Blg01264.13 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01264.13
Unique NameBlg01264.13
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000051:1700472..1715802+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01264.13 ID=Blg01264.13|Name=Blg01264.13|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15331bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700472..1715802+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CTGAATGGACTTGACATTGGGGTTGAGTTTGAGGTTTTCCAAGGTTAATT CAAACCCTGTGGCAATTCTAGCAGATTTCTGAAAGTGGCACATAGCTTCT TGGTTTATTTTTTTGTAGCAAAATCTTTACAAGTTGACACTATTAAAAAC GAAGAAAATTCTAACTTGGTCCTTAATCTTTAACATTCACCTTGTTGAAC AAGAAAAAGGTACGTCATTATTGTCATCCCTGAAGACAAGGACTGGAGGT CCCTTTTTAACCTCCTTGCTGAAAATAAGGCAAGGGAAAAAAGGACTTTT ACTTTTCCGTGGTTTCTTCCATTTGTAAGTTATTTCCTGTTCCAGTTCCC CAAGCCTCTTCAGTTTTATCCCAGTGTTTGTTGGTGGTGTGGTTTCTCAG CTACCAGCCCTTGCTGAGGGATCCCAGATTAGTGTAGGTGCCCCATAATG AGATGTTATCAAGAACAGCCAGAGAAAATAACCACTGCCTTATCCCTCTC CTCTAATGAACCTGTCTTCTCTTATCTTGAAAGCTGTCCATCAACTTGAG ATCCTTTAGCAGAGCCACCTAGTGAGATGTAAAAGTATTGCATGGTTGCT TAGATTAACATGCAATGTCAGGAAAGGAAAGATTCGTGTTTGATGAATTT TCGTTGTCGATTATTAGAAATTCTTCTGAAACTATATATTATAAGGGTTT TGATCTTGTATAGTGTTGTTGTTTTTCTCCAATCATTTTCTGACAAATTT CTGTCAAATCTCTTTAATTTTGTCTCAGAAACCTTAAAGCTGTCCCTGAA ATTAGGTCAGTGTTTTAACAACCTAACTCTTGCTATTGTAGGAAGTTAGT GATCTGTGACAAAAGAAAAAAAAAACATATCTTCTTTTTCCACGGTGAGA AAAAAACGTCCTTTTTTGTTATTCCATCATTACAGCAAAATTCCTGTCTG 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TAAAGACTATAAATTTACCTGAGTCATTTGCTAAGCTCCTTTGAAAACGT AAGGCTCGGGCTTGGTATGATAAACAATCATTGAACCTCCAGCACAACTT TATTTCTAACAAAAGAACACAGTTGCGTTGTCTCAGAGTCCTTGTGGTAC TGTTTGGTGTTTTTGTTATTTCTTACACAATGTTTACCACTGGCTTTAAG ACCAGGATTTTCCCTGGCCTCCATAGTATCAAGGAGGTCGATAGCATACA CTCTGGGCCTTTTGGGGGGATTATAGTACACTTTTGCTGATGATATCTTT TTGTACTATTTTGTGTGTGCAGCCAGCCCATAACCATGAGCCTGCATGAA AACGGGCCATGCGGTTACAGGCTGGCTGCACAAACGACCTGCCAGTACAA AAATCAGCCAAAGTGAATTATAAGCCTAAAAAAGAGCCTGCTATGGAGGC TAGTTTTTTCCATCAACTGCTATGTTAAAATTGCTTCCTTCAGGTTAAAC TTTTGAAATGGCAAGACTTAGAAGATCCCCTCAGGTTTCTTTACTGTGGT ACAGAGATGAGACAGGATGTGACACTAGGAAGGAAGGAAGTAGGCAGGTC GTCATGTCTGAACTGTGCCCAGGTGACCTCACCTGGTGCAGGGGTTTGTC TCACCTGGTGGTGCTGGCACACCTGGGGGTCTGATTGTCCCAGCTTAGTC CTGTCTATTGTTGTTGTTGAATCCTGCTGAAGTTATGTTTTTCACTAGCA TTTCATTGTTGGTTTGTGGCCAGAATATCTCTGATGCAGGGCCCCAGCAG CTTCTGTTTGAATTGCAGCCTTCTTTTTAGCCTGGAAAGATGAAGAAAAG AGCTTACTTTATCCCTAAATGACTTGCCAACCTGGCAAAGCGACCAGTAT CAATAGAAAAACTTGTGATATGTTTCTTTTTCAGCGACCTGCCACAGAGA 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TACTGTCTGTCAAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTGAATCCCATATA TTGTTGTCAACTAAAATGTTAAATTTAAGACTTNGTCATCTTATCAACTG TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTGACGTTTGTATTGTTGCCATGACAA