Blg00632.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00632.0
Unique NameBlg00632.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Full-screen view
Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000301:121621..136065-

Legend: CDSexonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00632.0 ID=Blg00632.0|Name=Blg00632.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14445bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000301:121621..136065- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTTCTACCGTACAGGGAAAAGGTGATACCAACAGACAGGGAGGGAG
GGCACAAGCACAGGACAGCCCAGCTCTGCCAGATACATGCACACTGCATC
ACACTGAGGACCCCTGGCAGCCAAGCTTCAAACTGCAGCAATATGGAGCC
TATGGCCACTCTGGAACACAGGTACAGTATATCCAACAGCATTTGATCAA
ACTTACGAATCCTGTGAGCCTATAATATGCATAAAGATGCATGTTTTTAT
ATGGGTTGACCATTTTCTTAATGCATTGATGAATTAGAAAACTGCAACAG
CTAAGATTAGTAGTAAGAAGGCAAGGACTTTCTTCAACTATTGGTTGGGG
TACCCCTTTCCCCCACTACCAGCCCCTGCCCTTTTGTTAATCGCAGCCAC
TGCAACTCTGGCTCTAGAAAATGGTTCACTGAACCTCAATATTATGATAC
TTACATGTTATCTTTTATTTCTATTCAATCTGCGAACCAACAAGTTAATT
CTCCCTAATGCTCAACCCCAAGACAGATTTGGTGCCAAACAGCTACCTTA
GCAGGCTGAAACTTCAATTGATGTAGCCTTATCAAAAGGCCAGCTTTAGA
TAAAGTTTCTACTCCAATGTTTTTCAGGAGGTGTTGCGGAAAGTCCAGAG
CATCCTGAACAAGCTGACTCCGCAGAAGTTCCAGACTCTGTGTCAGCAGG
TCCTGGACCTGGACATCGTGACGGAGGCTGGACTGAGGGGCCTGACCCAC
CTGGTGGTGGACAACATGATCACATCGTTCTCACCAACCGGACCCAGCTA
CGCCGAGGTGTATGCTAACCTCTGCAGGTGCCTCATTCATGTAAGTGCTA
GAACGACTACTTCGTTTGAAAATGATTTTTTTACTTTGTTTCTGAAGACA
AAATTCTCAGGTGGTTTTGTATGTATGAAAGCTATGAAGTAGTTGTTGGA
TTTTGAGCCCCCTTGCAGCTCCCTTTCAAGCTGCAACTGTTTGTTTCCTC
GTCCAAAATTTACAAGTGGATTTTCGTAATCTTTTGCCTATTGCTAAACC
TTGGCTTAAAGAAGAAACTGCTGTGTTTTATTTTCAAGCTCCTTTGCTGA
TTTCTTGTTAAGTGTAAATTAATTAGATCGCAAATATACAGGTAAGGTTT
CATGCCAATACCAGGATTGGTCATTTGAACCTGATGATGGACAGCCTAAA
GTTCAGAGAGACTTGTTTGCTTTGTTGGAACAAAGCTAGGTCAGCTGTTT
CCCGTGTTTTCCACAGCTGAAGGCACCCAGTGAGAACCGACCCAGGGAGA
TGGTCAACTTCCGTAAGCTCCTACTGGCCAGATGTCAGGGGGAGTTTGAG
AACATCAGCAATCCACCACCATGCACGACCAGCATGGTACAACTCCTGGA
GATGGTGCCGGTACGTCTAGTCAGACATTTTCTTGTTTTATTTTGTTTAA
TTCTTTCGGCTGAGATGTAGCCACAATGGAGCTTTAAATGTACAGTAGTT
GAATCTAGTTTGGCCTGCTGAAAAGATAATCTTTCACTGGTTTTGAGAAG
AAGAATAGATGCTATTGTCTGAAAAATCCTTCTTTTTGACAAGTAGCCTG
GTATATCCAGCTTTGTACAGCTTGTAGGAATAGGGAATGACTGTTCGAAA
GCAGATTAAAGCTGCACACGTGCAGTGAATAGTGGTACAGTTTCATATTC
TATGAACTAACATCTCTAGCATATAGATACTTCACTGCTTCCTCTGGCAG
AACAGATACAAACTGCAGTGTCGAAACATACAGGCAGTGAGTGAGTGATG
AGTTGTTTTTTGTTAGGAAGAGGAGAAGCCAATGGTACGTTTGGAACTCC
