCGCCGCTCACATTGTTTCCTTTAAATGTTTTGCATC CCACCTTAATAATTCCAGCTGCCTCGCCATAAGAAATACCACAGTATACC TTTCGTGCAAGTTTTTCTGTCACTATTTCTGCTTTATTTCTTGACCAAAC CGCGAAATTCCGGCTGGTGCTGTATTTTTGACCCGACGCCATTTCTACTC CCCGAATTTTGTCTTTCTGTGTCTGCTAAATATGTAACACCCCAAAAGAT GGCCGGTCGCTAGCCCTGTTTAGTACAAGACACCGCCATCTTTGTCCTCT CCCTATAGCGCTAATAATATTTTGCCAACCATATGTACCTATCCCTCCAT GTATATGTGCGGGGTTAGTGTATGCTGCAAGCATGCAAACAAATACTCTC CGCCACCAAAATAGTCCCCCAATACATTCGATATCAGTTATCAATAGAAA ATGACTTTTATTTCTGAATGAATGTTCATGATTTTCACTCAATACCCGTC AGCGCTTGCCATATTTGTGACCCTACGATATATTCAATTTAATAACAACG CCACCCTTTCTAATATCCTAGCCTTCCTCCGTCCAGTTTTGCCCAACTCA TTTCTATTAATGGCGGGATATTTTCTACATATTCATGTATCCAGTCTGTA GGTGTTGTTGTTTCTAGTTCCACCATCGTGGTTCCGAGGTTTGTAGCAGA AACCCTTGGCCTCCCGCCTAGTCAGACCATAGTTTGCCTCCGTCGGCTGA AACCTTCACTCGCCCCGCCGGCGAGCCGGTCTGCCCACTCCTGTCACGTA GTCCGCAAATCCCCCGATCACGCATTCACCTGTAACAGCCGTGGACAGAG CCCCACCGCTACGTGCCGCCCTATAATTGTGGTAAGACTCTTGTATACTT CTGTGTTCTTTCCCCAGTCGGCACCTGGCGCCATTATTTAATACAAAAGC CGAGCTACTTGTTCCCCTTCCTCTGCGATTGTCTGAACTAGCTAGCTTGT TAACAAATAGGATATTGTCGCGACCAATATTTGGAGACAGGTATGTTTCG TACGTTTCCTTTTGACAAGGCCGGCTAATCTTTCAACATGTACTATCTCT TAGATATTTCTTCACTCACACACACGGCCTAGTGTCTGTAAAAATTCGTG CACACTGTGTGCCTATAGAGTCCTGAAAACCTTAGCAAATACGTGCACAT ATGTTTTAGGTCGGGCCTGCGGTCAGAACATGGTTCTGTTTCAAACATGT CTTTATTACATTCGGATATGCATGATCATATACTGTACTGATTGTAATAA CAGGAACACTTCTTTATTCTGGGACTTTCACTGCATTTAATTCTGTCCCA GTGACACTTCCAGATAATATATCTAGCCATAGCTAACAGTTTTAGACATA TACAACAAGACGTCATTATATTGCTTTCCCCACTTGCCGACCCAGCTTCT ACCAAGGCGTGGATAATATATAACAGTGCCTCAGCGGACAGCGTAGGCGG GATAGTTAGGGCATGTATGAGCGTGCTTTCTATTCACCTAACATGTCCAT CATACGTACACCATGTCTAAATCTGTATCCCCAATACTCCTGTGCCAAAT GCACTCAGGCACCATTACCTTTTGTTGTACATTTCAACTAGGGTCATTCT CAGTGTCTTGACACAACTCAGAGTTGCCTTTTAGTAATGTTTGACATGCT CTGCAGCATGTAGGCCCCCAGTCTAGGGTGTTTGTACATTCTTTTCATAG ACCATTTGATATACAGCCTTGCTGATACAAAATACAAAATGTACTGTTTA ACTAACATAACCGTAATAAGTGTATATTTTGTATAAGATAACACTTAGGT AAAGTATGTACGTATGTACCCCCCTTCCCCTCTGTTGTTAGGTAGTGCCC GTAATACCTTAAATGCCCTTCCGTATTTTGTATGTGCTATGTCCTCTCGC ACTCAAGCTAATTACATTTGTCACATGGATCCTTTTAAAGGCTACTCCCT TAAGCGTTTCCACAATCGGTTCCACCATCTACAATCTATAGTGACATGAT AAAATCAACGTGTCACACAAGGAAATATACAGGGCGATCTCTTTCTGCAA TGTATTACATATGACATGAGTTTGACAAAAAATCAGGTCCCAAACAGTTA ATGTATTGAGTACCCATGCCCTTTCAAAACATGGCATTTTGTAGCATGTA TACATATATATTGTATGAATTGTCATGAATTCAAACTGAGCCTGCTATAT