CAGCTGCGGGGAGAGCTGAAGGGCGGTCTGAACTCCACCATGATCATGCA GTACATGGCCAAGGGGTCAGAGGGCATCACCGGGGCAACGGACACACTAC AACAGGACGTGAGTTTTTTTTATGTGTCAACTGAAAGCTTAAAATGTATC TTGTGATTTCTATTGAGTTTTTGATTTTTCAAAAAATGAAATGTGCATAT AACTGTTGACAATTTTTCGTCCCTTGTTAAAGAATTTGAAATCTCAGACT ATCAAATCTTAGGGTTTCTGTTGAGTTTTTAATTTAAAAAAAAATGAAAT GTGTATTGTAACTATTGGTGATTTTCTGTCCTTGTTAAAAAATTGGAAAT ATCAGACTGTCAAATCTTATGATTTCTATTGAGTTTTTGATTTTTCAAAA AATGAAATGTGTATATAACTTGGCGATTTCCTGGCCTCATCTCAGACTGT CAAATCTATGATTTTATTGAGTTTTTTTATCCTTCATAGAATGAAATCTG CCTAGCTGTTCCTCTCCTTGTTAAATGATTGGAAATCTCAGACTGTCAAA TCTTACGATTCTTATTCCTCTTCTTGTTTCCCGATTTTCTGTCCTTGTTC AAAGAATCTCTGACTATGAAATCTTTATCTTTATTGAGTTTTCAAGAATT AAATCTGTTTAACTGTTGGCAATTTCCAATCATTCTCTGCACGCAGTTCC GTTGCTGTGGAGTCCTAAACTGGCGGGACTGGAAGGCCAACAGTCCGTAT TTTAAGACAGGGCTGGCCAAGAACATGACAGCACCAAACAGCTGCTGCAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000051:1700472..1715802+

>Blg01264.13 ID=Blg01264.13|Name=Blg01264.13|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=660bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700472..1715802+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCTGAGTACAAGTCTGCGAAGGAGAAGAAGTCCAACACCTTGGGCTG
TCTGAAGGTTCTTCTCCTAATCTTCAACTTCCTCTTCTGGTGTTCTGGTG
CGGCAGTCCTGTGGCTGGGCATCTGGATCCTGCAGACGAAGACGAAGTAC
GTCGCCCTGCTTAACTCGGCCACATACCCAGCCTGCGCCTGGATCCTGAT
CGTGGCGGGGGTCATCATCTGTATCATCGGCTTCGTGGGCTGCTGCGGAG
CCATCCGCGAGAACAAGACTTGCCTTATTGTGTACTTTGTCTTCCTGCTG
ATCATCTTCCTACTGGAGATCATTGCTGGTATCCTGGCCTACGTCTACCA
AGATCAGCTGCGGGGAGAGCTGAAGGGCGGTCTGAACTCCACCATGATCA
TGCAGTACATGGCCAAGGGGTCAGAGGGCATCACCGGGGCAACGGACACA
CTACAACAGGACTTCCGTTGCTGTGGAGTCCTAAACTGGCGGGACTGGAA
GGCCAACAGTCCGTATTTTAAGACAGGGCTGGCCAAGAACATGACAGCAC
CAAACAGCTGCTGCATATCACCTTCAGACGGCTGTGCAGTCAGGGACCAC
CCCTCCAACATCTACCACGTGGTACGACCAATTGGAACTGGCTTGTCATT
TTTGTCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.13Blg01264.13-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1700472..1700572Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1700472..1700572Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1706243..1706294Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1706243..1706294Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1714541..1714615Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1714541..1714615Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1714979Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1714979Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1715568..1715802Blg01264.13-exon-Sc0000051-1570713199:1715568..1715802Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000051genomeSc0000051:1700472..1715802 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01264