Blg01865.15 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01865.15
Unique NameBlg01865.15
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000228:161447..181737-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01865.15 ID=Blg01865.15|Name=Blg01865.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20291bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181737- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGCAAAGAACGAGATGAGAAACAACAATGTGTATATATATCAACTGTTAG TAGTGTCTCTTGCTACCTGTGCTTAATACATGAATACATGTACTATGCAG CTAGGGGGAATGGATGCATGTTTTTCTACAATCCTATATTTCTATAAAAG ATACATATATAAACTAATGTTCCAGCCTTCTGGGTGTTGCTGTGCCTAGG CCTGTTTCACCGAAGTTCCAGTATTTAAGCCCATGTTACCCAAGATATAC TAGTAACCTGTGTAGCACAAAACTCACATCAGTCTCTACTAAGCTTGTAT TTCCAATGCAGGGATATTATTCATGGTGGGACTGTGTAATAAAACTCATG TTTTGATTAAGATAATTGTACCTTTTGGCATGACCATGTATTTAGGTGAA TGGGTAAATACGTCGTAAGCATGGCAATAACATTAAAGTAAACAGTTATA AGTAGACTCCTTTAGAAAGGACAACCTTCATATACATAGGCAGCCGACAG CCTCCTTGCGACAAACTTGCAGTGTGAAAAAGGACTCCACACTACCTAAC TGAAATTGGTTGCTTAAGATTATGGGTTGCTACAATGTGTCACTACTTAT CCAAACAGGAAGCCTCAGGCAAATGACATTCCTGGAGAATTGATTCTTCT GTTGTTTGTATTGCTGGTATTGTGCAAAGCGACATTCTCATGAATTTTGT GGGTTGACTCTTCGGTTTTAGAAATCTATGTCAACATGGTGTCATCACGT TACACAATGCTCCTTTTTTCACCCCAAGACCAAAATTATAACATCAACTC TCCTAATTTTGCCAAATCGCCTAAGTCTGCCAGATTTTGTTTTAAAAAAT GGTGAATTTAAGAGATATACTAATGCAACATCAGTAATCCCCTAAATATG CAGACCTCGGATATCCAGGTGTTCGAGACATTCTTGAGAAGTCCTAGATA ACACTATTCTTCTAATGTGGCAGTCTTATAGTACCAGGCTACGTTATGAG AGTTGATGTTGCATCTACAAAATAGGTGCAAAGTACAAAAGTAACGTGTA CATTTACATTACATCCTTATGTTTGTTGATACTTAGTGTAACATCGTTCA TGGTTATTATTCATTGTGATATTTTCTTGTATAATGTAAATAATACTTAG TACATAATATTGTACTTCAATGTTACTTTGTGTTAAGGAGGGTAAGACTG TACATAGGTGACACCATGAATTATTTTTTGGAAACAAATTTGCATATTGT ACTGGGGAAAGTCAGGATTACATGTAGATGCTCTTTTGCAACAAAAGATT TTGTTAGCGATATTTTTAAAGACAGTTGCACTAGTTGATGAGAGAATGGA TAGATTCTACTCTGTGTCACATGGATTCAGTTTTATTCTCTTCCCTTTGG GTCTTGTCGAGTGACATATTATTGGCAATTGTCATGTCAGATTTGTTAAG AATCCTCTTGCAATGTAGCCAAGCTAAGTCAGTTTGTGCTATGTGAAAGG GATTGTACTGTTTCAGCACTGATTTTTTCAGTTGTGGGCCCAGAAAGAAT CCTTGTGGTAACACCAGGTTTGTTTCTGCCAGGGTCGGTAGGAAAACACA ACATGCTCTTAGATAAATGAATGTCTAGTTTAGGCTTATCATTGAACTGT CTCGAATCATTATGTACATGTTTGTTTTCATGGGTCATGATCATGCATTG TTACTGAAGAGCTGACTATAGCCATGTCTAACAACTCTCCAGTTTTATCC TTTCACTTGTGGCTAGGGGCATCAGCCGTAACACTTGTACCAAGGATATA TTTTGCTTTGGTTATGTTTCTTACTTTGTTTATAGGTTATATATATGTAT ATTCTGTACGGCATTGCTTTAGTGTATCTTGTCCAAAATTATTTGTGCTG CAAGTTATGCTACAATAAAGCCGCATAAAAAGTACCATTGGCATTGTCAT GTTTTTGTCAAATTATTTCATTGTATCATCAGCTACATATTTCTTACTGT TCAGTTAGTAAGACTAAGAGTTAACATTTCTTACTGTTCAGGTGGTAAGA CTTAACAAGAGTTAACCATTTCAATCACTTTATCACAACAGTGAATTCGG ACAGATTCAACCAAATCAGCATTCTCAAGTCATCATAATATATATTCAGA TATGTAGATAGCTTACATGAACATCACAATAATAACTAAAGTATATAGAT TATGTAGATAGTTTACATCCCAACAATAAGTAAAAAACGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000228:161447..181737-

>Blg01865.15 ID=Blg01865.15|Name=Blg01865.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=969bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..181737- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGTGTAATGGCAAGTTTTGCCTGCAGTGACAGCGATATAGCGGACGC
AGAAATACTCTACCAGCTGAAACCAGGCGGAAACCCCAACGACCAAAAAG
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GCCTGGTCGTGTGGTCACAGGCTGGTGAGACTGGTCCCATGGAAACACAA
GATAAACAATAATGAGATTGAAGACGATGAGGGTAGACAACAAGGAGAAC
CGACATTGCCAACGCCGAAGGAAAAGGTGATAGACTGTGGAGAATATGTG
TGGGCCGTAGCGTTCGGCTCGTCCGTGTCTTCCAAATGTCACCGCACCGT
CAACATCAGCTTCCACCGCTTCAACTTCGGCAAAGACCTCATTCTGGCTA
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ATCCTGTTGTACCTTATAGATCACAAAGAGGTGATCAGAGACCTGCAGTT
CGCTCCTGATGGCAGCATGTTCCTGGCATCCGCATCCCGAGACAAAACCC
TCAAGGTTTGGGATTTGAACGACGACGGCAACATGAAGAAGACCCTGAAG
GGTCACAACGGCTGGGTGTACAGCTGCTCGTGGTCTCCTGATGCGAAGAT
TCTCGCTTCAGTTGGGCAGAATAAAACAGTCATCCTTTGGGACATGTCGG
ACTATTCCATGATGAGGAAACTGACGGGGCATCAGAATGACGTGGTGGCC
TGTGACTTTTCTCCTGATGGTGCCCTCCTGGCGACGGGCTCCTATGACAC
GAGGGTTATCTTGTGGGACCCCTACACAGGCCAGAAGATCAGAACATTTG
GGCACCTCTTCCCTCCCCCTTCATGCATTTTCTCTGGTGGCTCTAACGAC
TTCTGGGTGCGACACATCTCCTTCTCGCATGACGGCTGCCATATTGCCAC
TCTGTGCGACGACAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.15Blg01865.15-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181737Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:181382..181737Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:174361..174535Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:172984..173210Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:170686..170795Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:169254..169376Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:168639..168811Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:166549..167501Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:166549..167501Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Blg01865.15-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000228genomeSc0000228:161447..181737 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01865