AACATATTAGATACACACTTGCAGGTCTACCGTGTTAATAAAAATTTTCT CAGATGCAACACTGACGTCTGTGTAAGACATACTTTCCTTCAGATATGAC TATATCCAGACTGTATAATGGTCTTGTATCAGCTATCTCAGCCGGTACAA AAGTGTTTTATTCTGCAAGGTTGTTTCAGCCTTTCACGACTCAGTAGCGC TGAAAATCAATACGAGTGGGAGGGCTGAGTGCTCGGGGCCCCCTTTCAAG GGGATAAACTTTGGACTCTGACAGATACTGTTTTCAACTTGTAGGCTTGT AATGAAAATTTTGAGGCCACAATTTTGTCCTGGATGCTAGACCGACAGGC TAATAGTGAAGAACGTTATGATTTTGGTGCCTAAAAGATGAAAATATTTC TGTGCATTTCGTCCCTAAAGAGTGCCCTATGTCCTTGGTCTTGTGTTAGA ACCAGAGTTGGTGTTTGTTTTCAATCTGTTCTATAACACAAGCCAGCTGT GCAGTGAGTCGCTCTTGGGTCTTGCTTCGTCCATATCCAGACGGACAAGG TCTTTTTCGACGCCACATCCTTATTCATGGACAAAATAACTTAAAAGGCA GTGCGTGTTTGTACGCCCTACGCAATCCGCCATGCAACGTTGGGGCAATT TTGTCACCTATAGCGTGCATCTAGCTCGTTGAAAGCCTTGCCTTATCCGT AAGCCCGCCACTTATGCATAACCCAGAGAGGGGCCCCACGATATCCGACA CGGAGTAGATTGAATCCTGGCATTTTGTTTAGGCTTCTCCCAGCCCTTTG GGGTGACCATGGTACCTGATATTGATACAGGCCAGGCTTCGTCTGCCTTT CAAGCAGTAAATGCTCCTGTTGGTAAGGATAATAAAGGAAGCAGTGACAG GTCTGTATGGGTGAGAAATTTACACTCAATGTATGCCTCGACCCATTAAT AGGCCCTATTATTTCACCCGGCTTTACACCACTGAGTTTTGTCAAAGGAC AGTGTTTTTCTGACAAACATGGCTACCGTTAACAATTAACACATAAACAC CTCAAATATAGATATGTATACTGGTCACTCTCAGTCTGCAGTGCCCATTT AGATGCAGTGTCCATCGCATTTTCAGTTTGACCACTGTCCCTCGGGTAAT CTATGGACGATGTCCACTGACACATCGATCCGTGTCTGTTACGTGCCGTC TCCTTGGTGATAGTTCCTCATACCTGTCGAACACGTTAGATGGTTTGATT GATCGTCGAAATGCTACAACGGTAGTAGACAGGTGACTAGCACCGAAGGC TATAGAATTTATCTTTTTATCTCTCAAAAATCTTGAAAGAATTTTCGCAT TTCGTGGATTGGTCGCCAATCGACGACATGTCCGACAATACGTCTGTGCA AAAGACGAGAACACGTCGTCGCTGGAAACGATAAAGTTGTTAACAGCTTT TTCGGCTTTAGAGAAGAGAAGTTTAGTGCTGAATAGTAGAAACACCCTGT GGGGCCCCGCTGCAACATGCCTCACCTATCCTGACCTTTCTGTTGTTGGA ATAAAACACCTTTGTTTCTCGATAGGATTTAGACCACTCCCACTGCCACG TATCCTGGTCTACATTCTTTGGCGATGTGTTCATCGGTGTTTTTATCAGC TATTTTTGTCGACTTTGGTAATTTCTAAACGTCACTGCTGGTTTCTATTT GTTCAGTAAGAGCTACGAAACTTCCCGTGGCTGAAAACAGGGGTGGGGGA TTGCCACTACGTCATACGAAACTTCTGGAAGATTCGGTTAAGACCGGCTG GAACAGGTTTAAACCGGCGTCGACAGGTTAGGTTATGGCTCAAGTATTTA GAGGAACCACGCGGCGTCAGTGGTACGAATGCTTCTGTGACATTGTAAAA TGGCAGCCAGTCGTTAATCAATCAATGCGTCTGAAAAGAAGGCATTGAGC ACCATTAATTGAGGCGTATAGTCTTTCGCGTCATCGGCCAGCTTTACCAT TGACCAGTGATGACCTTTGACCTCATTAGCATATGTCAACAACGCCAGGT AGTCACAGTAGCCCCCCAGGATTCAAAATCCTGACAAGACTAATTACCAT GACCGCGCAAGGAGGGACTTTCCATCGCATGATCGTGAGATGACCTCTGT CCTTGGTGCTGATTGGTTGTTAGTGCATAACCTCCGGCCGTATGACCATG