Blg01264.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01264.2
Unique NameBlg01264.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000051:1700456..1720230+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01264.2 ID=Blg01264.2|Name=Blg01264.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19775bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700456..1720230+ (Branchiostoma lanceolatum)
CTGTGCCCCATTTCAACTTTCCCATTTAGCAAATCTTTGTTTACAGTCCG GGTTGAACATATTTACGTTCTCTTTGTGAAGTGTTGTCGCACTTGTCGGG CCTCACAGCAGACAAAAGTGAGTACAATACGTACAGATTAATCTTTTTTG ATAGTTCTGTTAAGGTGACATATTGGGGAAGCGCGACATAAGGTGTTGTA GTTAAGTGTTGTTTTGCAGACGACGTGATATGAATAGAAATGCCCCTCCC ACTTTTGATAATGTTAGCCGCCTTTTCTTTTAACAGTAGACCCTCGTGGA TTTCTACTTTAAATGTTTTCAAAGTTATTGACAAAGTTAGATCGATTTAG ATATAGAGGATAGAAAACTTGTGATGAGAGAGAGAGGTTTTAAAGTCGCT GCAAAAGGCCGTTTTGGAGGGAAACGGTTTTTGGAAGAAGTGGCTGTGAA ACTAGTGAGTCAGAAATAATTGAACCACTCCTGCGGAAGGGAGGGAGTAG ATACGAGAGAAATGTTCAGTTCAACATCTGTTCTCTGATTTCATCAAACA CACATCAATTTTTCTCTTTATGTCTGCATTGCATTTGATGCTTGTATTGA TGAATTGACCCACATTCTCTAGATTACTGTCAAAAACAGCACAGAACCTT TTTTCATTCTGAATGTTTTAGACACAATTTTTTGCAAGGAAAGGAAAATA GATAAGTTGAAACCATTCTAGTACTACAATGCCTTTGCAAGAGTTGACTC TATACTACAGTTGTTATTTTCTACTACTGGTAACCCAATTGTGTTTTGTG CCAATTTTCCTTATGTACTTTACTGCCATCATTATGCACAGTGCTTTGAT TGATCCAATGGTGTGCTATATTCCAACAGAGACCATTAGTGAGATTGGTT CCATGGTTAGAGATCACCACATGTGTGGGGAACCTTGAACAGGGCACAGC 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GCACAATAGCACTTTTACAACAAGTTTGTAGTAGAAAAGAAAGTATGTTA CATATGGCAGACCAACTTATAACCTCATCTGGAAATATGAGGCGTTTTTA TACAAACAGTGACAAATTTTCTACTTGATGTATCAAGTTCTACCACTTGA CAGTTTTCCAAAAGGGAAAGTTTGTGAGGTACACAATTTTACAACAGGCA CACAAAATTTGGACAAAGTTTTATCTTTTAAGAAGGAAATGACTTACAAC ATAGAAAAAACTTCTATTTGCAATGTTTTCTTAAACAGTTTGAACTATAT TTAATGCAAACTATTTATTATAGCTTTTAAGCTTTTGGAGCTGAAAATAG CAATATGCAATTTTTGAGTAGGGGTGGAGGTTGTATTTGATGTGGGGAGC ATGGTATATGACAGTTTGTATATCTGATGTTTTTAATCATGTCGGCCGCA CAGACTTAGGAATTTGCATAGGGTTTTGTGCAAGGTTTTAGTTGCAATAG CAGTGTATTGTATATTTTATATATATACAGGTAGAGAAGAAGGGCATATA AATTGGGTGAAATTTGTTTGCAATTTTTACATGCAATCAATGTTGCATGA TTTGTAAGTTGTTTGATATGCACAATACTTTTGCATACAGGTAGATCTAA ACTTTTTTGTATGGCAATGAAACTTGAAGTTTAACCCTCATCACTCTACG GGTGTCCCAGTTTGGACACTGGCAGCATAGAGTAATGTAAGTTAAGAACT GAAAATGCAATGCTCTTTCGTTAAGTGCTATCACCATGCAAAGTACTTAT AGCAGCTGTGTGCTGGTTTAGAAATTCTGGTTTTCAAAGTTGCCCGCCAC ACATATTCCCTTTCTTCGACAATGTTTCAAATAAACTACTTACTTTGCAA TTGAGTTGTGGTAGGAAAAGAGGTGTAAAAAAGCATAGTTGGGGGAATTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000051:1700456..1720230+

>Blg01264.2 ID=Blg01264.2|Name=Blg01264.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=765bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700456..1720230+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCTGAGTACAAGTCTGCGAAGGAGAAGAAGTCCAACACCTTGGGCTG
TCTGAAGGTTCTTCTCCTAATCTTCAACTTCCTCTTCTGGTGTTCTGGTG
CGGCAGTCCTGTGGCTGGGCATCTGGATCCTGCAGACGAAGACGAAGTAC
GTCGCCCTGCTTAACTCGGCCACATACCCAGCCTGCGCCTGGATCCTGAT
CGTGGCGGGGGTCATCATCTGTATCATCGGCTTCGTGGGCTGCTGCGGAG
CCATCCGCGAGAACAAGACTTGCCTTATTGTGTACTTTGTCTTCCTGCTG
ATCATCTTCCTACTGGAGATCATTGCTGGTATCCTGGCCTACGTCTACCA
AGATCAGCTGCGGGGAGAGCTGAAGGGCGGTCTGAACTCCACCATGATCA
TGCAGTACATGGCCAAGGGGTCAGAGGGCATCACCGGGGCAACGGACACA
CTACAACAGGACTTCCGTTGCTGTGGAGTCCTAAACTGGCGGGACTGGAA
GGCCAACAGTCCGTATTTTAAGACAGGGCTGGCCAAGAACATGACAGCAC
CAAACAGCTGCTGCATATCACCTTCAGACGGCTGTGCAGTCAGGGACCAC
CCCTCCAACATCTACCACGTGGGCTGCCTCGATGCCATTGAGTCGTACAT
CAGGACATACCTGTTCATCATCGGGGCTGTGGGCATCAGCATGGCCTGTC
TCATGTTTATTGGAATGATCCTGACGTGCTGCCTTCACTCAGCCATCAGA
AGGAGCGAGAGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.2Blg01264.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1700456..1700572Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1700456..1700572Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1706243..1706294Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1706243..1706294Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1714541..1714615Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1714541..1714615Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1714979Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1714979Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1715568..1715726Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1715568..1715726Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1716295..1716378Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1716295..1716378Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1717980..1720230Blg01264.2-exon-Sc0000051-1570713199:1717980..1720230Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000051genomeSc0000051:1700456..1720230 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01264