Blg00670.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00670.0
Unique NameBlg00670.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:5527011..5551585-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00670.0 ID=Blg00670.0|Name=Blg00670.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=24575bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5527011..5551585- (Branchiostoma lanceolatum)
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TTCATGCTGCTAATATTTATAAGAGAAAGAAACAGACATTTGTGGCTCGA AAGGACTAGCTATAAGGGCCCCTAACTTTTGTCTTTTGGCCAAGGCCAAA GCTCTAAAGAATGTTACATACAAACTAGAATAAAGATGTATATAACATTT ATGGGACAGCAGTCTCAATGTACTTAAAATACTGTTATTGCCAAAACCTC CATCCCATTTGTATTTTCTTTGTCTTTGTCAGCAGGGCTAGCCCCTTATA TAGCAGCAACAGGCAGCCCTGGCTGTGTTTCCCGAACAGCGAAACCAGTA AATTGATAGAATGAACATGTAAAGAAATTTGTAAGCTTTGAGGTATTATG TTCCAAAATAAATCATGGCAATGAAAACATAACCTCCTTTTAACATAAGT AAGAAAAGACGTAATTTAGATGTAGATGTAGTGCATTAAATCTTTCTACA TTAATGTTTTGCAGATCCCAAACTTCTGGTGCCCTACAGAAGTGATCGCT CCAGACAAGACTCACGAGTTCCCCCTCCCTCCACCGGAGAAGCCTCTTAA CTATGAAAACAGTACAGGGATGAGGTTTGAGGCCATGGAGGTCAGGAGGT GTCTTCAGGAAGGTCAGGAACAGATGTGATCATGTCCAATGCAATCGCCC CAAGCTGCTTAGTAATTATATAATATGCCTGCCATGGCTTTATCAATACT ATTAACGCACTGTATTGGCCGTCTATAAGAGAATAAATTCAGGTTATTAC TTTCATCCAAAAAGAGGTACTGTTTTCAGTCAGTGTCATTGTTTCTCCTG GGGAGTGTTGGTAGTTGTTTCAATACTGAAGAGTGACAGGATGTGAGGTC AGGAAGTGCGTGTTATCGCAGACTAGCAGGATGGGAAGGTTGGTTCGACC TAAAGTTGGTCCCTCATAGACAGAATTAGCAAGAAATTCTCACTAAAAGA ACAAATTTACAAAACCCAAATATTTCACAGAGGTATGAGATCTTTGATCT CTTGTTATTTATATTCATATTTTTATCCTTTCTTTCAGCTTTGATATTGA GAATCCCCAAATGACCCATACCATGAATGGTCACTTGCTTTGTTATGTGT CTATTCGGAGTGCATTGACAGTTCATGCCGACTTTGTTGTGATATTTCCT ATTTCCTACTGCAGGTTTGAAGGAGAGTCCCCTGATGACCCACGCCATGA GTCTACAGATAGCCGGTATCCTGGACCGGGCGCGTAAGGTGGTCGGAGTG GTGTACGATCAGGACAAGGAGTGAACCAACTGCACAGAGAAACTGGGAGG GGAGACAAGGCTCATTGATACATTTAAAAAAAAACAAATACACCATCTCC TTCCCCCTAGCAAGAATAAAAAGACTACTCTCTTCTTTACCAGTCAATCA GAATGTAGAATCCGGTAGGCAATGATGAGCGCCAGTCATGTCAGGGATGT ATATATATTTATATGTGTTAGTCTCCGTAATATCTGTTGTAAAAGGCTCA TCGATACATAGAATAACATGAAAATAAGAGTAGAATCCAAGTGCAAATAA CTGAATTATTTCACAGATGTTAATACGTATACAGCAATGTTTGGTGAGAT GTATACTTCATGTGAAGATAAAAAAAAGAAATACTTGATTGACAATTACT TAAAAATTACTCTTAAGTTTTTTATGCCTTTTCATAAAAAACTATGTTAC GACTGAACGCACAAGCCTGTTTCAATAAAAGGGCAAAGCCTGTTTCAATA AAAGTTTGTCAAAAGTTGAAATATAGTTATGGGTAGTTTGTGTTCTTTTT TGTTAAAAACTCTGATCCATTTTCTATGATAAAAGTGATTCGATCTATCT AAATGTAAGTGAAGAAAATATCCCAACGCCAGGGAAATTGCTTTTCCCGA 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AGTTTGCTAAAACTCACGACATCCCAACAGCTTATGGTTCATATGCAGAG CTAGCAGCACAGAAGGATATAGGTATTTAAGACTATTAACTATTTAAGTA TTAGTGAATCAATGTTGACAATTGACAAAAGTGCTACGTTAACTACTACA TTAGATATTTTGTATATAAGTTTTTTTTAAAGGTCAGCTACAATTCTACA CACAAAAAGTTATGTCTAATTTCAGTTGGTCATATCAAGGACATTATATC CTTGATCAGATTTTTCACCCTATCTGTAAAAGAGAGTACTAGCACAGGAA AAAGAAAAGCAAAATTGTCTATAAGTGACAGGAAAAGGAAAGATTGAAAT