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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000487:62048..72119+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg01944.2 ID=Blg01944.2|Name=Blg01944.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10072bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:62048..72119+ (Branchiostoma lanceolatum)
AAAATATACCCATATTTTTATGCAACGAAATTCATAATTCTAGCTACCTT
TAAATCATCATTTTGAACCGCCCGTTTTTTTTCTAAGCGCTGTTCCATCC
GCTTGTCCCCTCCCCATCCGTGTAGCGCCCGCACTTACACACCCTCACGA
GCAAGAACTTCTTCCCCCCTACCGTGTATTTCCGCCATCTACAGTGCCCG
TAGTGTATCTCGTACCCGTCCATGTTCTGTCCGTACGTGTTGAGAAGATA
CCGACGGTCCGCGAGCTTCCCGCAGTAGCACACGCGTACAAGATGCCTTA
GGAAAAATATCTGCCGCCCAAACTCGTCTTCTCTCCACTTCGAGATCATT
TCGTTGGTGGCGTACTTACATCTTCTGTCCCGGTGAGTTTCTTCGCTGTC
TTCTTCGTCTTCTGTGGCAGAGTGGCTTGGTTCGTTCCAAGCGTACGCCA
TTTTCCGTTAAGGGTACGTATTCAGTGCCCGATTAGACGACCAAAATGTT
AATATAATTACATTTCCATGTCCTACCATCATGCCTTCTTTCTTATCTTT
TTTAAAGGAAAGACGCCATATTTGTGACTCTAATCTATGTTACTTAAGTA
TCTATGTTAGACATCCACACTGTTTACCGCCATTTTAGTAACCATAAAGA
GAAGCGAACGAGTCAGAAATATAGAATTTAATTGTCCCCGCCGCGCAAAG
AAAAATCGGATTGTAAGCTAATTTCCCCTCAACGAAATATCCCGGTACAA
ACAACAGATTCAAATTGTTATAGCATGTATTCACTGACAATACTATAGTT
GATAATTTGGCGAAAAATTTGAACGAAATCTACAGGCGAACATTTACAGT
GGATAATACATGTGTGACGTTGTTCCCAACACTGCCCCTGTACAATATTA
CAAAACTGTCATGGCGCCCGCCTTCCTTACAGTTACCCGCCCGCCATATT
CAGAAGCCGTTCTGGCGCCCGCCGTTTTCCCTTTCCGTCGCTGACAACGT
TCCCGCCCCATGTACATGTACCCACTCCGCTATAGAACGCCCGTGTTTTT
CACCGCAACTGGCCGCGATACATGTAAGTACGCAGTCTGCTACAATTGTA
CGTTTGTATGTCCAACCATTACATCCACTGAAACGACTCTATATGTGGTG
TACAGTATTTGTTCTATTTTACCTCAGTTTACCGTCTTAATAAGGATTTG
TTCATTTTGTGCCGTTTAGATGACAAATTCTGGACCCCATGTAACAAATA
CTTCACTACACGGGCACTGTTGTGGCGCAATCTCTATTCTTTGTAGCGAA
AACAGAAAACCGGCAGTCTATTTCAAGTAAAACTGTTTATTTTGGGTAAA
TATCGTTCTTCCAACCCGTTCAAAATGTCAGAAAACGTTGGCGAACCATC
TTTCTACATGCAGCTAGCCTTCCAAAGCCTCGCCGCTCACATTGTTTCCT
TTAAATGTTTTGCATCCCACCTTAATAATTCCAGCTGCCTCGCCATAAGA
AATACCACAGTATACCTTTCGTGCAAGTTTTTCTGTCACTATTTCTGCTT
TATTTCTTGACCAAACCGCGAAATTCCGGCTGGTGCTGTATTTTTGACCC
GACGCCATTTCTACTCCCCGAATTTTGTCTTTCTGTGTCTGCTAAATATG
TAACACCCCAAAAGATGGCCGGTCGCTAGCCCTGTTTAGTACAAGACACC
GCCATCTTTGTCCTCTCCCTATAGCGCTAATAATATTTTGCCAACCATAT
GTACCTATCCCTCCATGTATATGTGCGGGGTTAGTGTATGCTGCAAGCAT
GCAAACAAATACTCTCCGCCACCAAAATAGTCCCCCAATACATTCGATAT
CAGTTATCAATAGAAAATGACTTTTATTTCTGAATGAATGTTCATGATTT
