Blg01652.6 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01652.6
Unique NameBlg01652.6
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000168:25404..56658+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01652.6 ID=Blg01652.6|Name=Blg01652.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=31255bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:25404..56658+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GCACACCTATACAGTTCATTTTTATAAACACTGCCTACCTGCTCGCCCTG CTACCGAGGAGGTACAATTGTTGAAATTAACCATCATTATATCTGGGACA AGCAAGACCTGAGTTTGTTCTCTGTGATTTCAGAATCTTCAGGATATCAC CAGCATGATCAAGTCAGGGGAGCAGCCCACCAAGAAGAGAGCGCTCAACT ACGACACGAATGAGAACCCCGCCAAGCGGCTCTGCTCCGTGGGAAGTGCA GACAGAACGTTGTTCCAGAAACTGAAGGATATAGACACGGTGCGACAGGC AGCTAACGCCAACCAATAGACAAAATGTATTTTTGTAAGACATACCTGTA AAAACAGACAAAAGTGTGGTGTTTTGTCTTTTTAGTTGTTTTTTTCTGTG TATAACAAACAATCTTGAGAGAATCGTAGCCTCTAAATCAGACTTCGAAT GTGCAACATTTTCTTAGCTTTTGCCAAGTAAGCATGTCTACAACTGTGAA ATAACTTTTTAGCATAGAATGGAGGAAGGGGGATAGAACGTAAAGGTGTT AGAAATGGAAGGGTAACAAAAACTGTAGCACCACTGTGGAAAAAAGGGCA GGCTATTTATACTAATAGAGGAGTGGCTTATTTATGATGTATTTTTCCAT GTATTTATGTGATGGGTAGACAGACACTGTCAACTATTGGAAGATTTCGT GGGGTGTGTATATAGGTTCACAGGAGTTCGCTCATTCCACTTTCATGTAC ACTAAGGGAGCATCTGGACTAGTGACAATTGTGGCAGTTGTGATTTCTAT GAAAATGTAGAACCCAGTGTGCCCTCTCTCAAATTAACAGCAAAGGGAAA GAAAAACAATCATGGTCTCTCGTAACAGGTAATATGTATTTAAAGAACAA CAGATGAAGTGTCTTGGTATGAGGGGATAAAATCTGTGCATGTTTGGATA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000168:25404..56658+

>Blg01652.6 ID=Blg01652.6|Name=Blg01652.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=3114bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:25404..56658+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AGCCCATCTTCTTGGACCTGTTCAGGAACCCTGGAGATGACCAGCCCAGG
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CACTGAGTTTCCAGCACTGCCTGAAGGTTTTACCAACAGGGACTGGCGCT
CCCCCTCCGAGCCACCCTGTATCATAGAGAAACTGTGTGAACTGCACGAC
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CTGAAGACTGCCCCCAGCGACAACCTCACCAAGCTTTTCTCGGAATGTTC
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AGTTCTGCACCAGCTACACACAGCCGTCCGAGGACCACCCCGGCTCGCAC
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CAGGATTGCCAGGGACACGGGGGTCATGTTAAAGAAAGTGGAGTCACCCC
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CAGCTACAGACCAGGGAGTACAGCAGACCATCACACAGCAGACTGTGGCC
ATACCTATACCATCTGGTAGTGGGACCATCACATACTTGGCGACGCTGCC
CATAGTGCAGCAGGTGCAGCCTGGCCAGCAGCCACAGCAGATCCAGCTGC
AGGCGGTTCCCCAGGGCCAGCAGGTGCCGGGGGCAAACATGCTGGGTGCC
ATGGCTCAGGCGGTCGCCACCGGACAGCAGCAGGTAGCTCCCAGTCAGAC
AGCCATTGTTCCACATGGGACAGCAGCTGCTGCACCTGCACCCGGAGAGA
AGGCGGCAGCTGGTGAACACCCGTCCAAGAGGATTGGGTCCTTGGGACTG
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CGAGAAGCTGGAGGTGGGAGACGAGTTGCGGCGGAAGATGTGGACGTGTT
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CCAACAGCACGTTACCCGTGGCCGCCCCGAGCAGCGCGCCGCCGACACCC
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CCTGATCCAGTTCTACAACACTATCTTTGTGACAAAACTGAAGAGCTACG
TCAGAAAGTTCTCTCCCACTGGGGACCACAAGGCGGACTCTAACATCCCC
CAGCTGTCGCCCATTCCACTGCCCCGCACACACCTGCAGTCTCCCAGGAG
AGTCTCCGTCAGACACCCCATCTACATCTCACCCCACAAAAACGGTAGGA
ACTTCTGTGAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01652.6Blg01652.6-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01652.6-exon-Sc0000168-1570713199:53454..53513Blg01652.6-exon-Sc0000168-1570713199:53454..53513Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01652.6-exon-Sc0000168-1570713199:53892..56658Blg01652.6-exon-Sc0000168-1570713199:53892..56658Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000168genomeSc0000168:25404..56658 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01652