Blg01597.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01597.0
Unique NameBlg01597.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000381:144683..159664+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01597.0 ID=Blg01597.0|Name=Blg01597.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14982bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000381:144683..159664+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CTTACATTATTTATTTTCTTGTTTCTAACATGTGATTTTCCTGACGCTCA TCTAAAGGAAAGGGAATTTAATGTTAATTCTAATTAATCGGTATAGTTGT GCTCAATTTAGTCGCAAAGTCTTCCACTAATAAATTTAGTTGTTAAAACA TTACAGGCCAAATTGACCTTAATATCTAAAATTGCAATATAATAATTTTA GTAACTTGATACCAACTTAAAAAAAAGCATAATTGAAGATTTCTCGTTAT CATTTGTATCTTCGAAAGGATCACACACACAGTCTTCTTTTTTTCAGTTG CAGCAGGATCAAAGGCTGATGACTACACACCAGGCGACGCACAGAAGATA ATCTTCCCTGCTCCAAGAGGCACCGATAACCACGCCACGCTAAAAACCAC ACTGTCTGAGGAGTTGACGAGCTTTACTCTTTGTCTGCACATGCGCTCCA ACATGACCTCAAGCCATAAAATCGGCTTGGTCAGTTATGCAGTGCCGGAA CATCACAATGAGCTTCTCCTGTATGTTAACGGTGGATTTAACGTAAGTAA AATCTTATTCGACATTGAACCATTGGCAAATTATCGTACTGTTGTATTTC ATGATAAGTTAATGCCGGATTTGTAGGCAAAATGACCAATGCAAAGGGTT TTGTGGGTTGTCCATATAGTTTAGGTTGACGTAAAATGACTTTCTTATCC CTAGTCAAGAAGGAGAATTTACTTTTCTGTGTATTGAAATGTGAAAATAT CCGAAAAATAGGAGCTCGAAGAATCTTGTCAGAATTCTTGCTGTAACGTA GCAGTCAACTTGCAGCTTTTACCCCAGTCAGTCATTTTTGCATTTGCATT ATACATTTTTTCTAGCAAGGCAATATACACATTAAAACACCAAATTATGT CATTGTTATACCGTTTCTGTAGGCATACTTCGATTGCTTGCCAGGAATAA TTTAACAAACTTTACTTAAAAAAACAACAGGTTGGTAATTAACCGATTGT TTTGCTAGATATACCACTTTCTCGTTGATGAAGTTTCGAAGAAGCTGTCC ACGTCTTGTTCTCACGGCTACTATAAAAACTCACCTAATCGATAATGTTT TTTTAATACTTCTTTTACAGTTATACATACAAAATTTCAAGAAAATGGGG GACCCAGCCGTTTGGGACGGCGAGTGGCACGCCATATGTACCACTTGGCG CAGCAGCGATGGAGTTTGGCAGCTCTACGCTGACGGCGTTCTGAAAGGTG GCGGCTCGGGGTTTAACGTGGGAGGAAAGGTGCGCAGTGGAGGGTCATGG ATCCTCGGACAGGACCAAGACATTGTGGGGGGAGGATTCGACGCCAATCA AGCGTTCGTTGGAGAACTGTCGGAAGTGAACCTCTGGGACCGCGTTCTGT CTCCGGCAGAAATGGGAACAGACTGGGCGGCGTCCTGTGATCTCCATGGC AACGTGATCGACTGGGTCACAACTAATATTGAAGTTTTCGGGGAAACAAG CAGGGCAGAATATCAATGCAGTGAGCAGGCTCCACGCTCCTCATAAATAT TATATATTTAACACTGGTTATGTGTATAGTATCACAGTACTAGTATTGTA CATCTAATGCACATTATAGTTACATTATGCTGGTGTTTTTTCAAGGTAAA TTGTACATTGTGGTATTGAGAAAATTAATCTCTTATCCTGGGATCATTGC TAATCTAAAGCCCCCCTATCACTGGACCCGCGGTACGCTGACGGCGTCGC TGCGGCCGATCGAATTAACAAAGGACTCAACAAATTTCTTCGCCAAAAAA ACGCATCTTTCTAAGCTGTGTGTGTTTTGTTGTATTTTTGGTAATATCTG TACGATTTTAATGATATCCCCATTATAAAGTCACGGGTAACATACATCCA 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AAGGAAGGGGAATTTAATGTTAATTCTAATTAATCGGTAGAGTTGTGCTC AATTTAGTCGCAAAGTCTTCCGCTAATGAATTTAGGTGTCAAAACATTAC AGGCCAAATTGACCTTAATATCTAAAATTGCAATATAATAATTTTAGAAA CTTGATACCAACATAAAAAAAGCATAATTGAAGATTTCTCGTTATCATTT GTATCTTCGAAAGGATCACACACACAGTCTTCTTTTTTTTTCAGTTGCAG CAGGATCAAAGGTTGATGACAACATACCAGGCGACGCACAGAAGATAATC TTCCCTGCTCCAAGAGGCACCGATAACCACGCCACGCTGAAAACCACACT GTCTGAAGAGTTGACGAGCTTTACTCTTTGTCTGCACATGCGCTCCAACA TGACCTCAAGCCATAAAATCGGTTTGGTCAGTTATGCAGTGCCGGAACAT CACAATGAGCTTCTTCTGTATGTTAACAGTGGATTTAACGTAAGTAAAAT