TCACTCAATACCCGTCAGCGCTTGCCATATTTGTGACCCTACGATATATT
CAATTTAATAACAACGCCACCCTTTCTAATATCCTAGCCTTCCTCCGTCC
AGTTTTGCCCAACTCATTTCTATTAATGGCGGGATATTTTCTACATATTC
ATGTATCCAGTCTGTAGGTGTTGTTGTTTCTAGTTCCACCATCGTGGTTC
CGAGGTTTGTAGCAGAAACCCTTGGCCTCCCGCCTAGTCAGACCATAGTT
TGCCTCCGTCGGCTGAAACCTTCACTCGCCCCGCCGGCGAGNATAATACA
TGTGTGACGTTGTTCCCAACACTGCCCCTGTACAATATTACAAAACTGTC
ATGGCGCCCGCCTTCCTTACAGTTACCCGCCCGCCATATTCAGAAGCCGT
TCTGGCGCCCGCCGTTTTCCCTTTCCGTCGCTGACAACGTTCCCGCCCCA
TGTACATGTACCCACTCCGCTATAGAACGCCCGTGTTTTTCACCGCAACT
GGCCGCGATACATGTAAGTACGCAGTCTGCTACAATTGTACGTTTGTATG
TCCAACCATTACATCCACTGAAACGACTCTATATGTGGTGTACAGTATTT
GTTCTATTTTACCTCAGTTTACCGTCTTAATAAGGATTTGTTCATTTTGT
GCCGTTTAGATGACAAATTCTGGACCCCATGTAACAAATACTTCACTACA
CGGGCACTGTTGTGGCGCAATCTCTATTCTTTGTAGCGAAAACAGAAAAC
CGGCAGTCTATTTCAAGTAAAACTGTTTATTTTGGGTAAATATCGTTCTT
CCAACCCGTTCAAAATGTCAGAAAACGTTGGCGAACCATCTTTCTACATG
CAGCTAGCCTTCCAAAGCCTCGCCGCTCACATTGTTTCCTTTAAATGTTT
TGCATCCCACCTTAATAATTCCAGCTGCCTCGCCATAAGAAATACCACAG
TATACCTTTCGTGCAAGTTTTTCTGTCACTATTTCTGCTTTATTTCTTGA
CCAAACCGCGAAATTCCGGCTGGTGCTGTATTTTTGACCCGACGCCATTT
CTACTCCCCGAATTTTGTCTTTCTGTGTCTGCTAAATATGTAACACCCCA
AAAGATGGCCGGTCGCTAGCCCTGTTTAGTACAAGACACCGCCATCTTTG
TCCTCTCCCTATAGCGCTAATAATATTTTGCCAACCATATGTACCTATCC
CTCCATGTATATGTGCGGGGTTAGTGTATGCTGCAAGCATGCAAACAAAT
ACTCTCCGCCACCAAAATAGTCCCCCAATACATTCGATATCAGTTATCAA
TAGAAAATGACTTTTATTTCTGAATGAATGTTCATGATTTTCACTCAATA
CCCGTCAGCGCTTGCCATATTTGTGACCCTACGATATATTCAATTTAATA
ACAACGCCACCCTTTCTAATATCCTAGCCTTCCTCCGTCCAGTTTTGCCC
AACTCATTTCTATTAATGGCGGGATATTTTCTACATATTCATGTATCCAG
TCTGTAGGTGTTGTTGTTTCTAGTTCCACCATCGTGGTTCCGAGGTTTGT
AGCAGAAACCCTTGGCCTCCCGCCTAGTCAGACCATAGTTTGCCTCCGTC
GGCTGAAACCTTCACTCGCCCCGCCGGCGAGCCGGTCTGCCCACTCCTGT
CACGTAGTCCGCAAATCCCCCGATCACGCATTCACCTGTAACAGCCGTGG
ACAGAGCCCCACCGCTACGTGCCGCCCTATAATTGTGGTAAGACTCTTGT
ATACTTCTGTGTTCTTTCCCCAGTCGGCACCTGGCGCCATTATTTAATAC
AAAAGCCGAGCTACTTGTTCCCCTTCCTCTGCGATTGTCTGAACTAGCTA
GCTTGTTAACAAATAGGATATTGTCGCGACCAATATTTGGAGACAGGTAT
GTTTCGTACGTTTCCTTTTGACAAGGCCGGCTAATCTTTCAACATGTACT
ATCTCTTAGATATTTCTTCACTCACACACACGGCCTAGTGTCTGTAAAAA
TTCGTGCACACTGTGTGCCTATAGAGTCCTGAAAACCTTAGCAAATACGT
GCACATATGTTTTAGGTCGGGCCTGCGGTCAGAACATGGTTCTGTTTCAA
ACATGTCTTTATTACATTCGGATATGCATGATCATATACTGTACTGATTG
TAATAACAGGAACACTTCTTTATTCTGGGACTTTCACTGCATTTAATTCT
GTCCCAGTGACACTTCCAGATAATATATCTAGCCATAGCTAACAGTTTTA
