Blg01865.16 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01865.16
Unique NameBlg01865.16
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000228:161447..181749-

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg01865.16 ID=Blg01865.16|Name=Blg01865.16|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20303bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181749- (Branchiostoma lanceolatum)
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CAGCATTAAAGCAGCAAAGAACGAGATGAGAAACAACAATGTGTATATAT ATCAACTGTTAGTAGTGTCTCTTGCTACCTGTGCTTAATACATGAATACA TGTACTATGCAGCTAGGGGGAATGGATGCATGTTTTTCTACAATCCTATA TTTCTATAAAAGATACATATATAAACTAATGTTCCAGCCTTCTGGGTGTT GCTGTGCCTAGGCCTGTTTCACCGAAGTTCCAGTATTTAAGCCCATGTTA CCCAAGATATACTAGTAACCTGTGTAGCACAAAACTCACATCAGTCTCTA CTAAGCTTGTATTTCCAATGCAGGGATATTATTCATGGTGGGACTGTGTA ATAAAACTCATGTTTTGATTAAGATAATTGTACCTTTTGGCATGACCATG TATTTAGGTGAATGGGTAAATACGTCGTAAGCATGGCAATAACATTAAAG TAAACAGTTATAAGTAGACTCCTTTAGAAAGGACAACCTTCATATACATA GGCAGCCGACAGCCTCCTTGCGACAAACTTGCAGTGTGAAAAAGGACTCC ACACTACCTAACTGAAATTGGTTGCTTAAGATTATGGGTTGCTACAATGT GTCACTACTTATCCAAACAGGAAGCCTCAGGCAAATGACATTCCTGGAGA ATTGATTCTTCTGTTGTTTGTATTGCTGGTATTGTGCAAAGCGACATTCT CATGAATTTTGTGGGTTGACTCTTCGGTTTTAGAAATCTATGTCAACATG GTGTCATCACGTTACACAATGCTCCTTTTTTCACCCCAAGACCAAAATTA TAACATCAACTCTCCTAATTTTGCCAAATCGCCTAAGTCTGCCAGATTTT GTTTTAAAAAATGGTGAATTTAAGAGATATACTAATGCAACATCAGTAAT CCCCTAAATATGCAGACCTCGGATATCCAGGTGTTCGAGACATTCTTGAG 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TTATTTGTGCTGCAAGTTATGCTACAATAAAGCCGCATAAAAAGTACCAT TGGCATTGTCATGTTTTTGTCAAATTATTTCATTGTATCATCAGCTACAT ATTTCTTACTGTTCAGTTAGTAAGACTAAGAGTTAACATTTCTTACTGTT CAGGTGGTAAGACTTAACAAGAGTTAACCATTTCAATCACTTTATCACAA CAGTGAATTCGGACAGATTCAACCAAATCAGCATTCTCAAGTCATCATAA TATATATTCAGATATGTAGATAGCTTACATGAACATCACAATAATAACTA AAGTATATAGATTATGTAGATAGTTTACATCCCAACAATAAGTAAAAAAC GAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000228:161447..181749-

>Blg01865.16 ID=Blg01865.16|Name=Blg01865.16|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=969bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181749- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGTGTAATGGCAAGTTTTGCCTGCAGTGACAGCGATATAGCGGACGC
AGAAATACTCTACCAGCTGAAACCAGGCGGAAACCCCAACGACCAAAAAG
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GCCTGGTCGTGTGGTCACAGGCTGGTGAGACTGGTCCCATGGAAACACAA
GATAAACAATAATGAGATTGAAGACGATGAGGGTAGACAACAAGGAGAAC
CGACATTGCCAACGCCGAAGGAAAAGGTGATAGACTGTGGAGAATATGTG
TGGGCCGTAGCGTTCGGCTCGTCCGTGTCTTCCAAATGTCACCGCACCGT
CAACATCAGCTTCCACCGCTTCAACTTCGGCAAAGACCTCATTCTGGCTA
CGGGGCTGCAGAGTGGACGAATCAAAACATGGGACGTTTCAACAGGTGGC
ATCCTGTTGTACCTTATAGATCACAAAGAGGTGATCAGAGACCTGCAGTT
CGCTCCTGATGGCAGCATGTTCCTGGCATCCGCATCCCGAGACAAAACCC
TCAAGGTTTGGGATTTGAACGACGACGGCAACATGAAGAAGACCCTGAAG
GGTCACAACGGCTGGGTGTACAGCTGCTCGTGGTCTCCTGATGCGAAGAT
TCTCGCTTCAGTTGGGCAGAATAAAACAGTCATCCTTTGGGACATGTCGG
ACTATTCCATGATGAGGAAACTGACGGGGCATCAGAATGACGTGGTGGCC
TGTGACTTTTCTCCTGATGGTGCCCTCCTGGCGACGGGCTCCTATGACAC
GAGGGTTATCTTGTGGGACCCCTACACAGGCCAGAAGATCAGAACATTTG
GGCATATGTACCCCCCTCCCTCATTTCTCATGATGGGCGGAGCCAATGAC
TACTGGCTGCGAGCACTGAGCTTTTCCCATGACGGGTGCCATGTGGGCAC
TCTATGTGACGACAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.16Blg01865.16-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181749Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181749Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:166549..168039Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:166549..168039Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Blg01865.16-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000228genomeSc0000228:161447..181749 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01865