Blg00914.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00914.3
Unique NameBlg00914.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:5391265..5435045-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00914.3 ID=Blg00914.3|Name=Blg00914.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=43781bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5391265..5435045- (Branchiostoma lanceolatum)
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AAAAGTTGTTACCAGGCGGTTATCAATTTCGATGTCAACAAACATGTGTC AGAATTAAGTAAGGAAAGATTCATCACATTGCCCCGGGGGCTGGAGATAG TGCATGGTAAAAACAGCTCCTATAAATCATCATATGTCAGTTGCGTAATG TATTCAAAGCCTGAACGACTATGCATAATGCTTTATATTAATTTGTTCGT GCAAGGCTTCCTTTTATTGAACGTTTAAGTAAATACGTCGATGAAGGTTA GACATCCAGGTAAGAAGCTTCACCAAATAGCAGTTACTCAAGCAACTCGA TATGATTTTGGAAAATAATATTCAGTCGCTTGAGTAATTGCTATTTATAA AGTAAATACATGTCCAGAATAAAATGTGAAAACATGTTGCCAGGAAAACA TAATTGACCGGAGTAGAATGTCAAGGCATCAATACCTGTACTGCATTTTA TAATCATAAAAAAATAGATGTGAAGTGAAAGACATGCAGTTAGCTGCAGG TTACCACTGAACGTAATTTACATTGCTCGTCCTGAACATGCATTAAGGTG CCTTAAATTGCATCGCACATTCATCACAAACCATTTAACAAGCTGTGAGG AGTAAGGTGTTTTAAAGAAGGCAAATGACAGGCTGAAAGTTTTCCAGCAT CACTCCACATCAATGAGGGACCGCGGGAGCGTTACCTTGCCGGCGGTCCG GCTTTTAACTGTACCGACGTGGGAGTACATCTGTTTGATCTTGTGGGAGA AATATGCGGTTGAGGAGTATTCTTTAAGATAATGTAGTCGAGTCATGATC CCTCTGAGCCAGCATGCTCTTCCCTCTTTACGCCTTAGTTCTGCTACAAC AGTCTTCAAGAAACGTGCTTTGTAAAAGGATCACAGGTGGTACATTAATA GTTATCCCTCTGTACGTCAAAAGGTTTTCCAAGGACGTTAATATCAAGGT 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AGTTAAAGTACACACCAGTTGAATAACTAAGAAACTATTCATGTGGGGCA GATTCTTTTACCCAATCGTTTGCTCAAGGCGAAATTACTTGATGGATGTT TCATCTTCTTCGCCTTGTCCTTTTGTCACTTTAATTGTAATCACCATTTA TGATACATTTTCTTAAAAATAAAACAAATGCAATTACACCTTCATACACT GATAAAGAAAGCGTATGACATTCTCCATTAAACAATTGATCACATAATTT GACTTCGCTTTGAAAGAACGTCAGGATTCAAAATAAATGCCTTCCCAATC CAATTCGTTAAGTGCATACATAGTGCATCAGGTGTACGCCCAAGAAACCT TTCAAAACATTAAAGTCTTTTCGCGATTGATTAAAGCATTTACCACTTCC ATCGCCTCTCAAAGATGCCGCTGCTGGCACATTGCCAGACATTATGATGT CACTGTCGACTTGTGTGTTAACTTATTACGCGTTAGATGAAGGCATCGGC AATCACATTTCACGCTTGAGTGTCTCTCCTTAGAATACATCGGGTGCTAT CATCTGACAGAAGTAACAGCACGTTGGATCAAATCCAAGGAAACACGTTG CACGCTGAAGACGTAGTTAAGTAAAGTGTAAACTCTAGAAAAGTTTTCTT TCATGGCCTCACACGAGAAGGTATAACCCTAACCCTAGCCCCTAACTTTA ACCCTCTAAGTCTTAACCTTACCATACGCCTAGTCTAACCCTAACCTTGA TTATCTTGACTCTTTATCTTCTTCTCTCCTGATCCTCCACAGTAACGTAT