GACATATACAACAAGACGTCATTATATTGCTTTCCCCACTTGCCGACCCA
GCTTCTACCAAGGCGTGGATAATATATAACAGTGCCTCAGCGGACAGCGT
AGGCGGGATAGTTAGGGCATGTATGAGCGTGCTTTCTATTCACCTAACAT
GTCCATCATACGTACACCATGTCTAAATCTGTATCCCCAATACTCCTGTG
CCAAATGCACTCAGGCACCATTACCTTTTGTTGTACATTTCAACTAGGGT
CATTCTCAGTGTCTTGACACAACTCAGAGTTGCCTTTTAGTAATGTTTGA
CATGCTCTGCAGCATGTAGGCCCCCAGTCTAGGGTGTTTGTACATTCTTT
TCATAGACCATTTGATATACAGCCTTGCTGATACAAAATACAAAATGTAC
TGTTTAACTAACATAACCGTAATAAGTGTATATTTTGTATAAGATAACAC
TTAGGTAAAGTATGTACGTATGTACCCCCCTTCCCCTCTGTTGTTAGGTA
GTGCCCGTAATACCTTAAATGCCCTTCCGTATTTTGTATGTGCTATGTCC
TCTCGCACTCAAGCTAATTACATTTGTCACATGGATCCTTTTAAAGGCTA
CTCCCTTAAGCGTTTCCACAATCGGTTCCACCATCTACAATCTATAGTGA
CATGATAAAATCAACGTGTCACACAAGGAAATATACAGGGCGATCTCTTT
CTGCAATGTATTACATATGACATGAGTTTGACAAAAAATCAGGTCCCAAA
CAGTTAATGTATTGAGTACCCATGCCCTTTCAAAACATGGCATTTTGTAG
CATGTATACATATATATTGTATGAATTGTCATGAATTCAAACTGAGCCTG
CTATATAACATATTAGATACACACTTGCAGGTCTACCGTGTTAATAAAAA
TTTTCTCAGATGCAACACTGACGTCTGTGTAAGACATACTTTCCTTCAGA
TATGACTATATCCAGACTGTATAATGGTCTTGTATCAGCTATCTCAGCCG
GTACAAAAGTGTTTTATTCTGCAAGGTTGTTTCAGCCTTTCACGACTCAG
TAGCGCTGAAAATCAATACGAGTGGGAGGGCTGAGTGCTCGGGGCCCCCT
TTCAAGGGGATAAACTTTGGACTCTGACAGATACTGTTTTCAACTTGTAG
GCTTGTAATGAAAATTTTGAGGCCACAATTTTGTCCTGGATGCTAGACCG
ACAGGCTAATAGTGAAGAACGTTATGATTTTGGTGCCTAAAAGATGAAAA
TATTTCTGTGCATTTCGTCCCTAAAGAGTGCCCTATGTCCTTGGTCTTGT
GTTAGAACCAGAGTTGGTGTTTGTTTTCAATCTGTTCTATAACACAAGCC
AGCTGTGCAGTGAGTCGCTCTTGGGTCTTGCTTCGTCCATATCCAGACGG
ACAAGGTCTTTTTCGACGCCACATCCTTATTCATGGACAAAATAACTTAA
AAGGCAGTGCGTGTTTGTACGCCCTACGCAATCCGCCATGCAACGTTGGG
GCAATTTTGTCACCTATAGCGTGCATCTAGCTCGTTGAAAGCCTTGCCTT
ATCCGTAAGCCCGCCACTTATGCATAACCCAGAGAGGGGCCCCACGATAT
CCGACACGGAGTAGATTGAATCCTGGCATTTTGTTTAGGCTTCTCCCAGC
CCTTTGGGGTGACCATGGTACCTGATATTGATACAGGCCAGGCTTCGTCT
GCCTTTCAAGCAGTAAATGCTCCTGTTGGTAAGGATAATAAAGGAAGCAG
TGACAGGTCTGTATGGGTGAGAAATTTACACTCAATGTATGCCTCGACCC
ATTAATAGGCCCTATTATTTCACCCGGCTTTACACCACTGAGTTTTGTCA
AAGGACAGTGTTTTTCTGACAAACATGGCTACCGTTAACAATTAACACAT
AAACACCTCAAATATAGATATGTATACTGGTCACTCTCAGTCTGCAGTGC
CCATTTAGATGCAGTGTCCATCGCATTTTCAGTTTGACCACTGTCCCTCG
GGTAATCTATGGACGATGTCCACTGACACATCGATCCGTGTCTGTTACGT
GCCGTCTCCTTGGTGATAGTTCCTCATACCTGTCGAACACGTTAGATGGT
TTGATTGATCGTCGAAATGCTACAACGGTAGTAGACAGGTGACTAGCACC
GAAGGCTATAGAATTTATCTTTTTATCTCTCAAAAATCTTGAAAGAATTT
TCGCATTTCGTGGATTGGTCGCCAATCGACGACATGTCCGACAATACGTC
TGTGCAAAAGACGAGAACACGTCGTCGCTGGAAACGATAAAGTTGTTAAC