TGGTGGCCAAAAGACGAGCCCTTGCCATCGTCAGTCTCATCGGGGAGCTC
TTCAAGCTGAAGATGCTGTCTGCAAACCTCATGCACCGCTGTGTGGTCAG
GCTCCTTAAGACAGGTTCTGAGGAGAGTCTGGAGTGTCTGTGTCTACTAC
TGACCACCATGGGCAAGGAACTGGACCTAGAACAGTCAAAGGTAGAGCTC
AACTAAGTAACTAACTCATCTTTGGGAACATCTTTCCTTTATTTTTGTCT
ACACATGTTTCAAGAAGAGAGAAGACGCATGTAAACTGTAGGTAGAGATA
AAACATAGCATAGTTTCACTATTACTCTCTTGAATCTAACTTACTTCATG
TAGCCCCAATGGGCCATGAATCTGCAATAAACTTCATTCTCATTGTTAAT
GCTTTCTCATGCACAGCAGCTTTTTCTTTTAGAACTTACAAAATGTAAGA
TTGAATAACTACGACTTTGAACATGGGTCCATTTGCTGTTGCCTTTTTTT
TTTTACAAAATTTAATTGTACATGTGTCTTTTTTCTCATCTTATAGGCAA
AGATGGATCAGTATTTTGGAACAATGCTGCAGATAATAAACCAGAAGAAG
GCCTCCACGCGCATGTGCTTCCTGCTGAGGGACCTCATGGATCTTAGAGT
GGTGAGTGCACATTAATATTGTAGTTACATACATGTAGGTGTGTTTACAT
GTACATGTATACATGCAGGGCTCGTAATTCATTTTTGGAAATAGGTGCAC
TGGTGCACCCAACCCAAAAGATTAGGTACACAGAAAGAATTTTGGGTGCA
CCACATAAAGTTGAATGTCAATAAAGTTGAATGTCAGCAAAACATAATTA
CAAAGTTTAACGCTCTTAAGAACTTCAATCTGTAATTCTATAGCTAACCT
TAAGATTTAAAACATGTGATACATCAAATAAAGTACAACAAAAGTTTATA
TTGCTATTTCTGATACTTACATTTCAAGACTATTCTGTATACTTAGTGTA
CAATAGAGCATTTATCCTATAGCTTACAAAAATATCTAGGTGCACCAGTG
CCCCCACAGTCAAAAATTAGGTGCACAGCTCTAATTTTGGGTGAACACAA
GTGCACATGCACCCAGTATTTCGAGCCCTGACATGTATGTGTATGGAGAG
AAGTTTGGAAAGGATTGTGTTGGCCATGGTGGTAGTGTGAGAAGTTTAAA
ACAGTGGGGCAAAAAGATACAAAAACAGAAAAAATGTGCTCAAACTTTTA
CAATGTAATCATTTCTCATACATACAATACATGACCCTTTTCAGTCCATT
TTTACCTGGTACACTACTTTATGGTGTAATTTGAAGAATGGCAGACCATT
TTTTTAAATTCAGCAATGGCATCATCAAGAAAGGCATCACTAAGGCTACT
CCTAGAGCATGACTAATGACCTAGAAAGATACACCAATGCATGTGAAAAG
TGATGTGATGTAAATGATAATGCTATATTCCAGTTCAAAATTTCACAGCT
GTATAAATGCAAGTAAGGTATACTGACTAATAAAGAAAAACATCCACTCC
AATCAAAGACTTGTTTTTCCCCACCCAGAATGACTGGGAGCCCAGAAGAC
CCAGAAACGCCCCCAAAACCCTTGAACAGATCCACAGAGAGGCTGAACGG
GAGGCACAACAGTTACAGCAGAGACTCGGGCAGCAGCCGCGACAGCGCAG
GCGACAGTGGGAGAGAGGTTTGTCTTTACATTACAACTTTGAAATATAAC
AGGGCTAAAAATACCACTTTGCATATGCAGCTTACTGCATGTAAAATTGG
AGTTGTGAAGCTATATGCACCAGATGATATAACCTACACTCATGTTAAAA
GCAGCATGCTACACTAGGATGACATGGGGCTATATGCGGCCAGTAATGGC
CGAAATATTCCATCTCATTTTCCTAGTAAATTTGCATTTGAATTGGAGGC
TAAAGAGGGCATGTATATCTAAGATAGCTGTAATAGACCAGTCCACTAGC
CCTGCCCACCTCCGTCAAAACACAGAAATACAAAATAAAAACATAACAAT
TCTACTATTTGACGGACTTGCAGCCATTCTCTCATTGGTTGACCTGCTAA
CTAATGGTGATGGACAACCAGGATCGGTCTATAGTCCCTGAGACTCTGAG
GACATGGTCACAACTTTTTCATCCTTTCTTCCTACAGGTAGAGGCTGGCG
GCACGGTGTGAGGAGGGGGAGGGGGGTGCGGGTGTTCCAACAGCTGAGAG
AACTCTCCATGAACGTACACCTGCCGGCAGATAGTAGGTAAGTTCTAGGT
TTACAAAGTTTACGAAAGTTTACAAATGTTTACAAAAGTTTACAAAAGTT
TACAAAAGTTTACAAAAGTTTACAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTACAAAAGTTTACAAAAGTTTACAAAAGT
TTACAAATGTTTACAAAAGTTTACAACTGTTTACAAATGTTTACAAATGA
TGGATGCCTGAATTGCGCTGTGAAGTACAGCAAAATACCATACTTTACAG
CAACTATACAGTAAAATATCATAGTACAGTTAAAAATTTCATGGTGAAAA
TGTTTAGCGATTCGGTCTTCTGTCGGCGTGCATTATGTATTATATGTAAA
TTCTGCAGAAATCATGCATTTCTGGGTGCCAACTTCACAACATGGTTGGA
GAGGAATGGAAATTTGTTCCTGTTATAAAACTTTTCATCTGCTCAAGTCC
CCCTCCCCCTCCACCTGCTATGCTCTACTTTAAAAGGCTACGGGTGTAAG
AGCAGGTAAAAAAATGACTTACACTTAAACCAATATCTCCATTTTTCATG
GAGATAACTATATCTCCATTTTTCATGGAGATAATAAATAAATAGATAAA
CATATACATCTAATAACAACAAATCTTTTGACCAATTGCTCCATAAAGTG
ACATGTCAGAAGTGCTGCAGGATGGCTACTCAGAATTTTACTAAGTCCTG
TGAATGGCTTGTTGAACACCAATTAACTTTCTCATTACCAATTCAAATTT
GGTGCCAAGTGGCTACCATAGCAGGGAGAAGGTTAAAACAGATCTGAATT
TTGCACCCTGATGATTTCATGATCTTTACACCCACAGTGTGGACACGAGC
ACAAGTAGTAACAGTCTCCAGGACCAGGGAGCAGGCTGGCGTCAAGCTGG
GTCAGAGACGTGGGACGAAGCGTGGGACTTGCTAGATACACCCATGTCAG
ACCCAGCCACACCACAGACCCAACATACAGCAGGTGGGACATTGCATTTT
CCTTGTTGGGAGGATGAAGTTAAAATTTGCTCCATCTAAAAGAAAATGTA
CATAATTTACTGAACATGAATATAAATATATGAATCACATAATTTGGAAT
CTATCAGCTATTTTAAACTGGAAATCACAAAAAATGTAAGGATTGAATTT
GTGTGATTACTAGTAATATAAGGTGGGGGAATGCATGGATATGTCTGCAA
ATTATTTTCGTAGGCTCAACAGATTATTGTGTCCCTTCCTTCTTGCTCGC
GCCTTTTTTTGTTCTTTCAGTTCAATATAACCACACTCCTTCCTTGTCTG
TCACTAAGCAGCTCTTCTAATTGTCATGATTTTTTAACTTTGAGGCTGTA
TGATTACATGTATATGAATGTGTACATTTCAGATAAACCTGAACAGCCTG
ACTCTACCTCTTCTTTTGCTAAACTAGTGGAAGACAAAGTAAGTCTGAAT
GGCTTATAATAATAAAAAATCTTGCTGCTTTTTTAATGATAAGTGTGTTT
AGGGGTACCATCCTACTAGTAGTTAGTTTACACATATTCCCATACCTAAC
TACATAGTTGGATCAAGCAAGAATGGGAGCAAGCATAGCATCAAGGTTAG
AAGTTTCTTGTAAAGAATTATGCAAAAGTTGCTTGTTATATGGAAGCATC
ATCAAGGGACTACAGCTACTGTGTCATTGCCATGTTTGGCAGTACTATTT
CTGCAAAATGGCAGTACGATTTCTGCAAAATGTGTGTGCAAAACCTTTCT
GGGTCAACTGTTTTGTCTTCACATTTCTTAAAATTTTACAATTAACTTCG
ATAAACAGGCAGAGGCTGCTGTTGGAGACAGTGGAAGACAGGGAAGCAGA
CGGCTGCCTATGCTGCAGATAGCAGCCTTCCTGGACATCCTGGTGAAAGA
AGACGTGCAAAATGAACATATCATCGGCTGGATTGAGGTAACTACAGGCC
TGATAAATTCAACTATCTGACAGTTTTCTTCCTGACTGTCTGGTTCAGGA
AAGTTTTGTAACCTTCTCCATGCATGCTGTCTTCCCTTTAGTGAAATTTG
ATGCTAAAGGGCTACATGCAATTCTCAGCAATGGTATTTAGGTGGAGTCA
TTTTGAAAAAAATAAGGAGGGAAGGGGAGTCCTCAAAGTTTTTAAATGGT
ATTTTGATGTTCTAAAAGCCATCAGAGCATTCCTTTTTTTAATGGTTAAA
TTTTCGCATTTTTGATGTGCAAATGTATGTTTTTGACAGGACAATATTGA
CGAAGCCAGGAGAAAAGAGCCAGCCTTTATCAGGACCCTGATGTCTGCTG
TGTGTAAAAGTGCAATCAGAGGTGAGGAAACAAACTGGTGACAAATATAT
GACATGTTACCTTAGACCTAAGATCCGCCCACAATACAATCATATACTAT
