Blg01406.6 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01406.6
Unique NameBlg01406.6
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000046:140500..176675-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01406.6 ID=Blg01406.6|Name=Blg01406.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=36176bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000046:140500..176675- (Branchiostoma lanceolatum)
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TTCCCCCCCTCCCTCGCAGCTGACGACCTACACAGCCCTGATGCAGGTGG ATGAAGGTCACCTTGAGTCGTACCTCCAGGAGTGCCCTGACCCCTGTATC CCTTGGTGATGACCCCTGTATTCCCTGGTGTTGACCCCTGACCTCTTTAA CCCATGATGACCACTGCATCCCTTGTTGACGACTCCTGACCTCTTTATCC ATTGGTGATGACCTCTGATTCCCTGGCATTGACCCCTGACCTCTTTATCC CTTGGTGATGACCCATGATGACCACTGCATTACTTTTTGAGGACTCCTGT ATAATCTATTTGTCGTTTTAGACAACATGATTTTAATGTCATATTATCGC TGTGCCTCTATTTTCATTCTATAAAAGCATGTAGAGGCTCAGTCTATTTT CAAATTGGATATTGAAAATCTTCTGACTCTCAAGTAGCCACTTCTAGTAT ATATCCTCTAATGCTCGAAAAAGGGAATACCAATATGGTATCACAGAAAT GCTGTGTATGCTATTAGCCATTGAAATGCAAATAAAGGATCCCAATACGG CCGGTAGCATTTGTCTAGTACTACATTGATATTGAAAATGAGTGAAAAAT ATGTACTATTTTGAAATCGAAAGAGATCTGCTACTACATAATGCCAAATG TCATGGAATGTCTTTATAGTGGTCGTAAGATTCTTGATAAAATTACTGAG TAATATTCAAATTTTACTTAATAAATGTGTAATAAACTGGATAGTGAAAT GAGCACGAGTGAAATGCATAACATGCCATTGAGATTTTTTGATACTTTTT TCTAAGATTGAATATTTTCTATGATCGAATGTTTCTAGATCAGCTTAAAT AAATACCTTGCTTTTATCAATATGTTGCTCTTCTGGTGTACAATTTATGA TTTTTATTATTGTCAGAGTATACAGTTACATGTATATGAAAAAGTTATAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000046:140500..176675-

>Blg01406.6 ID=Blg01406.6|Name=Blg01406.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000046:140500..176675- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAAGTAAAACTGAGGTTTGCTGTAAAACTGGTGTGTCTACTGGTGGT
GGTGCAGGCACAAGTTCCTCCTTTTGAAGAGAAATGTGAACATGGGATGT
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ACCCTTCCTTACCCGTTTGCTGATGAGCTAAAAGGCATAGCCAAGGCCAC
AGACATCCCTCTCGGCGAGGTTGTCCTTTTCAACGTTTTCTACGAGTTTT
TTACCGTCTGCACATCCATAGTTGCTGAGGACCCATCAGGAAAGTTGTTC
CATGCCAGGAACCTGGATTTTGGCCTGTTTCTTGGGTGGGACATTAAGAA
CAATACCTGGGCGCTGACCGAGAAACTCCGACCAATCGTGGTGAACCTGG
ACTGGCAGCGCGGCGGGAAGACCGTTTTCAAGTCCGTCAACTTTGCCGGC
TACGTGGGGTTGCTCACTGCTGTCAAACCTAAAACCTTTACGTACAGCAT
GAATGAGAGGTTCTCTGTGGATGGTGGGTACATTGGTCTAATCGAGTGGA
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CTGGAAAACGCCACCAGCTTCACGGAGGCAGAGACCTGGCTTGCCAATCG
GACCCTGCTGGCACCCGCCTACTTCATCCTGGGGGGGACCAAGTCTGGAG
AGGGAGCCATTATAACCAGGTCGAGGGAGAAAGCACTGGACATCAAGAGA
TTGGACCCAGCCAATGGACGGTGGTTCCTTCTCCAGACTAACTATGACAA
CTGGGAGAACCCGCCGTTTATCGACGACCGGCGTACGCCTGGGGACAACT
GTATGGCCAACATGTCAAAATCTAATACTGACCTCCCCCACATATTTGAT
GTGCTGTCCAGCAAGCCTGTTCTGAACAAGCTGACGACCTACACAGCCCT
GATGCAGGTGGATGAAGGTCACCTTGAGTCGTACCTCCAGGAGTGCCCTG
ACCCCTGTATCCCTTGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01406.6Blg01406.6-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:163694..163772Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:163694..163772Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:163211..163285Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:163211..163285Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:161518..161563Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:161518..161563Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:160946..161090Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:160946..161090Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:153563..153617Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:153563..153617Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:152454..152620Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:152454..152620Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:151171..151217Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:151171..151217Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:148843..148966Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:148843..148966Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:148649..148705Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:148649..148705Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:140500..141506Blg01406.6-exon-Sc0000046-1570713199:140500..141506Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000046genomeSc0000046:140500..176675 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01406