CTTATTCGACATTGAACCATTGGCAAATTATCGTACTGTTGTATTTCATG ATAAGTTAATGCCGGATTTGTAGGCAAAATGACCAATGCAAAGGGTTTTG TGGATTGTCCATATAGTTTAGGTTGACGTAAAATGACTTTCTTATCCCTA GTCAAGAAGGAGAATTTACTTTTCCGTGTATTGAAATTTGAAAATATCCG AAAAATAGGAGCTCGAAGAATCTTGTCAGAATTCTTGTTGTAACGTAGCA GACAACTTGCAGCTTTTACCCCAGTCAGTCATTTTTGCACAACATTATAC ATTTTTTCTAGCAAGGCAATGTACACATAAAAACACCAAATTGTGTCATT GTTATACCTTTTCTGTAGGCATACTTCGATTACTTGCTAGGAATAATTCA ACAAACTTTACTTTAAAAAATAAGCAGGTTGGTAATTAACTGATTGTTTT GCTAGATATACCACTTTCTCGTTGATGAAGTTTCGAAGAAGCTGTCCATG TCTTGTTCTCACGGCTACTGTAAAAACTCACCTAATCGGTAATGTTTTTT TATACTTCTTTTACAGTTATACATACAAAATTTCAAGAAAATGGGGGACC CGGCCGTTTGGGACGGCGAGTGGCACGCCATATGTACCACTTGGCGCAGC AGCGATGGAGTTTGGCAGCTCTACGCTGACGGTGTGCTGAAGGGTGGCGG CTCGGGGTTTAACGTGGGAGGAAAGGTGCGCAGTGGTGGGGCATGGATCC TCGGACAGGACCAAGACATTGTGGGGGGAGGATTCGACGCCAATCAAGCG TTCGTTGGAGAACTGTCGGAAGTGAACCTCTGGGACCGCGTTCTGTCTCC GGCAGAAATAGGAGCGGACTGGGCGGCGCTCTGTGATCTCCATGGCAACG TGATCGACTGGGACACAACTAACATTGAACTCTTTGGGGAAACAAGCAGG GCAGAGTACCAATGCGGTAAGTTGCACAGACTTTTCTTTACAGAAAATTT ACAACGTGTACGTCGTTTGACTATGATGATGATGATGATGTGTAATATTA CTGGACTACAATAGCAGTCAACTACAGCTTAAAGGCATTACATGTAGTTC TTTGGGTTTAATAGTAGACTACGGTTTTGAGCTGTAATGTTTTCGACCTT ATGATCAGCTTGCTCTGAATATTCCAAATGAATCGCTTTAACATGTCTCA TCATGTCTCATCAATCTTGACTTTTTGATTCTTGTCTTTTTTTGTAGTTT GCTCCGTTGATATTGTCTTTGTCGTCGACCTTTCCTGGAGCATCGGTATG GCACAGTTTGAAGTCGCCCGGCAGTTTATCTTGGATTTCGTTCGGTGCTT TGGTAACCAGGATGTTAATGTGAGTCCTTGGTTTCGAATAGTCATAATCA 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CAAATAGGGTTGACATGCTTAGTTTAATCAGGTCTGTGTATGTTTATTCA GTCCAACTTCCGTGACGAAGCGGTACGTGCAGCCGTGGTCTTAACAGATG GAAATGCTCAAAGTGACGTCAATGGACAGGTATTGAGCACGCCTTGTGTT TCAATCCGTATAGTTTTATTATATGTTATTATATTTATGTAGCGATGTAA ACCTCAAATCAGATTGCATTTGGCCGCTAGCGAAATAGAATACATGATTA AAAAGACCTGGAGAGTCAATATTTTTTCATCATCCATCGATGATTACGAT TACATCAATAGACCTCTTTCTAGTTACGGCGGCCATTTTGAATTCCGAGA GGTCAGCTCGGGGTCACGAACCAAAACGAGGCAGTATCTGACCCATATCC TAAGTCTATAACCTGTAATGCCAGTTATATTATCTTCGGTGGTACATTTC GCCCCTCTAAGATGAAATAAGCTAATATATGTGCCTTTCATATGTAGGAA ATATTGTTGTAATTGTGGACATTTTGACTTATTTTTGGCTAATTTTTTAT TCGTTTTTCACATTTTTTGACGGGTAACTTAAGGACAGTGTCTACATTTG TATATCCTCCATTTGTACTCTCCATCGGTAACCGAGGTTTAATATCTTTA CTAGTGGAATTAAACCATAATGGTCATTGTAATTAATCTACCAGATAACG GGCGACTACGCATTCGAAGCCAACGAGGCCAGGAGTGCAGACATTGCTCT GTACAGCGTGGCCATCGGTAATCCAGTTCTTGTAAACGATGTCGCGCTGA AGGCTATCAGCGGGGAATCCGATCGTGTGTTCGACACCGACAACGCCTGC GAAGTCGCTAACCGTATACTGAAGGACCTGTGTGGTGCGTAACTTTATAC AATTTTATGTATAATTTTGTCTTTATAACTTGTATATGATGTTTACAACT CAAAATTTACTTACTAGTTCCTCTTCTTTTTCATTTGTATCATTAGGGTT TATGGTATAATTTCCGTTTGTTCTTTCGTTAATTTTGCTTCGTTTTGATT ATGTATAACTATTGCCTAGTTTCAGGGGGGGGGGCACGAAAAGCCACATA GGCTTCTGTATGGCCCCCCCTGCATGTTTTAATTTGCCCTGTTTATCTAT GGTTTTATAATTGTATACATGCATGAAAACAATAAACAACAATAGCTGCA TACAGAACACTGCACATATCAAATTCAAATTTGCAGCCTGAATTATGCTT ATGTTTCCACATGCAACAGTGATAGATAACTGAAATTAAGCAGCATGCAA AGAGAAAAGAGACTTTGGAGAACAGGGATCCCATTCGCCACCGCAATGCC TTGTTTTTTGTGTGACTAATAGTACGTTATTAATGTCAAACATCAGTGAC AGTAGTTTGCTGATATATAATAAGTTACTTGTCTCATAATATTACTTAGT AACTTACTTCATAATGTACCGGCTCACTTGACTTTGTGAACCCCATACCA TTCACCCGCTTAATTCAGAACGTATTATACATTACGGAGAAGACACCCTC CCTAAATATGGGCAATTAGTTGGTTTAGAGAATATCAATTGTATTCTTTT TTTATTCTTACAGGGTGAACCTACACGGAGAATGTGAATCAAGGACATCT ACTTCATGCCAACCTGACTTCTAGAAATATCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000381:144683..159664+