TATGGTGGTGAAAGCGCCCACCTACTCGACCCTTGTCAAGGCTGGATTGA AGAGATTCCGTGTCAAGGATAATGTTTACAGTACCGTTCATGCCCTTTGA TGGTTGCCATACAGGGGAACTCAAGCGGTGGTGGTAAGACGAGCCGAGAG TTGGGGTGAGTTTGGGGTCTGTGTCGATTGAAGTTTTCGGTGTGTAGTCT AGGCTTGCTGGACTGATATACTGACTTATAAACATAGGCGAGGACTTCTT CTAACGCCAAGGCATTTCACGTATGTTGTAGTTATTTCAACACAGCTAAG GCTTCTATTATATTTTGTGTCTCTTTTAGATTATTGACCAGAAGAACAAT ATTGTGTTTAATGTGTCGTTATCGCCCCCCCCCCCTACAAGGGGTGCTGA ATACAAAAGACACAGTGGCACTGGTTACGTCTGAAAGCTAAGAAAAGAAA AAGTCGTCTTCAGGTATACCTTGCCTTAAAAGCTAAAAGCTTTCGTGTCT TAAAAATTGAACATTTTTCTTGTTGTTCGCGATACATTAATTGTAGTAGG TTGGACGTAAAAATCGTACTGTACTGACCAGGTATAGTCTTTATTCAGGT GTGTTTACCTATGTGGCTTAGTTGTATTAAGAACAGGTGTGCACAGCTGT GCTTGGTCTAAAATTGTCCCTGTATTGAGGCGAGTTCAGAGGTCGCTTTT CTCAAGGGTCTAGCAATACGTACCGTAAGTTATCTAATACAAGCGACTGT CTCCAGATCAAAGTTTCTTGTATGCTCTGCAAATATAAGGTATTTGTACA GTGCTTGTTATCTAAGAGTATTTGTTTGCTAGCATTCCTTACTAGCACAT CTTGAAATCAACTGTGATTTTAGAAGGGCAGAATTAGATTGTTGAATATG TTGTATGATTTACAGTAACACGTTTTTTGCTGCTCTTTACACAGTGTCGG GGCTCAGGGCCACTACCGTAAATTGTTGACACCGAATCCTTTACACTAGG TTAGAGCTAAGCCTAAGTGATCCTTCGACAAAATTGCGGTCAGTGCCTTT TTGCAGCAGTGAGTGTAGAGTTGCTGTTTTTAACGAGTATGCTAAGAGCA AGGCCAGATACCACTTATTCAGTGGTCACCGTGTAACAAGACCCGAAGGA CAAAGTTGTTGGCTAAATGGGTAGGTCCAGAACAACCCCCTAAGTCAGAA ATCTAAGTCATGAATAAGGATGAGGACCCAGTAAGAGTGAAGGCTAACTG ACCCAATTCTTAATTCCCTACCTTTTTTTTAGAACTGAATGGTGTTGAAT TTCAATGTGATCAAATTTCTCTCCGCTGGCAGCTTTTCTAGACAAAAATA TGTAATTTTGCAGTCATGCACTAGTTAATCATTAGGATTTTTTCCCAGGT TTTCGGGTTATAAGGTTGGGTCGGCACTATCGAAGCTGGAATATTGTAAA CATTATCCCTGTTATATGTTTACGGAACTACGCTCTGTATAATAATATAT CAAAGCGTTGTTCTGCCAATTAGTGTTGGCGTTTTTATAAAATGTTTCCA TATAAGGCCCGACGACTGTGTTCCTGTTTTAGACAGGCATTGGTTCCTCT TCTCCAGACAGAAATAATCGTTACGTAGTCTGCTTCCCCCTTTCGTGTTT CAAGTTCCTCTTTGTGTAAACATATCGTAGCGGTTTTAGTCCATCTGAAT TTACTCGAGTGAAGGTCTGCTCAGCGCAGTGTAATAGGTAATTTTACTGT AATTCTAAGGTATTTACATACTATTGATTCGTCAATAGCTCAACGTACCT TCTGGTTTTTTTTCAACCATCAGTCGACTGTTACGCTCATCAGCTTTCTG TTTGCTGCTTAAAATGTTCTTTCAAGACTTAGTCCTACGTTTCTAATGGT CAGGAACATTATTGTTGCCACAGATTGAAGCCACTGTTCCACGATGATTG GACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGACCGATGAT GACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCCAGCTGGC CCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAAAGGAGGC CACGGAAGAAAGGTAACACACCCTTTCCATGAGAAACTGCGACCGTTGAA