Blg01944.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01944.1
Unique NameBlg01944.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000487:52592..73005+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg01944.1 ID=Blg01944.1|Name=Blg01944.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20414bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:52592..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TTTTTCCCAGGTTTTCGGGTTATAAGGTTGGGTCGGCACTATCGAAGCTG GAATATTGTAAACATTATCCCTGTTATATGTTTACGGAACTACGCTCTGT ATAATAATATATCAAAGCGTTGTTCTGCCAATTAGTGTTGGCGTTTTTAT AAAATGTTTCCATATAAGGCCCGACGACTGTGTTCCTGTTTTAGACAGGC ATTGGTTCCTCTTCTCCAGACAGAAATAATCGTTACGTAGTCTGCTTCCC CCTTTCGTGTTTCAAGTTCCTCTTTGTGTAAACATATCGTAGCGGTTTTA GTCCATCTGAATTTACTCGAGTGAAGGTCTGCTCAGCGCAGTGTAATAGG TAATTTTACTGTAATTCTAAGGTATTTACATACTATTGATTCGTCAATAG CTCAACGTACCTTCTGGTTTTTTTTCAACCATCAGTCGACTGTTACGCTC ATCAGCTTTCTGTTTGCTGCTTAAAATGTTCTTTCAAGACTTAGTCCTAC GTTTCTAATGGTCAGGAACATTATTGTTGCCACAGATTGAAGCCACTGTT CCACGATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGC CAGACCGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGA GTTCCAGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAG TGGAAAGGAGGCCACGGAAGAAAGGTAACACACCCTTTCCATGAGAAACT GCGACCGTTGAACGACCGCTGAGCGACCACTGGGTGACTAACAAAGTGAC TCAAATAATTTCATAAACAAATAACAAATCTTTTTTTACGTATATGTTTT GCTGTCTTTTAAATCGTACTTTGATATCTTGCATCACATTCCTCTTATAA AATCAAGGGTTATACCAAGCTTATTTCGGTCGGCCAACGGTTTGTCGCCT CGATATGAATGTTAATTTAGTGTAGTATTAACATTGTTCTGTTTGCCAGT TTGGGGCCATACGGCAACATTCGTATGTGCAGTCTGAAGTGCCTCATGTA AGCAGATGGTGTATGCCTTTTCGTATGACATCATATCTGACACGACAGTG CTGTGTTTGGGCAGTAGCGAGTACTAGTGCTGAACTATTGTTTAATTACA GTGCTAATTATGTTTTCATTAAATCTCAGATCGTGTGAAACGACTCAAGA GAAAAAGGAAAGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGA GAGACGGAAGATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAACATTAGAA ACATATGGCACTGTAAATATTTGTCAAATTATGTATTTTGATACTTTTAT ACAACCAAGTATACTGTATATTCAGCTATTCTAATGAGGAAACTTTACTA AAATATGGAAGAGTTGATGTTATCTTCACTGCAGTTTGAATCGATTCACC ATTGCAATATTAATGTGTCTAAAACAACTTTACATTGATACAGATATGAT ATTTTTCTTCCTCGCGATACTTTATCTTGATAGCCAGCTCAACAGGTCCT CCCAATTCAATATGGCGGTAAAAATAGCGCAGCCTTGAAATCCACGTCAT CAGGGGTTAGCTGCACCGGCTAATCAAACGGCGACAGTTGAACTATTAAC CGTTAACGCAATCGATATCGATAGTGCCCGGTACCGCCAAGCGGGGCGAT CTAACTTGCAGTGTAATTCTGTTAGCAAAGACCCGGACCGGCTGTTAGCT TGTGTTATATAGACTATTCGCTAGAGGAATTGTTATCTATGTAGAGGTTG ATTGCTGATGATCTTGTAGGGAACTACATGTCCATAGAAATGCTTAGTGT GGGACTAGTACAGTCATGCTCCCTGGCTGATCGCAGTCGGTAGAATTGTA TTTACAGAGAAATACATAATCATGATGTGTTCTGTTGTACAGTTTATTCT ACATTGTGTATTAGCTATAGATTTAAGTTCAATATCATAGATACAATTAA AGCACTCATAATGTCTTCAAAGTCTGACATGATCTTTGATGCTTCGATGT ATACGAGTAAATACGAGTGAATAAAAATATGCGAGGTTTTGTCAAATTCA CGAGTTTGTCCCTGTATATTCCCCCTTCAGTTGCAGGATTGTTTTGATGT AGATATTAATTAGAAAAGTATCATCGTTTCTTCTTGTTTCCCATTCATAC AACATATAACAGTAGCAGATACAAGACCTGAAACACGACTTCCTAAAAAA GATGGGAACTGAAACCTGGCATTGGTTTTTAGTACGAGGAGGGGAGACTA TACCAGATGCTTTCGTAAAATAAAGGGATGGAAATATTTCCTATTATTAT GATTTTGTGCGCCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:52592..73005+

>Blg01944.1 ID=Blg01944.1|Name=Blg01944.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:52592..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.1Blg01944.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:52592..53203Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:52592..53203Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:54961..55527Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:54961..55527Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Blg01944.1-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000487genomeSc0000487:52592..73005 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01944