GTAGTTTTTTTTTCACAAATGATGGTGTGATTTCTTCAATGCCCTCAGAC GTGGTGTACATTGGTTCCATCCATACCCAGCATGCATCGCTGACTACCAT GATGCTCCAGGCGGGGAAGCCTGTCCTGTGTGAGAAGCCGATGTCCGTCA ACTCCCGAGAAGCGCGGCAGATGATCGGCCTTGCCAAGGAGAAGGGCATC TTCTTTATGGAGGTATTAAAGGCTTTGACAATAGACTTGATGTTTGATAA GGTAAAGGTTCCATAGCCCTTTTTGAGGCCATTGGTGTTTAGCATGCCCA TAGCCAGGACTTTGTTTGGGGGGCTTCTTCGGTACTGTCAGAGGAACTAT TGAGCGCCGCAGGTGCGAGCTTTCTAGGGGGGTCCACAGGCATGGCCTCC TGGAAAATTTTACAAATTGAACCTTCTGAAATTGCATTTCCTGTGTTTTT GAGAGGATTTCAGAGGAAAAAATCAGAGATAAAGTGAGCCGTTTTTCTTG GATTCCAGCCTCGCTGGTGATTCAAATAAGTCCGCCTTGAAAAAAAGTAC CAAAATTGGCACAACAGCTATGAAAATGAATTTAATCCAGTTAAACAATT TATCTTTCGCTACAGGCTGTCTGGAGTCGTTTCTTCCCAGCGTACAAAAA GATCCGTGAGATCATCAACTCAGGAGCAGTTGGGGAGGTGAAAGTGGTTA CAGCATCTTTTGGATTTAACGTTGTCGGTGTGCCGAGGCTAGCAGAAAGG TCAGTTTTCATACTGCTGTTTTTATGGGGTCATATTAGCTGTGCTTTAGG GGGAAAAATAAACGTTTTGCTGTATTTCAAAGTCGTGGTTGAGCCAAAAC TTCTAGTACTACAGAATCAATAATTGTAAATGCATTTTTGGGGTGTCATG AATTTGCAACTATATAACTGTATGTAGAAGTTACTGCAAAACAAGATCCT GGAGATCTTCTGTAATAAGGATAAAATTCAGATGTGTTGCCCACGAGATC TTCAATAAAACCAACGCAAATGGTTCAAGATTTATAGTATATGTTATCCT TTCTTCGTCATTGTGCAACGCAATATGTTCTTCTACCTGAAGCAAATAAC TTAACTGGATCTATGATCTTGTTAGATCCCTGGGAGGAGGATCACTGTTG GATCTTGGGATCTATCCAATCCAGTTTGCTACCATGGTATTTGGAGGAGA GGAACCCCAGGATATTACCATCAGTGGACACCTCAGCGAGGGGGGTGAGT TAGTGTTGCTATCACTTATCAACTTCATTCCTTTATCAAATTCAACATAG AACTGATTTAGGCCAAATTCCTAAATGTCTGCACTGTCAATCCTGGTCAG GCAACCACCTAGAGCAGTCACATGTACATAGTAAAACAGTCCGTCCATTT TTACATACTAGTACTAGTAGTAGTTGGCACCTGACCCTGTCCTCAGCAAC CACCTGTCCTAGTCAACCATTTTTCCTCAGTCCATTGATCATGAGTGCTT GGTAAATCCTGGTTTGACTGTGTGTGTGTATTTGTACCTGTATATAGCCG GTATAGCTGCCGTTCGGCATAACACAACAGCTTGAAGGTACACAGCATTG CTGCGGCTGTGTGGCATAGTGGCAGAGCATCCGGCTATGAACCAATGAGA CCCAGGTTCAATCCCCAGTGGACTACCCAGACGTTGTGCCCTTGGGAAAG GCACTTAACACATATTTCCCATGTCCTAAGCCCAGCAGTAGGGTTTGGGT TGGCGTTAGGAATGGCATCCAGCCGTAAAAATGCTTGCTACAAAAAAGAC TTGCACTTGATGAGGAGTTCTGGGGCTCCCCCATCTAGCCTCCGTTGCAG GCTCTGAACCGGCTTTTTGGGGGGCTAAATAATACACTTTTTGCAGCCAA CCCGTAACCATCAGCCAACCCTGTAACTATCAGCTGGCTATCCCCCATCC ATGTGCAAGCACGTCCAACACCCATGGGGAATAACTGAAACTTGCAACCC ATCACATCCAACCTAATTTGCACATCCAACTCTATGTTCTCTTCTTGGCA ACTCTCTGACTAATGATGTTTTTCCTCCAGGAGTTGACGAGACTGTGACA GTTGTCCTGAAGTACAGTGGAAACAGGATGGCCACACTTCTGTGCTCTAT GTCTGCAAATGTACCTAATGAGGCATATGTGTGTGGGACAAAAGCGTCTC TCAAGGTTTGGACAAAATCTTAGATGTCGTTTGCCTTTCTTGAAGTATGC TGTTAATTGAGGAATAAATCTAATGTTTGTAGCTCAAAAGGGAGCTGGTG TTTTTTTCCACTGGCCTGAAGGTTTAATCCTTTTACAAAAATGTAAAATG CAGTTGCATACAAAACAAAATGAACATCAGTTGTAAGCTTTGAGGCATCT TCCAAAACATACATGGCAATAAAAAACCTGTCTCTCTGTTAACATAGCCT CCTTTTTATGTGCTAAGACCATCAATGACACTGCAATGTAATAGTTTGTG ATAACATTCAACCATTATGATTTTTATTAAAGAAAGATGTTTGTACAAAA TATACACAGCATACTTTCAATTCTTGATAACAGTCATGATTGAATGTTAT AATCAGGATCTGTTTATTGTCATTTGCATAAGCACTTACACAAAAGTAAG ATAAATGACGATACTACTATTTACTAGTGCATGAAACATTTCTACAATGA CATTTTGCAGATTCCAAACTTCTGGTGTCCTACAAAAGTGATCGCTCCAG