CGACCGCTGAGCGACCACTGGGTGACTAACAAAGTGACTCAAATAATTTC ATAAACAAATAACAAATCTTTTTTTACGTATATGTTTTGCTGTCTTTTAA ATCGTACTTTGATATCTTGCATCACATTCCTCTTATAAAATCAAGGGTTA TACCAAGCTTATTTCGGTCGGCCAACGGTTTGTCGCCTCGATATGAATGT TAATTTAGTGTAGTATTAACATTGTTCTGTTTGCCAGTTTGGGGCCATAC GGCAACATTCGTATGTGCAGTCTGAAGTGCCTCATGTAAGCAGATGGTGT ATGCCTTTTCGTATGACATCATATCTGACACGACAGTGCTGTGTTTGGGC AGTAGCGAGTACTAGTGCTGAACTATTGTTTAATTACAGTGCTAATTATG TTTTCATTAAATCTCAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAAAG GCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAGAT TCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAACATTAGAAACATATGGCACT GTAAATATTTGTCAAATTATGTATTTTGATACTTTTATACAACCAAGTAT ACTGTATATTCAGCTATTCTAATGAGGAAACTTTACTAAAATATGGAAGA GTTGATGTTATCTTCACTGCAGTTTGAATCGATTCACCATTGCAATATTA ATGTGTCTAAAACAACTTTACATTGATACAGATATGATATTTTTCTTCCT CGCGATACTTTATCTTGATAGCCAGCTCAACAGGTCCTCCCAATTCAATA TGGCGGTAAAAATAGCGCAGCCTTGAAATCCACGTCATCAGGGGTTAGCT GCACCGGCTAATCAAACGGCGACAGTTGAACTATTAACCGTTAACGCAAT CGATATCGATAGTGCCCGGTACCGCCAAGCGGGGCGATCTAACTTGCAGT GTAATTCTGTTAGCAAAGACCCGGACCGGCTGTTAGCTTGTGTTATATAG ACTATTCGCTAGAGGAATTGTTATCTATGTAGAGGTTGATTGCTGATGAT CTTGTAGGGAACTACATGTCCATAGAAATGCTTAGTGTGGGACTAGTACA GTCATGCTCCCTGGCTGATCGCAGTCGGTAGAATTGTATTTACAGAGAAA TACATAATCATGATGTGTTCTGTTGTACAGTTTATTCTACATTGTGTATT AGCTATAGATTTAAGTTCAATATCATAGATACAATTAAAGCACTCATAAT GTCTTCAAAGTCTGACATGATCTTTGATGCTTCGATGTATACGAGTAAAT ACGAGTGAATAAAAATATGCGAGGTTTTGTCAAATTCACGAGTTTGTCCC TGTATATTCCCCCTTCAGTTGCAGGATTGTTTTGATGTAGATATTAATTA GAAAAGTATCATCGTTTCTTCTTGTTTCCCATTCATACAACATATAACAG TAGCAGATACAAGACCTGAAACACGACTTCCTAAAAAAGATGGGAACTGA AACCTGGCATTGGTTTTTAGTACGAGGAGGGGAGACTATACCAGATGCTT TCGTAAAATAAAGGGATGGAAATATTTCCTATTATTATGATTTTGTGCGC CC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:61854..73005+

>Blg01944.6 ID=Blg01944.6|Name=Blg01944.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:61854..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:61854..62429Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:61854..62429Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Blg01944.6-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.6Blg01944.6-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000487genomeSc0000487:61854..73005 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01944