Blg01841.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01841.1
Unique NameBlg01841.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000333:116023..141833-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01841.1 ID=Blg01841.1|Name=Blg01841.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=25811bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000333:116023..141833- (Branchiostoma lanceolatum)
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ATTGGTGATCATCCCTTTGTGTTGCCTGCCATTCGAGGTCATCATTTTTT TTATTGCTTTAAGCAATAAGGAAGGTGAATGACCATTTTAAGAAGCATCC AGAAAGGAAGAGAATTTGCAAAATAAAAGTCATAGAATAAAGGTGACGTG AAATCTTTGTTTGTCACTTTGCGAGTCATTTGATTATGGTAGAAAAATGT TTAAAAGGGCACTGCCAAGACGGCTTGTGGTGAACTCTAGAGTGACGATG TTTGGGTTGTATTTTTCAATTTTTTTGCCCTTTTTCCCTTTTTTCTCATT CTAAAAATCTTGTTCTAATCAATTCGTCTACTATTACTTCCTTTGAATTT GACTGCAGATCTGAATCATATTGTTATAGATTGGAGAAAACAGCACTACT AATCTAGCAGAGGTTTACACTATTCGAAAGCTGTTTTATTATTCGTATGA AATTTTGTACAGCAACCCCCCTATCGTTTACCTGGTCTGGCCCAGCCAAC TAGAGTCCTGCCCTATGGCACTTTGCCATTTCACTCTTATTTACATCCAA ATCACAATTTTCCCCTGAAGCATAATTCTCTAATGTTGGGACATAAATTA TCTGTTTCAAATTCATAACAGGAACAGGAACAGAGTTAAAGGGACACAAT TTAGAAATATTTTTGTGTGGTACTTTAAAGTCACACTAATTAACTTAATG GTTTTGCCTGTTTCAGCTATCCAAACCAAAAATAACAAAAACTTATTCAT TATTAATGAAGCATTTACCACTTGTGTAAACAAACACTAGATACATTAAA ACATATTTTTTTAATGATGATGTATGTTTGCAATGCTTGTACATGCAGTA TATTACAGTTAGAAAACTTAGTGCTAAGGATGTGAAAATTTGACTGAAAT GATAAAAAATTCTCTTATGGCAGTCTAAAATGCTGAAATATTTTTCCATA AGCCTTCTATTGCGAGTTTACTCCTTGTCGTTTTTGTCGTTACAAGTCTT TCTCTTGAAACATACTCAGTCAGTTTCTTTCAAGTTTCTCGATCAATATA CATGTAGTGTCTAAAGTAAGAATAGTTTGGTTCTTTTGTGTTCAAAGCCA GACAACAACTCTTTATTACGGTTGAATGATTATCATGTTTTTAAGTAACG TTACAGCTTGTTCGAGTTAGTTCACGTCCACTGAACTACAAAGATAGCTT CAGACCGAGCCACCACTTCTGGACAAAGCATTATTATTCATCCCAGTGTT TCTCAAGGCTAAAAAGTCGTTGAACAACATCTTCACTGATTTAATGTGTT AACGTCTGACGCACTCTGTGACGACATATATTGTTTGCTTAATGCATATA ACCGGTTACTCTCCAAGCAGAGCATAGGTTCCGGCAGGTTTTTGACGTTT TAGGTGTATTTAGGCGTTTTTGTCGGGCTTTCTATATTTTTTTTGGTCTC ATTTTTGGGGGATGGCGAGACCAAAAAAAATGACAAAGTGGAAAGCCCGA CAAAAACGCCTAAAAACACGTCAAAAACCTGCCGGAACCCATCCTCTGCT TGGAGAGTATAACTGGCATGGTAAGGTTTGCCTTTGGGCGTAACGCACCA GTTTTGACACTACAGTAAGTACAAGCTACATGTAAAACTTGACTGCAACT TAGTGTAAGGTTTGATCCCTACACACCTGGATCGAGACATACTCTTTTCG ATAAGTGTGCTGGGTTCTTAAATGTGCTCGAGGTGTGGCTCTCCTCAAAC ACGGCTATACATCCCATCCGAGTAAGGAGGTTATATAGTCTATATAACCT CCTTGATCCGAGAGGACATCCCTAACCGAAGCTAGGTACTCATTTTCGAG