>Blg01597.0 ID=Blg01597.0|Name=Blg01597.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1131bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000381:144683..159664+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTTTGGGAAACTACTGCTGTCCACTGCTGTGATGTTTACCATCATTTG
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GAAGAGTTGACGAGCTTTACCCTATGTCTGCACATGCGCTCCAACATGAC
CTCAAGCCATAAAATCGGCTTGGTCAGCTACGCAGTGCCCGAACATCACA
ACGAGCTTTTGTTGTATGTCAATGGTGGATTTAACTTATACATACAAAAT
TTCAAGAAAATGGGGGACCCAGCCGTTTGGGACGGCGAGTGGCACGCCAT
ATGTACCACTTGGCGCAGCAGCGATGGAGTTTGGCAGCTCTACGCTGACG
GCGTTCTGAAAGGTGGCGGCTCGGGGTTTAACGTGGGAGGAAAGGTGCGC
AGTGGAGGGTCATGGATCCTCGGACAGGACCAAGACATTGTGGGGGGAGG
ATTCGACGCCAATCAAGCGTTCGTTGGAGAACTGTCGGAAGTGAACCTCT
GGGACCGCGTTCTGTCTCCGGCAGAAATGGGAACAGACTGGGCGGCGTCC
TGTGATCTCCATGGCAACGTGATCGACTGGGTCACAACTAATATTGAAGT
TTTCGGGGAAACAAGCAGGGCAGAATATCAATGCATTTGCTCCGTTGATA
TTGTCTTTGTCGTCGACCTTTCCTGGAGCATCGGTATGGCACAGTTTGAA
GTCGCCCGGCAGTTTATCTTGGATTTCGTTCGGTGCTTTGGTAACCAGGA
TGTTAATATCGGTGTCATCACGTACGACTGCGTACCGAGGACCTTCATTG
GTCTGGGCACCTACGCACTTGGAGACGCCGGTCTACTTGGAGCCATCCAG
GGTTTGATGTACAGCGGGGGTCTTAGCCGGACAAGCCTGGCTATTCGTCA
CATGACGGCTACGTCCAACTTCCGTGACGAAGCGGTACGTGCAGCCGTGG
TCTTAACAGATGGAAATGCTCAAAGTGACGTCAATGGACAGGCTATCAGC
GGGGAATCCGATCGTGTGTTCGACACCGACAACGCCTGCGAAGTCGCTAA
CCGTATACTGAAGGACCTGTGTGGTGCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:144683..144811Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:144683..144811Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:145190..145273Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:145190..145273Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:147871..148088Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:147871..148088Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:152453..152852Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:152453..152852Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:156880..157001Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:156880..157001Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:157337..157492Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:157337..157492Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:158034..158111Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:158034..158111Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:158785..159664Blg01597.0-exon-Sc0000381-1570713199:158785..159664Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01597.0Blg01597.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
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Properties
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