Blg01085.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01085.1
Unique NameBlg01085.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:201496..240361-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01085.1 ID=Blg01085.1|Name=Blg01085.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38866bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:201496..240361- (Branchiostoma lanceolatum)
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CGTGGACGACCAGTACGAGGTGTTCATGGAGAAGTCGCTCGAGAACCTCG AGTCCGGAACAACCTATGACTCCGACGTGCCCAACGAACTAGCCTTCAAC AACCAACATGGCCGCCAGTCGCCCGTCAAGAACCAACATGGCCGACAGTC CCCGGTGAAGCGCCCCGACCAGCTGCCAATCATGGAGCACCGCCCGCAGG AGTCCCAGCATGCACTGCAGCAGCGCGGCTACGATCACTTCGTCCAGCTG CCGCACAAGGACATTCAAGGTCGCGGGGACTTCACGCCCTTGGCGCAGAC GGAACACAGACAGCGCGGGTCACACTCAAGGTCGTCAGGGTCAAAAGTCA GGTCCCCTACTGGGTCTAACCCACGGTCACCTGCGGGGTCTAACCCACGA TCACCCATGGGGTCTAACCCACGTTCACCTGCGGGGTCTAACCCACGTTC GCTGGGTGGATCCCACGATCACAGATCCCACGCAGGCAGTCAGAGCGACC GGGGCAGCGCTCGCCGGCGGTCCAGCAAGAAGAAACATCCGCCAGTCTAC CTGTAAACAACTGTTTACCTGTTTACCTGTAAACAGTTGTTTACCTGTAA AGACTTGTAAACATTTATGTCTACTTCTGAACAGCTGTTTTCTTGTAAAC ATTGTTTAACTGCATACAGTGTTTATCTGTAAACACATGTTTACTTGTCA GCAGCGTAATTCGGGATCTGATTAAGAGTTGCTAAATGATTATGTTAATG AGGGGAGGAGCAGTTGTACATATTTTGCTAGGATGTTGACAGGAATTGTG GGATAGCGGCACTTTGGGGGTGGGAGGTGGCTTCTTAGTGCTTATCATTT AACCCTCTGCCGGCTAAGGGGGCCACTTGGCACCAGATCTGTACTGGTTA CCGGGTTAGGCAGCAGGAAGAAGGTTAAATATCATATATTTTAGCCACTT 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TATAGCTTTCTCTCCATGAAAGTTTCTGTACTACAGGCTGTAATTTTACT GCTTGCTCATTGCCGTCTCTTTTGTTTGTTTGTTATTAGCTGGTTCATTG TTTATTTGTTGAAGTATTTTGGGTGACATGTCAAAGTTGAAGCCTCTGAG AAATACGTGAAACATGTCTGATCATGAATGGTCTGGACAAGACCTGTTAA CTAATAAGGGGCCTTGACCTTTGACCTTGTGCATGCACATTTCAAACCAT GAACCAGCCTATTAGTACAGACGTTGTTACGTTACCATGGTTACTTGTTT TACTTACCTGCACAGCTGCTTATGTAATGTTTCTGATTATTTTAAAAGTC TTCCTTTGTTTTATAACTACAAAATGTCACACATTTGTGTGTTAACCTCC GTTCTGCTAAGGGCTCATCCACATGTTGGGTACAGAGGAGCTCGGTAGCA AAAGGGTTAACAGTTGAAAGAAAGGGTAGTGAACTACAGTACCAGCAAGG CAGAAAATGAGAGAGAAGTACAGAAATGGGCCAAACACTTTCACAGGGAG AACATATTCTCAAGATTACTTGATGTTTATCTTGAGGACATTTGGTGAAG TCTTGGGTCACTAGTTAAGGTGCCTGCTGTGCAAGGATCATGACATAAGG AAATCTAGTAAGGACACAATAAGAACCTTTCTGGTCTTGGATGAGATCTT AGACGTTCAAGGTCTATGTGAGGATAATCTTAAGATGCAGAGGAAGGAGA AGGTCATGCTCAAGGAAAATGTGAGGAGAATGGAGTTACGAAATTATAGC AAATTACGACGAGTTGGGTTTGAGTTCCGTGCTGAATTTACCTGAAAACC TGAGTTAAGATTACTCTTAAACTCACTGGTGATTTCTGATGCAATAGTGG AGAATGATTAACCTGTTAAGGTGATGTGAATATAGCAATGTTTACGGTAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:201496..240361-

>Blg01085.1 ID=Blg01085.1|Name=Blg01085.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2640bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:201496..240361- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGCCGATATCGTGGACAAGTATGACAGGGGAAGGGAGGACAGTGCGGAGA
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GAACCGCACCTACCGGAACCACATCATGTTCCGCGACAGATACGGCGTCA
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CTGCGCTTCCAGGACCACCACGACAAGCTGCTCGCCAAGTTCCTGCCCAA
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TGAAGTGGTTTTTCCAGTGTTTCCTGAGCCGAGTGCCCTTCAGACTGGTG
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CATGGCGCTCACCGTCTTCAAGATGCACAAAAAGCGGATAGCTAAGATGG
AGATCGAGCACCTGGCGACCTTCTTCCAGCGCGACCTTGAGGAGGATTTC
GGCTACGACGACGACGAGGTCATCGACCAGCTCCAGCTGACCATGAACGA
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TCCCCCAGATCCCGTTCGGGTACCGACGGGAGTACACCTTCGAGGAGATG
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GGCTGCCACAGAGAGAACCCTCCTGGAGAACAACCAACCTGGACAACCCG
GCACCCAGCAGGACAGCCGCGGACAACCCTGCCAGGCAGCCCTCCGTCTC
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GTCCGGGGGGTCAGGTGTTCCACATGCCAACCCAGCACTTCGAGAGGAAC
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GAGGTGTTCATGGAGAAGTCGCTCGAGAACCTCGAGTCCGGAACAACCTA
TGACTCCGACGTGCCCAACGAACTAGCCTTCAACAACCAACATGGCCGCC
AGTCGCCCGTCAAGAACCAACATGGCCGACAGTCCCCGGTGAAGCGCCCC
GACCAGCTGCCAATCATGGAGCACCGCCCGCAGGAGTCCCAGCATGCACT
GCAGCAGCGCGGCTACGATCACTTCGTCCAGCTGCCGCACAAGGACATTC
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TAACCCACGGTCACCTGCGGGGTCTAACCCACGATCACCCATGGGGTCTA
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Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:213144..213229Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:213144..213229Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:212337..212417Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:212337..212417Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:211823..211930Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:211823..211930Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:208774..208883Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:208774..208883Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:208449..208563Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:208449..208563Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:207764..207913Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:207764..207913Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:206912..207077Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:206912..207077Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:201496..205702Blg01085.1-exon-Sc0000003-1570713199:201496..205702Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01085.1Blg01085.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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