TGAGGAAATAGGTGTAAAATGCCTTTCCAAAGGACACGACATTGAGGCCT GCTTGCGGGAGTCGAACTCAGAACCTTTAGCCAATAACCCTAACCACACA GCCACCTTGCCATCGCTGGCATATTTGTCGTCCTTTGCTTGAATATTTTA TATGGAAGCCAACCGCCGGCATAAATTATTAATTCAGCCTCAGTATTTGA TGGTTTGGAAACGTTAGCAAAAATAGTCCTTTACAAACATTGATGTTATG AATAAATGATGCTTGCTGAATAATACATGTTGTTTTGATTTCAAATGCAT AGGATGTGAATAATTTATAAATATTGGATGTGAATAATTTATTATCAGCT TTTCCATTAGAAGTTAACCCACACACATGTACTGTTATGTTGGAATATGT AGGACTAGAATTACTGTTTGTATGGTATGTGCTAAAACGGGGAATGATTC CTTGATTCTATCAATTTAATGATTACTGAGTGTCGTCTTCAGATTTTGAG AACTCCTGTTACATTTCTTTAACCTTTATCACTCTGAAGTAGCCCTTTGG CACCCAATTCCCCACTGGTACAGAGTTAGGCAGCAGGGAGAAGGTTAAGA TACTTATTTCATAATTTTAAGGCAGTTTTTACACATCTTGAATTAATGTA CTGTTACTGTACGGTAACAGATCTTTCTTTATTTGTAGTTTCTGTATCTA TTTCTGTCAACTTGTTTAGCAAATGGTAGGGTCCTGTCCCACACCCAATG ATTTCTACACCCCCCCATGCTTTCTGGACTGCCCCCATGCTTTCAACACT GTCCCTCCCCCAATGCTTTCTGAACCATCCCCTATATTAGTTCTAAGAGT TTGCTTCAGTTCTCAATCAGTAAATGCATCACAGAGTCCTTTTCTATTTC AGCCCACCTAACATGCATAATCCAAGTCATTTGTACATATTACCCATTTT GTTTCCTGTTGGATTTAAAAGACATTTTTTCATTTCAAGGCATCCTCATT TGAGGTTAAGCATGCTTTTTCAAGTAGCTACTAATAGCCAGGTGTAACTT ATAGGCATTACATGTAAATGCTTTGTTAAAGATAAACCCTACAGTTTTGC GGGCCTAGTAGATTAAGGTCTGTTATAATGGTGACATGATCGACCATCTG GTAAAATTCTAGTTAACAAAAGCAAATGTCATAAGTATATCAGTTTGCAA TAAGGTATCATAATGATTACATTCTGATACAACAACTACATAAACATTAT TTATACTACCAGGTGTTTCATATGTGGGCATTGTTGGCTATTTTATCACT TTATCCCCAAGGGAGTGAAGCATTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCACTGTGTGTGTCTGTGTGT ATGTATGTGTACAATGTATACGTGCATCTGTGTTTCTGTGTGTTTATGTT TCTAGATCTGCAATTCCAAAGCTTAGTCTGGGTAAGGGGGTGAAGTCTAC CATCTGATTGCCCGCTGTGTTAAATTTGTTGTAAATCAAGTGTCTGTGTC TACTTTGTCCAGGTGAGGTCTCCTGCCCCCAAACCCCCTGCAGCTGAGGA CCAGACATCCCTAGCTAAGGAAGTGGAGATGTTGAGGAAAAGAGAGGCAG AACTGAAAGAGCAGGTAGCACAGCTGCAGCAAGAGTAGGTTCCCTGCTTC TATTTTCCCCAATGTATTGTAATTAGGCCATGTTGATTTCATTATATGGA TGGCATCCGCATGCGCATCAATTTCCGTCCGTTTCCCAAGAAAAAAAAAG TTTTTGACTATACTGTAAATCATACAAAGCAGCTGCAAAATGATGTAATA CATGCTGTAGATTGTAAAAATTTTTATCGGAAACCGATACTAATGTGACG GTCGTAGAATGCCAAAATCAATTCCAAAGTCAAAGAAGAAGATGTGAAGA AATGAAAATGAAGAATCCATTATTTGCTATACCATACTCTGTGTTAATCA TTTGTTCAACCTTCCTGACCACGTAAATTTCGTAATTAAGGCAACTTTTT TTTTTTGCCAAACTTTTTTTTATTCACACACTGGCATCATTTCTTGGGTT CTCAGAGGATGTCATCCATATAATCAAATCAACATGGCCTTACCTTTGCC TAGAAGAAGGCTGTGTGTTCTGACTAGCATGTGTGGTTTTGTAGAGTTCG TTGTGTCCTTGTTAGTAAACAGCATAACTCCAGAAGCTATGGATGGTTTT TCATGATACAGTCAAACCTTGTGTGACAACCACCTGGCGCAGGCAACTAC CTCTAGTCACAAGCAACATTAAAACAGTCCCGTCCAATCATATACTAGTA