Blg00706.7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00706.7
Unique NameBlg00706.7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:7941408..7956561+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00706.7 ID=Blg00706.7|Name=Blg00706.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15154bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7941408..7956561+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GGACTTACAGAAGGTATCGAATGATTGAATAAACAAGTAAAAGAATGAAT CTATATCTACGTGTCGTACATATCTTTTGATCAGCTGTACTGTATATTTG ATTGGCCGTAACAAATTCTAAGACTTTCTGGAGGAAAGCAAATTCAAGAT TTATGAGTCATTCCTTTCAAGGATTCAGTCACTCAAAGAACTTATTTTGG GGTTGAATGGATGGCTAGAAAATTATATATCCATTCACCTACATGTGCCC TATCAATTTCTTTTTAATCACTCTATAAACTCTATTAACAGAATAAAAAG ACTCTTTTTTACACAACCAAGAGATCTATTCAACCCACGTTTCGGTGACC ATCTGTCACCTTCTTCAAGGCAATTCTGACTGGTTCACATAGCAATGCAG CACAGGTGTTGCTGCTTATACATATTAATGAGATGCAACCGGCCTATAGC TTTGGCGTCGGTTGAATAAATCTCTTGGTTGTGTAAAAAAGAGTCTTTTT ATTCAGTGACTTACCAACCTGATTAAACTATTCACGAACTCTATTAACAG TTATGCTTTCTCTCTATTTATGAGAGGCCCTTTCACCGAAGTCTTTTGTA TAGAAAGCTGTCATTGGTTATCTTGAGTCACACTGTAGATGCATGATTGT CACATGAACATCACATGATGATCACATGATCAAATCATAGACCCTCAATA CTGTGTCTTAATACTGTTCCTTACTACTCTACAGACCCCCGGACCTGGCA CATATAGAGTAGCGGACCCCAACATTAACCGTGGCCGAGCTCCACTCTAC TCGATGACCGGGAGAAACCAGATGCCTGGTGACACCACCAAGAAACCAGG CCCCGGCGCACACAGCCCTGAAAAGGTGCGGTTGTTGTATATTGTGTGTG CATTTTATAATGCTAGAAGGAAATGAGCATGTCTTTTGTACATGCAGGCT GTTTTTGTACTGACCATGAACATCAGAAATGCAAAATAATGACACAAATG TGTTGTAAATATCTTTAACATGAAGATTTTTCTATCCAGAGTATCTAGAT TTTTGGTGCCAAAATGTTGAAAAATGCCGTTTTATGTAGTTTGTAGAACC ACAGAAAGAGGTCTGAAAATAATTAAGTGTAATCTTTACTTCACTTTCAG CAGCTGATACAACAATGGGGTTTAAGATACATCCTAAAGTCAAGTTTACT AGTAGTAGTTAAAAGAGTCTTAATCCATCATTGTAATCTAATCAATCTGC CAGCATGCCTGATTTGTGGAGATAAATGAAAAACTGCATGTTCATGAGAT AGGAGTAGTAACATAAAGAGATATGGTAGGGAGTTTCCCTATAAATAAAA GAACTTACAACCACAGGAGTTCCTAAGCATTCATACAGATCTTATGAAAA ACGCACTAAGCACTATGCAAAAAACATGAAATCATGTGTTTTTTATAGAA TTTTTTTACCTTTTTTTGCATATCACTTTGTGTGTTTTTCATAGAATTTG TACCAATTCTTAGGCTCCTCTAAAATAGAGCTTAAGTGTAACTTAATAGC TCCTTTAGATGTAAATGAATGACTTTTCATGGGATGTTTTCCTTCCTCCT CATACAGTGATTGTTTGCAACAAATATTTGATCCCTTTCTTCTTCTTTTT TGTTATTCTCTATCACAGGTGTATCAAAACGCAAAGAGAAAGCAGCCGGA ATTCTCATTCGGAATTCGACACTCCGAATACATAGCACCCCTCATCGTTG ACCCCTCCTACTAACACATGATGTTTGTGTAAGCACGGGTAGAACTTGTT TATTTTTCTTTTATTATTTATTTATTTATCCATTTATTCATGTAGGCATG GACTTTGTGCCGAAGTCTACTGCTGCAGCACTGTCTAATTCTCAGATAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:7941408..7956561+

>Blg00706.7 ID=Blg00706.7|Name=Blg00706.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=780bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7941408..7956561+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGATCCAACTGGCAGCCAACCCGACCGCGTGGTCCGATTGCGGCCAT
GTACCACAGCCCCGGACCTAAGTACATGGTGCCCGGCAGTACAGGACACA
CCCAGACTTTTGCTACAGGTGCGAAGAAACACGACCCGACCCGTAAGTTG
GCACCGGCCTACAGCTTCGGTGTCCGACACAACAAGTACAGCAACGACTG
TAGCCCGGGACCAGGCTACCTGGTGCCGTCCAACATCCTGCGCCAGGGGA
AGGATGGGACCCCACACTACTCCCTGTACAGCCGGCCGAAGGACATCACC
ATGTTCAGCACACCTGGCCCAGGTGCGTATGCCCCCGAGAAATCTGGCCG
TTCCGCGACTCGTACAGCTCCAGCGTACTCCCTCGCCTCCCGGACGCGAG
GCTTCAAGTTCGACAACACGCCCGCGCCCAACGCCTACTCCCTGCCAGCG
GTGGTCGGACCGAAGGCCGTCGGGAAGACCTCGGCGCCAAACTACTCGCT
GACAAGCCGACAGAAAATCGGCAGCTTTCACGAGGACTTACAGAAGACCC
CCGGACCTGGCACATATAGAGTAGCGGACCCCAACATTAACCGTGGCCGA
GCTCCACTCTACTCGATGACCGGGAGAAACCAGATGCCTGGTGACACCAC
CAAGAAACCAGGCCCCGGCGCACACAGCCCTGAAAAGGTGATCATGCATA
AGTTGCAGTACCCACAATTCTCCTTCGGGATCCGTCACTCCGAGTACATC
GCACCTCTCATCATTGACCCAGTGGAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00706.7Blg00706.7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7941408..7941529Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7941408..7941529Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7949149..7949278Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7949149..7949278Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7949988..7950215Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7949988..7950215Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7950697..7950920Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7950697..7950920Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7951642..7951782Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7951642..7951782Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7954969..7956561Blg00706.7-exon-Sc0000003-1570713199:7954969..7956561Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:7941408..7956561 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00706