Blg01085.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01085.0
Unique NameBlg01085.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:204286..240585-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01085.0 ID=Blg01085.0|Name=Blg01085.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=36300bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:204286..240585- (Branchiostoma lanceolatum)
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CGCAGCCCAACGGGCAGCCCGCGACGCGAGTACGGCGCCCCGGGCAGCCC GCGGCGGGAATATGAGTTCCACTCGCCTGGTGGCGGGCCCTACATCACGC CGGGCGGAAGCCAATCACAGCAGTCCCCGCCCAGGATGAACCAGAACGGC CTGGAGAGGCCAAAGGTCAATGGTCGTGACCCCAACCGCGACTCTGCGTA CTCGCACAACTCGGACTACGACAACGTGGACGACCAGTACGAGGTGTTCA TGGAGAAGTCGCTCGAGAACCTCGAGTCCGGAACAACCTATGACTCCGAC GTGCCCAACGAACTAGCCTTCAACAACCAACATGGCCGCCAGTCGCCCGT CAAGAACCAACATGGCCGACAGTCCCCGGTGAAGCGCCCCGACCAGCTGC CAATCATGGAGCACCGCCCGCAGGAGTCCCAGCATGCACTGCAGCAGCGC GGCTACGATCACTTCGTCCAGCTGCCGCACAAGGACATTCAAGGTCGCGG GGACTTCACGCCCTTGGCGCAGACGGAACACAGACAGCGCGGGTCACACT CAAGGTCGTCAGGGTCAAAAGTCAGGTCCCCTACTGGGTCTAACCCACGG TCACCTGCGGGGTCTAACCCACGATCACCCATGGGGTCTAACCCACGTTC ACCTGCGGGGTCTAACCCACGTTCGCTGGGTGGATCCCACGATCACAGAT CCCACGCAGGCAGTCAGAGCGACCGGGGCAGCGCTCGCCGGCGGTCCAGC AAGAAGAAACATCCGCCAGTCTACCTGTAAACAACTGTTTACCTGTTTAC CTGTAAACAGTTGTTTACCTGTAAAGACTTGTAAACATTTATGTCTACTT CTGAACAGCTGTTTTCTTGTAAACATTGTTTAACTGCATACAGTGTTTAT CTGTAAACACATGTTTACTTGTCAGCAGCGTAATTCGGGATCTGATTAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:204286..240585-

>Blg01085.0 ID=Blg01085.0|Name=Blg01085.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2640bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:204286..240585- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGCCGATATCGTGGACAAGTATGACAGGGGAAGGGAGGACAGTGCGGAGA
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GAACCGCACCTACCGGAACCACATCATGTTCCGCGACAGATACGGCGTCA
AACAGCAGGCGTTGTTCCACGTGCTGTCTGCGTACTCCATCTACAACACG
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CTGCGCTTCCAGGACCACCACGACAAGCTGCTCGCCAAGTTCCTGCCCAA
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AGATCGAGCACCTGGCGACCTTCTTCCAGCGCGACCTTGAGGAGGATTTC
GGCTACGACGACGACGAGGTCATCGACCAGCTCCAGCTGACCATGAACGA
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TCCCCCAGATCCCGTTCGGGTACCGACGGGAGTACACCTTCGAGGAGATG
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GGGGGTCGTCAGGGTCGACGTTCAAAGGTCGCCCAGCCCCACCCCCATCA
GGACTCCCTCCAGGGAGAACTCCTACAGGCAGCAGTCGCCAAGGCAACAG
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CTGATTGGTCAGCACCTCGCGGCTTTGTCAGCCAACCACAGGACGGCGTG
GCGTCCCCGCCCAAGGAAACATGGCGGGCGACGGACCTGGATAGCGCCAA
CGCGGCGCCGAAGGCTTCGTACAACGAGCGGCCAGCTCTGCAGAACGAGC
GGCTGCCACAGAGAGAACCCTCCTGGAGAACAACCAACCTGGACAACCCG
GCACCCAGCAGGACAGCCGCGGACAACCCTGCCAGGCAGCCCTCCGTCTC
TGGCCAGCCCCACCCGGCAACCGTCTCCAGCCAGCCCCACCCGGTAACCA
GTCCGGGGGGTCAGGTGTTCCACATGCCAACCCAGCACTTCGAGAGGAAC
GGGAAAACGGTGGACGTCACCGTCCAAATAAGGACTTCCCCGTTGCCTAG
CAACGACCGTCGCAGCCCAACGGGCAGCCCGCGACGCGAGTACGGCGCCC
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TACATCACGCCGGGCGGAAGCCAATCACAGCAGTCCCCGCCCAGGATGAA
CCAGAACGGCCTGGAGAGGCCAAAGGTCAATGGTCGTGACCCCAACCGCG
ACTCTGCGTACTCGCACAACTCGGACTACGACAACGTGGACGACCAGTAC
GAGGTGTTCATGGAGAAGTCGCTCGAGAACCTCGAGTCCGGAACAACCTA
TGACTCCGACGTGCCCAACGAACTAGCCTTCAACAACCAACATGGCCGCC
AGTCGCCCGTCAAGAACCAACATGGCCGACAGTCCCCGGTGAAGCGCCCC
GACCAGCTGCCAATCATGGAGCACCGCCCGCAGGAGTCCCAGCATGCACT
GCAGCAGCGCGGCTACGATCACTTCGTCCAGCTGCCGCACAAGGACATTC
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GGGTCACACTCAAGGTCGTCAGGGTCAAAAGTCAGGTCCCCTACTGGGTC
TAACCCACGGTCACCTGCGGGGTCTAACCCACGATCACCCATGGGGTCTA
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Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:213144..213229Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:213144..213229Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:212562..212601Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:212562..212601Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:212337..212417Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:212337..212417Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:211823..211930Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:211823..211930Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:208774..208883Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:208774..208883Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:208449..208563Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:208449..208563Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:206912..207077Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:206912..207077Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:204286..205702Blg01085.0-exon-Sc0000003-1570713199:204286..205702Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01085.0Blg01085.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:204286..240585 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01085