GATTGTAAAATATATATGGTGCAGGCTTCCCACGGACGGTTTTGTATCTT ATCTATTTGGTTCAGACTTGACAATGTGACTAAATACTGTTGAATGCAGA AATTTTCGCGGTGGTTTTATGTTCGCGGTTCGTCTGAAACTCTTCAGCAC GAACTTAAAACTAGCGCGAAACTTTTTGCCCACCTATGACTTCATCCCTA CTACTAGTATTGTTTCAAACGCGAACTTAAAACCACCGCGAACACGCCAT TTTCTCCCTACAGCGAAATCAAATCCCCGCAAAATTATATGCATTTTCAG TAGTTCTTATATTTTGCCTTTTCTCCACAGTTTCTGGGAGTGTGGCAGCT GGGGTACCTGATGTGTGACGTGTTCGTGGCGTTAGATGTAATGCTGTGCA CGGCCTCCATCTTTAACCTTGTCGCCATCAGCATTGACAGGTAGGTCATC ACTTCGAATCGTTGACCCCTAACGGCCGCTCTGGCGTCAGAAGGCCGGGC TGAGGTCGGCGGCATTTCTTTGATCTAACATTAAGCTTGTGAAATCCTTG TCAGACGGTAACTAAAGAGTTCAATCCGAACACACAAAGCTTTTCATCGT GCGCAACAAGACACATTGTTTATAGAGACATCATGAAGGTAATTACTACA CAAGGCTTCTAGCCTGGAGCTACTTGTAGTATTTTTAAAAGTTCGCGTCA GCGCTATCGTCACATACTGCTACAGTAGTGTACATAAATGTTTGCTGTGG CTTTAAGTTCGCGGTGAAACGGTTGCCGCGAAAACCGCGAACATAAAACC ACCGCGAACATTTTGTATTTACAGTACTTTCTTGGCAGCTTGATAAGTCA TCTGTCTCGAGCTAGCGAGACAATATAACTTTGCCTCCAGTCTTGGTCGA GATGAAAATTTACAGGCTTTGACAATAAAAACCAACAAGCTACAGATATC TTTAAACACTCGTTCTCATTTATATGTACACATTTCAAGTGTAACTTCCG TTACCGTTTGAAGCAAGACGTTTCTGACGTTAAGATATGCCACGTATAAG GTGCCAAACTGTCGTTTTCAGAAGCCAGAGAAGTCTTAAGTTGTCATAAA 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AAAAAAGTAGACCCCGGTATGAAACAGAAAACTCTTTGCAAGCTAGCAGA AAACGGCACATATGAATTCTCAAAAAATAGACCGCCTAATACGAGAAGAT TCGTGATTCAACCGTTAGTTTTGGTGAAAAAGCACATGACAGATTCAAAA TGCGTCAGAATACGTAGTAACTGAAAGGCGCGCAGCAGGATAGTAGCAGC CCATCTTCATTCCATTGCGCCTCGACCGGAAAGAGGAAATTGCTTGACGT TTGCAGAGGCGACAAAGAACACGTCATGATTCGTGATTCAACCGTTAGTT TTTGGTGGAAAAGTCCACGAGACATTCAAAATGCGTCAGAAAACGTAGTA ACTGAAAGGCCGCGCAGCAAGATAGCAGCAGCCTATCGTCAATCCATTTC GCCTACACCGGAGAGAGTAAATTGCTTTTAAGTATAAGCTGGGGCGACAA AGAACACTTCATTACTCAAGTAAGTACCTTGCAACTACAAGGTTAGCATC TGACCTTTACGTACAAAGAACTAATACAGTAACAGACTTTAGAAAGACAG AGCCCACTTCAATTAGTGCTAATGGTAACGTTGGAGCACCTGGTACAAAC AAGTTCTAAAATAGACAGTATAATTCCTGCGAAATCCTGAGCTCCTACTC GACAACAATGGTGAAAATACCGACTCCTGAAAGCCGTGCTGTCTGAGTCT TACATGAATGGTAAACACGCTTTCTTCAATTGTCTATTGGTGGGCGTTAT ATATGCTATGGTTCCTGCGAGAGTTTCTGCTTGTACGTACAAAAGACAAT TTAAAATTCTCGAGCAATATTGCCGAAAGAAGCGTCACGTGAAGTAAACA TCAATGAAACAGAATAAGGATTAGAATGGACACATATCTCCTTGAATTCC CAACAAAATACCAGTCTAGCACGCCGATTCTCCCGGTAAAGATCTCTGTA GGAGTCTTCTGTCGGCAGGGACTCCGAACATGATGCTAGGAATTTGATAA CAAAAAAAAATTCGCCAAAAAACGATATTTCAAGATATTCGAGTTGACAC GCGTCGTTCTTTGAGTATTACTATCATGTACATTCCTGCAAAGTTACATT