AGCTTTTTCGGCTTTAGAGAAGAGAAGTTTAGTGCTGAATAGTAGAAACA
CCCTGTGGGGCCCCGCTGCAACATGCCTCACCTATCCTGACCTTTCTGTT
GTTGGAATAAAACACCTTTGTTTCTCGATAGGATTTAGACCACTCCCACT
GCCACGTATCCTGGTCTACATTCTTTGGCGATGTGTTCATCGGTGTTTTT
ATCAGCTATTTTTGTCGACTTTGGTAATTTCTAAACGTCACTGCTGGTTT
CTATTTGTTCAGTAAGAGCTACGAAACTTCCCGTGGCTGAAAACAGGGGT
GGGGGATTGCCACTACGTCATACGAAACTTCTGGAAGATTCGGTTAAGAC
CGGCTGGAACAGGTTTAAACCGGCGTCGACAGGTTAGGTTATGGCTCAAG
TATTTAGAGGAACCACGCGGCGTCAGTGGTACGAATGCTTCTGTGACATT
GTAAAATGGCAGCCAGTCGTTAATCAATCAATGCGTCTGAAAAGAAGGCA
TTGAGCACCATTAATTGAGGCGTATAGTCTTTCGCGTCATCGGCCAGCTT
TACCATTGACCAGTGATGACCTTTGACCTCATTAGCATATGTCAACAACG
CCAGGTAGTCACAGTAGCCCCCCAGGATTCAAAATCCTGACAAGACTAAT
TACCATGACCGCGCAAGGAGGGACTTTCCATCGCATGATCGTGAGATGAC
CTCTGTCCTTGGTGCTGATTGGTTGTTAGTGCATAACCTCCGGCCGTATG
ACCATGTATGGTGGTGAAAGCGCCCACCTACTCGACCCTTGTCAAGGCTG
GATTGAAGAGATTCCGTGTCAAGGATAATGTTTACAGTACCGTTCATGCC
CTTTGATGGTTGCCATACAGGGGAACTCAAGCGGTGGTGGTAAGACGAGC
CGAGAGTTGGGGTGAGTTTGGGGTCTGTGTCGATTGAAGTTTTCGGTGTG
TAGTCTAGGCTTGCTGGACTGATATACTGACTTATAAACATAGGCGAGGA
CTTCTTCTAACGCCAAGGCATTTCACGTATGTTGTAGTTATTTCAACACA
GCTAAGGCTTCTATTATATTTTGTGTCTCTTTTAGATTATTGACCAGAAG
AACAATATTGTGTTTAATGTGTCGTTATCGCCCCCCCCCCCTACAAGGGG
TGCTGAATACAAAAGACACAGTGGCACTGGTTACGTCTGAAAGCTAAGAA
AAGAAAAAGTCGTCTTCAGGTATACCTTGCCTTAAAAGCTAAAAGCTTTC
GTGTCTTAAAAATTGAACATTTTTCTTGTTGTTCGCGATACATTAATTGT
AGTAGGTTGGACGTAAAAATCGTACTGTACTGACCAGGTATAGTCTTTAT
TCAGGTGTGTTTACCTATGTGGCTTAGTTGTATTAAGAACAGGTGTGCAC
AGCTGTGCTTGGTCTAAAATTGTCCCTGTATTGAGGCGAGTTCAGAGGTC
GCTTTTCTCAAGGGTCTAGCAATACGTACCGTAAGTTATCTAATACAAGC
GACTGTCTCCAGATCAAAGTTTCTTGTATGCTCTGCAAATATAAGGTATT
TGTACAGTGCTTGTTATCTAAGAGTATTTGTTTGCTAGCATTCCTTACTA
GCACATCTTGAAATCAACTGTGATTTTAGAAGGGCAGAATTAGATTGTTG
AATATGTTGTATGATTTACAGTAACACGTTTTTTGCTGCTCTTTACACAG
TGTCGGGGCTCAGGGCCACTACCGTAAATTGTTGACACCGAATCCTTTAC
ACTAGGTTAGAGCTAAGCCTAAGTGATCCTTCGACAAAATTGCGGTCAGT
GCCTTTTTGCAGCAGTGAGTGTAGAGTTGCTGTTTTTAACGAGTATGCTA
AGAGCAAGGCCAGATACCACTTATTCAGTGGTCACCGTGTAACAAGACCC
GAAGGACAAAGTTGTTGGCTAAATGGGTAGGTCCAGAACAACCCCCTAAG
TCAGAAATCTAAGTCATGAATAAGGATGAGGACCCAGTAAGAGTGAAGGC
TAACTGACCCAATTCTTAATTCCCTACCTTTTTTTTAGAACTGAATGGTG
TTGAATTTCAATGTGATCAAATTTCTCTCCGCTGGCAGCTTTTCTAGACA
AAAATATGTAATTTTGCAGTCATGCACTAGTTAATCATTAGGATTTTTTC
CCAGGTTTTCGGGTTATAAGGTTGGGTCGGCACTATCGAAGCTGGAATAT
TGTAAACATTATCCCTGTTATATGTTTACGGAACTACGCTCTGTATAATA
