Blg00533.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00533.2
Unique NameBlg00533.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000042:8824..78036-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00533.2 ID=Blg00533.2|Name=Blg00533.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=69213bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000042:8824..78036- (Branchiostoma lanceolatum)
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG GGACCCCCAGGACTTTGCACGACTACAGGAGCCGCACGGGTCATAATTTC CCTGACGATCGTTCCGATAGCGTTTTGTGACTCTTTGTTCGGAGCTCGAA TTTGTTATTGTTATGCTAGGATAGTTTATCATTGCCGGAAGATTAACAGA CAAACACAAATCATTCTATTTACACGAGCGTCTATCATGATTAAGTACAC TCTTCATTATGAGTACAAGTACATAATACCACTACCATGTGATGCCATTT TCTTTGGGTGGCCCTGACGCTAGCCGCGGAAGCGAGGCTCGCATCATCGG ACACAGCATAATTTGCGGTGTTAATGCCTTTTTTATGATATTGAAAAATA CATCTTGCTGGAATAAGGTCACTAGTGTTTATTTCTTCTGTTATTTTTAC GGTATGTGCTGCAGAGTCGGCTGTCTCTATCATAAAGTGTTGCAAATTTG CTCTAGAGTCGGCTCGTGAAAATTGTTGCAAAATCTACCAGAAACAACGG 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000042:8824..78036-

>Blg00533.2 ID=Blg00533.2|Name=Blg00533.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1089bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000042:8824..78036- (Branchiostoma lanceolatum)
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GGCGTGGCTCCAAATCCCCCGCAGACAAGCGGGGTCACGGGAGGTCGGCC
AATCACAAGTCTTCTTCTTCGGCCCACGTGCCGAAGGGCGCCGCGGACAA
GCCCGAGGATAAGAAGCGTCCGGAGGAGCCTCGGGGCAAGGAGCCCGAAG
GATCCCGTCCGAGGACCTCCGAGGCGGGCCACGAGAAACGCAAGTCCGGC
GGGGCCAGCAAGAGACCCTCCGTGAGCCCGCACCATCCCGCTAAGGACGG
GCAGGGCGCCACAGGTCACTCACACAGTAGCAAGGCCGCAGAGCCGTATT
CCAAACCCGCGCAGCATTCCAAACCGGAGAAGTCTCCTCCGGTCCAGCCT
GACTCTTCCTCTTCATCATCCTCTGTAAAGATGGAAGCTTTGTCCACAAA
GGACGACGCCTTCCAGATGCCTGCGCCGCTGTCGACTGCACCGGGCAGCC
ACCGGCCGAGTCACAGCGGCGGGAAGGGGGGAGACAGGGCGGAGGAACGG
CTCAACGGCCTGCTCGCCGGGGTGAAGAAGGAGGCAGGCGAGAAGGAGCT
GTCCAGGGAGGACGTGAAGAGGAAGCTCAAGCTGACCATGCCCGACACCT
CCGAGGAGGCCAGGCTGAACTCCAGCGGGGGTCTGAAGAGTGCAGGCACC
GAGAAGGTGGAGACCATCCTTAAGGTAAGAACGTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00533.2Blg00533.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:77647..78036Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:77647..78036Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:41385..41493Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:41385..41493Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:40040..40912Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:40040..40912Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:8824..9238Blg00533.2-exon-Sc0000042-1570713199:8824..9238Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000042genomeSc0000042:8824..78036 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00533