TAGTTAATCCAATCTTGTCCTCAGCAACCACCTGTCACTGGCAACCATTT TTCCTCAGTCCCTTGAGTGGTTGCTGAACCCAGGTGATCACTCCACTGCG AATTTATGACATGCAAATATGCCTGTTCAGTACTGTACTTCAGAATTGTT TCAGCTGAGATTTAGAACACCATGAAAAACTTCCCTTTCCATCTTACTGC GAGCTAAAACCACCGCAAAAGTAAGATATTATAGCAGGGCTCGGAATTCA TTTTTGGAAAAAGGTGCACTGGTGCACCCAACCAAAGCAAATTAGGGGCA CAGAAAGAATCTTTGCTGCACCACATAAATTAAAGTTAAATGTCAACAAA AGAAAATACTTCCTCTCTTAGGAATAAGAACTTCAATCTGTTGCTAACTT CAGAACAAGTAATACATCAAATAAAGTACAACAAAAGATTATATACAGTA GTATAATATTAAATTTACTTACATTTCAAGAATATTCTGTATACTAGTGT ACAATCATACCTTTACCCTATAGCCTACAAAAATATCTAGGTGCACTGGT GCACCCACAGTAAAAATTAGGTGCACAGCTCCAATTTTGGGTGCACAAAG GTGCACATGCACCCAGTATTTTGAGGCCTGTATACTAGTAAAGTATTGAT GATAGCTTTGAATGTTGCAGAAGGGTAACATTCATTCAGAATTATTCATT CATTCATTTATGAATACCAGAAAATGATGAGAAAGTAACTGTAGACAACG TAGCACCTTAAACAGGGACAGGGGGCGTCACTATCTTAGGCCTGTATGTA ACTTTCTCTTGTCACATGATAGTCAACATCAAGTCACATGACAAGACAAC TCCAAGACGAGATCTGACTTAACCTATGATGTTGAAGACACCCTGTGCAT CTCGAAAGCTCCTCCAAAAATAGCAAACTCTATTGTTGTGTGTAATCATT TGATGAATATTTCATCAAGAGAAAGTTACTAACTGTTAATTTTCCAGAGG TTACCATGAGGATGACCTGCCTGAGTGTATCCAGGTGCTGCACAGGTACA ACGAGATGAAGGATATAGGACAGATGCTGCTGGGGAGACTAGGTCTGTAC TTCTTTCACTTTCTGCTACTGTGATTCTTGATTTGTTAACGGTAACTTAG TACATAAATGTAATTCAAGCTACTTGAACGGTCGCTAATGAACCGCTAAA ATGTCATCATCGCAAATGTTGGATTACAAAAGTTTGAGACAGTGATGTTT GTTCCATTTAAAATCAACTGCCGTGAACTACTCTCTTTCCCCCCGACCGC TAAAATTACAGACCGTGATTATATTAAATGGATTTACAGTATGTTTTCTG TGTGTCTCTTGTGGGAGGGTTCGGGTTTATCAGGGGATGCCTGCTTCATT TTATTCTTCATTAAATTTTTTCTTTACCTAAAATGTAAGTTGTATAATGT ATTTACCTGCTCAATCATTTTGTTTCCAATGGAAATACGAGAAACGAGAA ATTAAATTGGACCAGGTGTGGCCTTTTTAAAGAATTTTTTGCAAGCCTTT CAATTTGAAGCACTCCCCATTACTGCTCTACTGAGTTTTTAGAATTATGA AAGTTTCATGTGGACTTAGTGATTTGAAAAGAAGGAGAGTGTAGCTGTGG GTGGACTTCTTTCCAATTGGGTAAAGGTGCAGTTTTTATGTGCGCCACAA GGGGTCTCTGTTAAATAGCTAGCACAGTGCTACATTACTACTTCCAGCTG GTAATCCTAATTGTATGATCTAGAGATTGAAAATGTGTTATGGATTTCAG CATATAAGCTCATTTGACCACATGCCTTTAAAACCATTGTGCACGTCGAA TTTAATGCTTAAATAAACTACGCACAAAAAGTTTGGAAACTTTACTTTGG TTGATCATATTTCCATTGTTTTTTAATCAATTTCAATTCATTATATATCG TTGGAAAGCCTGTGTGATTTCCTTTCCTATGATACCCTACTCATTATAAT TGCAATCTGATGGAGCGAGCACCAGGCCTGCTTACGCGAGTGGGTTGTAG AAAAAAAGTGCCCAAATTTCCATAATAGTGTCAAACACCTAGCGCAGCGC CAAACCCATTAGTGGTGGNAAAAAAAACAGGCTAATCATCCTAAGCAACT TCGATGTGTCGATATAGAGACACCTTTCTCCATCCAGTCACATTTCCAAG ATCCTTATCTCTGCAATATGATTATGAGACTGGGTGCCATTCTGCAAGAT GATAGTGCACGTCCATACAGAATGAGTCTGTGAGAGTCATTTCAGACCAC