GATGAACATCGAATCACAAGCCAAGGAGAGCGTTTTTTTCTAAAAAAGGG GCGTGGCCTTTTAAATCTTGATGACGTAATCATGACATCATACTAATTAG CATAAATTATAACCTTGCTATAAGGTACTACCTGAAAAAAAATTAAGGTT GAGGAAGGTTTATAAAGCTTAAGAAAGGTTTTTTCAAAAACATCCCAAAA TTCCTCAACCACCCTTCAACAATACCTTAAGGTGGTCTCCCATTTGTAAG ACATGAAGTCAATCCATTGATCTAAAGTGACAGGAATCAATGTTTAAAGA AAAATGATCTTTAAATTAACAGACTCCGATCGGGATCTGTCTGATTGCAA TCACTGCCTGGCATATATCTCGAGAATTAACAGCTGCATCCGCAATAAAA AAGAGTTTCCAGGTGGAAAGGACGTTAATCCACATTTGAAATCTTACGTA AATGATCTCTGGCGCAGTAGCTTAACAGCCTGTAGCAGGCTTTGATGTTT GCTCAAGATATCTAGGATAACATAACAGCTGGCTTTTCAAACTGCAATAC CGTTTATACTAATAATCCTAGGATGTAAGCACATCTGTGTTCATCGATTT TCGTAATGAAAAGCTTTGATATCAATAAACGGCAAGCATAAATCTTGTGC TTGAATTGGCAAGTACATAAAACTTTAGCAGGTTGTCATTTCCAATGGTA TGCTTCATGCTGACAAGCGGATAAATCTATAAGTACAGTGAGGATCGAAT GTCATTTAATCAAGAACAGACACGGTCAATGATTAAAGTTAATTCCACCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:5391265..5435045-

>Blg00914.3 ID=Blg00914.3|Name=Blg00914.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=579bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5391265..5435045- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGGGGAACACGACGATTTATCCGACGGTGTCAGGGTTCGACGTGCC
CCGAAGACCTGGCAACGACAGCGCGGCTGGTTGGAACGGCACCGACTGGG
AAGACACCGGGTCCTACAACTTCGTTGCCCTCCTCCCCATCCTGGTCATC
GTGGAGATCCTGACCGGCAACGCTCTGGTTGTCCTCGCGATCTACCGGGA
GAAGAACCTGCAGTCCACGACCAACTACTTCATCGTCAACTTGGCGGTCA
CCGACGCGCTGATGGCGGTTCTTGTCATGCCGTTCGTTGTGTATGTGGAG
TTTCTGGGAGTGTGGCAGCTGGGGTACCTGATGTGTGACGTGTTCGTGGC
GTTAGATGTAATGCTGTGCACGGCCTCCATCTTTAACCTTGTCGCCATCA
GCATTGACAGGTTCTATGCCGTGACGTGGCCAGTTCGCTACTCCAAGCAC
AAGTCCAACACCCGGCTGTCCATTACCATCACGCTGGTGTGGACCTTGTC
GTTCGTCATCTGTGCACCGCTTCTGTTCGGGTCAAACTACCCTCCCACGG
GGCAACGGTCGCCAGAGATGTGTGGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00914.3Blg00914.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5434678..5435045Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5434678..5435045Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5395806..5395915Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5395806..5395915Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5391265..5391464Blg00914.3-exon-Sc0000003-1570713199:5391265..5391464Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:5391265..5435045 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00914