Blg00533.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00533.3
Unique NameBlg00533.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000042:8824..73272-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00533.3 ID=Blg00533.3|Name=Blg00533.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=64449bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000042:8824..73272- (Branchiostoma lanceolatum)
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TGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTG TCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCC CGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTG TTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTG CGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTC TCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCG CGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTT TTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCG TGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTC CCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCG TGTTTTTGCGTGTCTCCCCGCGTGTTTTTNAAACACGTGCTGACTCATGA TCAATAGCGAAGAGTGTGCGTAACATATAAATAAGTGATAAAGATAAGTA GTAATAAAGAGTATCGATAAAACAGGAATGGTATTGTACTCTATGCCTAG TTGATTTAGAAAAGTAAACAACAATCTTTGATATGTAAATACGAATCTCA TCCACTGCGACAGTAGAGTCAGTCCCCCCAGCCTGGCTGTTGCTATGGTT GTGAATTGTGATTGACAGTACACATGTCGGTCCTCTTTTATCAGGTCGGG CGGATGTCTATAATTGAAGTCAACACAGACGTGCAAAATGGCTCTATCGT GGGCTGTGCGATAGTATAAGAAAGTTAGAAAAGTTCTGATCAAGGATTTT TGACTGCGAAATAAATACAAATGGTGGGAGTTACAAGAGTATATATACAT 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGACCCCCAGGACT TTGCACGACTACAGGAGCCGCACGGGTCATAATTTCCCTGACGATCGTTC CGATAGCGTTTTGTGACTCTTTGTTCGGAGCTCGAATTTGTTATTGTTAT GCTAGGATAGTTTATCATTGCCGGAAGATTAACAGACAAACACAAATCAT TCTATTTACACGAGCGTCTATCATGATTAAGTACACTCTTCATTATGAGT ACAAGTACATAATACCACTACCATGTGATGCCATTTTCTTTGGGTGGCCC TGACGCTAGCCGCGGAAGCGAGGCTCGCATCATCGGACACAGCATAATTT GCGGTGTTAATGCCTTTTTTATGATATTGAAAAATACATCTTGCTGGAAT AAGGTCACTAGTGTTTATTTCTTCTGTTATTTTTACGGTATGTGCTGCAG AGTCGGCTGTCTCTATCATAAAGTGTTGCAAATTTGCTCTAGAGTCGGCT CGTGAAAATTGTTGCAAAATCTACCAGAAACAACGGCGCCGGTACGTTCC 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TTAGTGTGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTGTGGT AGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGG TTAGTATGGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNCCAAAGACAATCTTTGCTTGCGGTAATGAATTCTGTTATTT TTCAGAAAAAACGTCTTGTTAAGCATGTAATTATAGCAAAAAAGTTTTAA CTACAAGACCAAGCTGTGTGGATGTCATGACCGTATTTACGGGAAATGAC AAAAACTTGAACAAGAAGCATGATATTACAACGTATCTTCTTTCACTTAA ACCACGCCAATTTCATTTGTTGCTTCTCAGATTTTTCAGAATAAAATCAG AGCGATACGGAAAAAAATTTTGGCAAAAAGTCTAAGGTAAAGACACAGGC TTATTTAACATAAAGAACAACATTCAAGTTTTCAGCAAATGTTGTGTATC GATCATTCCTTAGATCCAGTACTACAATATTCCTGTGATCACTGAGGGCT ATTATTATTCTCCCATTTCTTTAGTAAACAGAAGGAAAAATCAGGTATTT GTCATATGATGGAAAAGTTACATTTAGAGTGTTGTGGATCTAATACAACT AAACATGGTTCTTATGATATGGCCAGTTTTGAATCATTGTCGTGAAATTC TATTTTCTAGATAACATTAGTCAATATCAATCCACACATGTACATCAAAC AACACCTTCAAATGATTTTTTGCAGTATTAACATTTAGAAGTTGAACAGA AATTTAGAATATCCTGAATATACACTCAATCAGTTAAAATGTTGTGGGAA CCCTCAGAGTGTGTCATATCCACAATGTTGCTGTTCAATGAAAGAAGGAA AATGCTACATTGAGAGAGTGCTCACAGGGATATCATGTTTCAAAGGATTT GATGTTGCAAAGTTTCATGCCAGCAGGTCCACCAACAGAGAGAGCCATGG GTGTTTGTTTACATGTACTATGTGAGCCAAATTGTCCTGTTTTGGGTTGA