TTATATAGACATAATAACCACACTTATGTATTAGACAGTGTTCTATATTA
GACTACAACACTGGACAGTTTACTGTCATGTTCTTTTAGCCTTTTCCCTG
CTGTTTAACTCTGTAACCAATAGGGCATTGGGTGCCAAACACAGTTTTGT
TGTAATTTATTGGTCATTTGCAAAGGAGCAGCATTCCTGTAGATCTTATT
TGACTTGTTCGATCATGTGTTTCCAGGTGAGGGTACAGGCCAGAGGTGTG
ACACCCAGGGTATCCAGAAGAGAGTGGTTCTGTTGCAGAAGTACCTGGAC
AACGAGAGCACCAGAGAGCTGCAGGCGCTCTTCGCACTACAGGCACTCAT
GGTGCAGCTGGACCAGCCGCCGAGTAAGTGAAAATCTTCAGTAGTCTCCA
TCAATTAAGGAGGTTACATGATACTGTGAATATTCAGATGTTTGCTGTAG
CCTTATGACATTTCATCATCGCAAATATCTTATTACTAACATTTGTGACA
GTGATGTTTGTTCCCACCATTGCAGTGAATTACTCACTTTTCCCCAAACC
GCTAAAGTTACCAAATGCAATATTAGATCAATTTACAGTATGCAACCAGG
CTTCAAAACACTTATGGATTGAACCCTGACCCTGTGAACCAGAAGTTGGA
TTGCTAATGATACAACCTTAAAGCTTTTTTGTTTCTCTTCCCCAGATCTA
CTGAGAATGTTCTTTGACACCTTGTATGATGAAAAAATAATCTCGGATGA
AGCTTTCTTCGCTTGGGAATCAGACTCAGATCCTGCAGAGCAAGCTGGCA
AGGGCATGGCTGTCAAATGTGTCACCGCGTTTCTGTTATGGCTCAGAGAG
GCTGATGAGGAGTCCAGTTCAGAGGAAAAAAAGGAAAAGGGATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000301:121621..136065-

>Blg00632.0 ID=Blg00632.0|Name=Blg00632.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1857bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000301:121621..136065- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTTCTACCGTACAGGGAAAAGGTGATACCAACAGACAGGGAGGGAG
GGCACAAGCACAGGACAGCCCAGCTCTGCCAGATACATGCACACTGCATC
ACACTGAGGACCCCTGGCAGCCAAGCTTCAAACTGCAGCAATATGGAGCC
TATGGCCACTCTGGAACACAGGAGGTGTTGCGGAAAGTCCAGAGCATCCT
GAACAAGCTGACTCCGCAGAAGTTCCAGACTCTGTGTCAGCAGGTCCTGG
ACCTGGACATCGTGACGGAGGCTGGACTGAGGGGCCTGACCCACCTGGTG
GTGGACAACATGATCACATCGTTCTCACCAACCGGACCCAGCTACGCCGA
GGTGTATGCTAACCTCTGCAGGTGCCTCATTCATCTGAAGGCACCCAGTG
AGAACCGACCCAGGGAGATGGTCAACTTCCGTAAGCTCCTACTGGCCAGA
TGTCAGGGGGAGTTTGAGAACATCAGCAATCCACCACCATGCACGACCAG
CATGGTACAACTCCTGGAGATGGTGCCGGAAGAGGAGAAGCCAATGGTAC
GTTTGGAACTCCTGGTGGCCAAAAGACGAGCCCTTGCCATCGTCAGTCTC
ATCGGGGAGCTCTTCAAGCTGAAGATGCTGTCTGCAAACCTCATGCACCG
CTGTGTGGTCAGGCTCCTTAAGACAGGTTCTGAGGAGAGTCTGGAGTGTC
TGTGTCTACTACTGACCACCATGGGCAAGGAACTGGACCTAGAACAGTCA
AAGGCAAAGATGGATCAGTATTTTGGAACAATGCTGCAGATAATAAACCA
GAAGAAGGCCTCCACGCGCATGTGCTTCCTGCTGAGGGACCTCATGGATC
TTAGAGTGAATGACTGGGAGCCCAGAAGACCCAGAAACGCCCCCAAAACC
CTTGAACAGATCCACAGAGAGGCTGAACGGGAGGCACAACAGTTACAGCA
GAGACTCGGGCAGCAGCCGCGACAGCGCAGGCGACAGTGGGAGAGAGGTA
GAGGCTGGCGGCACGGTGTGAGGAGGGGGAGGGGGGTGCGGGTGTTCCAA
CAGCTGAGAGAACTCTCCATGAACGTACACCTGCCGGCAGATAGTAGTGT
GGACACGAGCACAAGTAGTAACAGTCTCCAGGACCAGGGAGCAGGCTGGC
GTCAAGCTGGGTCAGAGACGTGGGACGAAGCGTGGGACTTGCTAGATACA