ATATATCAAAGCGTTGTTCTGCCAATTAGTGTTGGCGTTTTTATAAAATG
TTTCCATATAAGGCCCGACGACTGTGTTCCTGTTTTAGACAGGCATTGGT
TCCTCTTCTCCAGACAGAAATAATCGTTACGTAGTCTGCTTCCCCCTTTC
GTGTTTCAAGTTCCTCTTTGTGTAAACATATCGTAGCGGTTTTAGTCCAT
CTGAATTTACTCGAGTGAAGGTCTGCTCAGCGCAGTGTAATAGGTAATTT
TACTGTAATTCTAAGGTATTTACATACTATTGATTCGTCAATAGCTCAAC
GTACCTTCTGGTTTTTTTTCAACCATCAGTCGACTGTTACGCTCATCAGC
TTTCTGTTTGCTGCTTAAAATGTTCTTTCAAGACTTAGTCCTACGTTTCT
AATGGTCAGGAACATTATTGTTGCCACAGATTGAAGCCACTGTTCCACGA
TGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGACC
GATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCCA
GCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAAA
GGAGGCCACGGAAGAAAGGTAACACACCCTTTCCATGAGAAACTGCGACC
GTTGAACGACCGCTGAGCGACCACTGGGTGACTAACAAAGTGACTCAAAT
AATTTCATAAACAAATAACAAATCTTTTTTTACGTATATGTTTTGCTGTC
TTTTAAATCGTACTTTGATATCTTGCATCACATTCCTCTTATAAAATCAA
GGGTTATACCAAGCTTATTTCGGTCGGCCAACGGTTTGTCGCCTCGATAT
GAATGTTAATTTAGTGTAGTATTAACATTGTTCTGTTTGCCAGTTTGGGG
CCATACGGCAACATTCGTATGTGCAGTCTGAAGTGCCTCATGTAAGCAGA
TGGTGTATGCCTTTTCGTATGACATCATATCTGACACGACAGTGCTGTGT
TTGGGCAGTAGCGAGTACTAGTGCTGAACTATTGTTTAATTACAGTGCTA
ATTATGTTTTCATTAAATCTCAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAA
GGAAAGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACG
GAAGATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAACATTAGAAACATAT
GGCACTGTAAATATTTGTCAAATTATGTATTTTGATACTTTTATACAACC
AAGTATACTGTATATTCAGCTATTCTAATGAGGAAACTTTACTAAAATAT
GGAAGAGTTGATGTTATCTTCACTGCAGTTTGAATCGATTCACCATTGCA
ATATTAATGTGTCTAAAACAAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:62048..72119+ >Blg01944.2 ID=Blg01944.2|Name=Blg01944.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:62048..72119+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:62048..62429 | Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:62048..62429 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:62980..63120 | Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:62980..63120 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365 | Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:71821..72119 | Blg01944.2-exon-Sc0000487-1570713199:71821..72119 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000487 | genome | Sc0000487:62048..72119 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg01944 |
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