CTCCAGTACCTATGCAGGAATACAGAGGATAGAATGGCCCTCCTGCAGCC CAGATCTCAACACAATTGAACACAGTCTCAGACTCTGTGATCACTGATCA GCTTGGGCGAGCTGTGCAAGCAGTTGTGATCAACAGAGCAACACTGGTCG ACCTGCGACGACTCCTTGTGGAAGAATAGCCAGGGGCCGCGTACCAAAAC TGGTGACACATGAGGAGGATATACCGGGCTGTGGTGACAGTGCATGGCGT GTGTACTCAGTATTAAGCCACCCTCATCATAACCGAGGCTCCTTTACGCA TTTTTTCTTTGGATGAAGACTACACTTAGCTTTTATATTAATGTGTTTTG TTGATTCAAGTTTCATATTACCCTCGTACAAAAGCCACGTGCTACCAGCA GAAGACAAAATACTGAATTGAGCGTTTTACATTAGTAGGGTAATTTGGGC ACTTTTTTTATGAGACTCGCTCGCATAAGCAGGTCTGGTGCTCGTTGTAT TAATTTACAACAATAATAAGTTAAGTATCATGGGAAAGAAAATCACAAAA GCTTTTCAATGATATATAAATCATTGAAATTGATCAAGAAACAACGGAGA TATGATCGACCAAAGTTAAGTTTCCGAACTTTTTGTGCGTAGTTTACATT TTGAACTTCAATACTTGTTTCTTCCCCCTGTGTAGCTACCTTGGAAGGAG TGACCACAAGAGAAATGTACCAAAAGTTTGAGCTGAACCTAGAGGACTGA AGAAGTGAAACTCATCACAGCTGTTTGCTTACTGCAGAACTGTGCATATT TCTTAAGTTCAACAGCCGTGAATTACTGGACTTGGACACAGAAATGTCTA TCAGGGCATCAGAATATCAATGTGTCATTGCATGGAGGTTATAGAGAAGT TCTCTAAGACTTGAAAGTTTTCTTTCCCATTTAAGTTTGAAGTTCATGTC CCTGGATATGAATTGTATGTTACAAGTTCAACTTCATAGCAAGAAAATTG AGTGTTTGAATCCTTGCCTTAATAATCAAGTGTTATTTATCTGTCTGGCA TCAATGCTACTCGAACAGATTGCAGAATGTGACATTGCTAGCCTGACTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000333:116023..141833-

>Blg01841.1 ID=Blg01841.1|Name=Blg01841.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=366bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000333:116023..141833- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCAGACCCCTAAGATGAAAACTCCAGTGTCAAGATTCAGAAGAGGACC
ATCACGACCCCTTAACAGTAGCTTCAAGTCGCCGGTGAGGTCTCCTGCCC
CCAAACCCCCTGCAGCTGAGGACCAGACATCCCTAGCTAAGGAAGTGGAG
ATGTTGAGGAAAAGAGAGGCAGAACTGAAAGAGCAGGTAGCACAGCTGCA
GCAAGAAGGTTACCATGAGGATGACCTGCCTGAGTGTATCCAGGTGCTGC
ACAGGTACAACGAGATGAAGGATATAGGACAGATGCTGCTGGGGAGACTA
GCTACCTTGGAAGGAGTGACCACAAGAGAAATGTACCAAAAGTTTGAGCT
GAACCTAGAGGACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01841.1Blg01841.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:120250..120371Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:120250..120371Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:118492..118586Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:118492..118586Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:116023..116598Blg01841.1-exon-Sc0000333-1570713199:116023..116598Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000333genomeSc0000333:116023..141833 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01841