CCCATGTCAGACCCAGCCACACCACAGACCCAACATACAGCAGATAAACC
TGAACAGCCTGACTCTACCTCTTCTTTTGCTAAACTAGTGGAAGACAAAG
CAGAGGCTGCTGTTGGAGACAGTGGAAGACAGGGAAGCAGACGGCTGCCT
ATGCTGCAGATAGCAGCCTTCCTGGACATCCTGGTGAAAGAAGACGTGCA
AAATGAACATATCATCGGCTGGATTGAGGACAATATTGACGAAGCCAGGA
GAAAAGAGCCAGCCTTTATCAGGACCCTGATGTCTGCTGTGTGTAAAAGT
GCAATCAGAGGTGAGGGTACAGGCCAGAGGTGTGACACCCAGGGTATCCA
GAAGAGAGTGGTTCTGTTGCAGAAGTACCTGGACAACGAGAGCACCAGAG
AGCTGCAGGCGCTCTTCGCACTACAGGCACTCATGGTGCAGCTGGACCAG
CCGCCGAATCTACTGAGAATGTTCTTTGACACCTTGTATGATGAAAAAAT
AATCTCGGATGAAGCTTTCTTCGCTTGGGAATCAGACTCAGATCCTGCAG
AGCAAGCTGGCAAGGGCATGGCTGTCAAATGTGTCACCGCGTTTCTGTTA
TGGCTCAGAGAGGCTGATGAGGAGTCCAGTTCAGAGGAAAAAAAGGAAAA
GGGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:135895..136065Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:135895..136065Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:135226..135438Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:135226..135438Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:134656..134799Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:134656..134799Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:134025..134249Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:134025..134249Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:133565..133669Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:133565..133669Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:132499..132637Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:132499..132637Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:131929..132028Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:131929..132028Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:123933..124078Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:123933..124078Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:123478..123533Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:123478..123533Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122979..123107Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122979..123107Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122595..122676Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122595..122676Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122143..122289Blg00632.0-exon-Sc0000301-1570713199:122143..122289Branchiostoma lanceolatumexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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