ACGGTACCCATGAGTTCCCCCTCCCCCCACCAGAGAAACCTCTCAACTTT AACAACAGTACAGGGATGAGGTTTGAGGCCATGGAAGTGAGGAGGTGTCT TCAGGAAGGTCAGGAATATAATCTTTAAATTCAGGATTCCAATATTACAG TCAAACCTGTACAATTTGGACCACCTACAGTAGTAAGAACTTTTAGTGGT CCCTTAGATAATTTTTCCCATTGACACATTAAGAATCCAGAGTTTTCCAG ACAATAGCTACCACCTGTCCACATAGACTAGATTTTATCGGCCCCTTATG GTTGTCTTGGGCAGGTTTGACTTTAAGCAGAAGCTGTACAATCTTGAAGA TCCATGTGACTCTGCTTGAGGGATCCCACATTAAGTGTTGTTGTGTGTCT GTTTAGAATGCAGTGACAGGTCACAATAACTTTGCTCTGACAGTTTCTCC TATTTCCTACTGCAGGTTTGAAGGAGAGTCCCCTGATGACCCACGCCATG AGTCTACAGATAGCCGGTATCCTGGACCGGGCACGTAAGGTGGTCGGAGT GGTGTACGATCAGGACAAGGAGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:5527011..5551585-

>Blg00670.0 ID=Blg00670.0|Name=Blg00670.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1017bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5527011..5551585- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGCCAACTCGTTGGGGTTTCGTGGCCACAGGGAGAATTTGCAACGA
TTTCAAGGTTGCACTTGACACCCTGCCTAGGGACGAACATCAGGTTGTGG
CTGTGGCATCTAGGAGCCTGGAAACTGCCCAGAAGTTTGCTAAAGCTCAC
AACATCCCAAAGGCATATGGGTCATATGCAGAGCTTGCAGAACAGGAGGA
TATAGACGTGGTGTACATCGGTGCCGTCCACCTCCAGCATGCACCAGTGA
CTACCATGATGCTCCAGGCAGGGAAGCCTGTCCTGTGTGAGAAGCCGATG
GCCGTCAACTCCCGAGAGGCACGGCAGATGATCGGTCTCGCCAAGGAGAA
GAACCTCTTCTTTATGGAGGCTGTCTGGAGTTGCTTCTTCCCAGCGTACC
TAAAGATCCGTGAGATCATCGACTCAGGAGCAGTTGGGGAGGTGAAGGTG
GTGACCGCATGTTTTGGATACAACGTTAACGTTGATGTGCAAAGGCTAAC
AGAAAGACCCTCAGGATCAATGTTGGATATGGGAATCTGGGGATCTGGGG
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ATCACCACTAGTGGACACCTCATTAGTGATGGGGGAGTTGATGAGACTGT
GACAGTTGTCCTGAAGTACAGTGGAAATAGGATGGCAACACTTCTGTGCT
CTATGTCTGCAAACATGCCCAATGAGGCATATGTGTGTGGGACAAAGGGC
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GATAGCCGGTATCCTGGACCGGGCACGTAAGGTGGTCGGAGTGGTGTACG
ATCAGGACAAGGAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00670.0Blg00670.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5542535..5542646Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5542535..5542646Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5541985..5542148Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5541985..5542148Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5533871..5533998Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5533871..5533998Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5533567..5533691Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5533567..5533691Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5532924..5533071Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5532924..5533071Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5527011..5527120Blg00670.0-exon-Sc0000003-1570713199:5527011..5527120Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:5527011..5551585 -
Properties
Property NameValue
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