Blg01865.7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01865.7
Unique NameBlg01865.7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000228:161447..181405-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01865.7 ID=Blg01865.7|Name=Blg01865.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19959bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181405- (Branchiostoma lanceolatum)
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CTTTTGCAACAAAAGATTTTGTTAGCGATATTTTTAAAGACAGTTGCACT AGTTGATGAGAGAATGGATAGATTCTACTCTGTGTCACATGGATTCAGTT TTATTCTCTTCCCTTTGGGTCTTGTCGAGTGACATATTATTGGCAATTGT CATGTCAGATTTGTTAAGAATCCTCTTGCAATGTAGCCAAGCTAAGTCAG TTTGTGCTATGTGAAAGGGATTGTACTGTTTCAGCACTGATTTTTTCAGT TGTGGGCCCAGAAAGAATCCTTGTGGTAACACCAGGTTTGTTTCTGCCAG GGTCGGTAGGAAAACACAACATGCTCTTAGATAAATGAATGTCTAGTTTA GGCTTATCATTGAACTGTCTCGAATCATTATGTACATGTTTGTTTTCATG GGTCATGATCATGCATTGTTACTGAAGAGCTGACTATAGCCATGTCTAAC AACTCTCCAGTTTTATCCTTTCACTTGTGGCTAGGGGCATCAGCCGTAAC ACTTGTACCAAGGATATATTTTGCTTTGGTTATGTTTCTTACTTTGTTTA TAGGTTATATATATGTATATTCTGTACGGCATTGCTTTAGTGTATCTTGT CCAAAATTATTTGTGCTGCAAGTTATGCTACAATAAAGCCGCATAAAAAG TACCATTGGCATTGTCATGTTTTTGTCAAATTATTTCATTGTATCATCAG CTACATATTTCTTACTGTTCAGTTAGTAAGACTAAGAGTTAACATTTCTT ACTGTTCAGGTGGTAAGACTTAACAAGAGTTAACCATTTCAATCACTTTA TCACAACAGTGAATTCGGACAGATTCAACCAAATCAGCATTCTCAAGTCA TCATAATATATATTCAGATATGTAGATAGCTTACATGAACATCACAATAA TAACTAAAGTATATAGATTATGTAGATAGTTTACATCCCAACAATAAGTA AAAAACGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000228:161447..181405-

>Blg01865.7 ID=Blg01865.7|Name=Blg01865.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1152bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181405- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGTTATACTATGAATTCGTCAGAAACTGTGTTTCAAGTAATGCGGA
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TTGAAGACGATGAGGGTAGACAACAAGGAGAACCGACATTGCCAACGCCG
AAGGAAAAGGTGATAGACTGTGGAGAATATGTGTGGGCCGTAGCGTTCGG
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GCTTCAACTTCGGCAAAGACCTCATTCTGGCTACGGGGCTGCAGAGTGGA
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AGATCACAAAGAGGTGATCAGAGACCTGCAGTTCGCTCCTGATGGCAGCA
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AACGACGACGGCAACATGAAGAAGACCCTGAAGGGTCACAACGGCTGGGT
GTACAGCTGCTCGTGGTCTCCTGATGCGAAGATTCTCGCTTCAGTTGGGC
AGAATAAAACAGTCATCCTTTGGGACATGTCGGACTATTCCATGATGAGG
AAACTGACGGGGCATCAGAATGACGTGGTGGCCTGTGACTTTTCTCCTGA
TGGTGCCCTCCTGGCGACGGGCTCCTATGACACGAGGGTTATCTTGTGGG
ACCCCTACACAGGCCAGAAGATCAGAACATTTGGGCACCTCTTCCCTCCC
CCTTCATGCATTTTCTCTGGTGGCTCTAACGACTTCTGGGTGCGACACAT
CTCCTTCTCGCATGACGGCTGCCATATTGCCACTCTGTGCGACGACAAGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.7Blg01865.7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181405Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181405Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:176332..176599Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:176332..176599Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:166549..167501Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:166549..167501Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Blg01865.7-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000228genomeSc0000228:161447..181405 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01865