ATTCATAATCTTTTGGAATATTTTGAGAGAAATGTAGTTTCTAATGATAA GATACATTGTGGTGTGGTGTTTTTGTGATCCTTTCACTGGAATAAAGTTT GTTTTGAAACAGACTGCATGAAAAAATCTTACTTGCCCGATCGGGCAAGT GGGGGAGGATATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCA GGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGT ATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCA GGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGT ATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCAGGTGGTTAGTATGGTAGGCA 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TTGTGCAAAGCAGCTACAAAATGAACAAATATATGCCGTAAGTTGCAAAA AGATATTTTGGAAAACGGATTCTAATGTCGTAGAATGCCAAAGAGTCAAA GACGAAGATGTGAATGAACAAAAATGAGGAACCCAATAATTGGTATACCA TTCTCTGTGTGTTTAGTCATTTGTTCAACCTTGTTGACCACGTAATTTTC ATAATGAAGGCAACTTTCTTTTTTTACTCGCACGCTCGCATCAGTTTTGG GGTTCCTAGAGGATGTCATCCATATAATCAAATCAACACGGCCTAAGTAC AAGCTGCGTAAGACCTCAGACTGTAAGGTTTGATCCACTCAGATGTTTGA TCTGACTGAGTCTCGTTGTGTTTCTGCCCAGCAGGAGGCCAGGCTGAACT CCAGCGGGGGTCTGAAGAGTGCAGGCACCGAGAAGGTGGAGACCATCCTT AAGGTAAGAACGTCTTAAAGATTTAAGTCTTATATGGGGGAGCAGCTGGT GTCTTGGAATTTGAACATTCACACGCTGTGTTTTTGACTGGACACATCGT CTTCCCCTGAAATATTGGAAAAAGCCTACAAGGTAATATGTCTGAAAATG AAAATGTTCTAGATCAGATTATACTGGAAACTAGTATTTAACTGTTCTAG ATCTGAAAATCGTTTTTCTAGCACAGGTACAGCTTTTTTTTAAGGATGGT TCTTGTACTAATTTTGTGAAAGTGATTAAAGATAAAAGAAAATTATTTGT ACTATCAAAATTTGTAACATCCAGAATGTAAGGGTTACATAAAAGTTTG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000042:8824..73272-

>Blg00533.3 ID=Blg00533.3|Name=Blg00533.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1089bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000042:8824..73272- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCTTCGACAAGTTCTGGCAGTGTGGACCGTGTGGAGCTCCGTCGGCA
GGCCCAGCTGCAGCGGGCCGGCATGAAGGTCGCCACGGAAACCCCCGTCG
TGTCCAAGCCACTCTTCGACGCACCGGTCAAGATTGAGCCCCCTCCTGAC
GACCATGTGTACCGCAAGACTCAGGAGACCCTGGGGCAGTTCAGCCTGAT
CAGGCACTCCATGCTCAGCAGCCAAAACCAGTATCTCCTGGGGATCCCCA
AGGGCCCACAGACTCCCGTGCTCAACAAGACGGCCGACAGCGTCTGGGCG
TCCAAGTTCCCCCAGAACGGGCAGCTGGCCCCGCAGAAGGGCGTGGCAGC
CCACCGCCCCAAGCAGTCCGGCCGGAGCTCGAGTAGCGAGCGAAGCCGTG
GGCGTGGCTCCAAATCCCCCGCAGACAAGCGGGGTCACGGGAGGTCGGCC
AATCACAAGTCTTCTTCTTCGGCCCACGTGCCGAAGGGCGCCGCGGACAA
GCCCGAGGATAAGAAGCGTCCGGAGGAGCCTCGGGGCAAGGAGCCCGAAG
GATCCCGTCCGAGGACCTCCGAGGCGGGCCACGAGAAACGCAAGTCCGGC
GGGGCCAGCAAGAGACCCTCCGTGAGCCCGCACCATCCCGCTAAGGACGG
GCAGGGCGCCACAGGTCACTCACACAGTAGCAAGGCCGCAGAGCCGTATT
CCAAACCCGCGCAGCATTCCAAACCGGAGAAGTCTCCTCCGGTCCAGCCT
GACTCTTCCTCTTCATCATCCTCTGTAAAGATGGAAGCTTTGTCCACAAA
GGACGACGCCTTCCAGATGCCTGCGCCGCTGTCGACTGCACCGGGCAGCC
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CTCAACGGCCTGCTCGCCGGGGTGAAGAAGGAGGCAGGCGAGAAGGAGCT
GTCCAGGGAGGACGTGAAGAGGAAGCTCAAGCTGACCATGCCCGACACCT
CCGAGGAGGCCAGGCTGAACTCCAGCGGGGGTCTGAAGAGTGCAGGCACC
GAGAAGGTGGAGACCATCCTTAAGGTAAGAACGTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00533.3Blg00533.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00533.3-exon-Sc0000042-1570713199:40040..40912Blg00533.3-exon-Sc0000042-1570713199:40040..40912Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00533.3-exon-Sc0000042-1570713199:8824..9238Blg00533.3-exon-Sc0000042-1570713199:8824..9238Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000042genomeSc0000042:8824..73272 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00533