Blg00408.7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00408.7
Unique NameBlg00408.7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000078:1127149..1152683+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00408.7 ID=Blg00408.7|Name=Blg00408.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=25535bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000078:1127149..1152683+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AGGTGCAGGTAGACCCTGCAGTCTCATGCCCGGGTCTAGGCACAACTGGT ACCCATGCCATGTACATGTGTATGAGGGAGCTCATGGTGTCAAACCTCTG CATGTAAAACAACCCAACACTGTGACTTATTGAGAAGAGTAGCGGTGACC TGGTGTGCTTGGCAGAATATGCGAGAAGCAGCAAAGCAAAGAACTTAGAC TGGCTAAAGCTTATCATAAGCTAAAGGAAAAGCACCATGCCTTGTCCGGA CGTTCTCAGTCTGAGTGCTTTACATTTTTTTACACATTAAGAATACTGTT TATTATACAGTCACATTCAAGTCCAATTTTCCTCGCACTAGCTATATTCT AACCTGCACATGTAGGTGGTATGATGAGCCCTGGTTGATGAATAAAGGGT TGAATATACATGAATTTTGTCATGTACATTTCACAGCAATTAAATCACTG AGAGATGTTGGATACTCATCAGAGCTTCTCTATCGTTCTGTTCCAATAAT TGTATTCCAAAGTCATTAGAAACCTGTAATTTGAAGAGAGTCATGTTGGT AGAGAAAGAATTCTCATGAGAAGATCTGTTCTTAGCGGATACATGAGTGC CAGCCTTAATTGTGTAACCTGGGGGTGTCTGAATGTCTTGGGTTACTGAT TGATCAATTTTTATGTTCCCTTCAGGCAGGGATTTTCATTGTCTTCTTGT TCCTTTTCATCATCTTCAGATGGAAAATAATCACAGTAACTACAAAAGAG AACATGCCTGTCAGTCATAAAGATTGACCTACATGTACATGTATATGGTA CATGGTGATTCCACTGGATAGTTATACCCCCCCCCCTTCTACACATACAT GTACATGTGCAGACTAATAGTAATAGAGACCCTCACTACTGTCAATCTTG AAAATTTTGAGTTTTTTTGTGTCAGTGAATATCCCCCAAAAAATTCTTGA 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AGACACGCTCAAAACAATATTTCCATTTTTCATGGGGATAACAAGTACAG TTGGGACATCCTCACTAGATTCTAAACATTAAATAACGCTTGCAGCTACA GTAGTTTTGTAAAGAATCGGTGTGGGAGGTCATTCAGTGTAATATAACCT GCTGCTGCCGCACTGCATGTCTGCAAATCAGTTTTTTTTTAATCAAAAGA CGTCTTGTCTTTTTTTCTAGATGAAGATTTGGCCACTGGTATATGTCATC CATAGAATGTAATTGATGTGACTTTATCTGACATCGTGACCTAGATTTCA GCTGTGGGTGTGAGTAGCCTAGGGGGTAGGCTCCCTTACAGGAAATAAAT CATTCCTTGGATATTGTGATTCAATTTGTAACCTTTTTGCTGTGTGTTCC CAGGCCTGGAATAGAGGCCAACCTTTTGTACAATCATGTAAATCTGACTT CTACTGTTTTGAGGCGGTTTCTCATGATCAGAGCAGACATGGCCCGCAGG ATATCAACACATTAGCAAAAAGCACTTGGTCCCCCTTTACACTAGATGGC AATCACTGAGTGACTGTACAGCAACCAAAATTTGACTGTGTAACCCTTGA TTTCATGATTGGAATACAATGTATGTTACAATATCATCATCATTATCATC TACTGGTTTCTGCTTTTGTTGAAATGTCCTGCAGCTACATTCAGTCTTCT TCCACTGTGTCTTGCATCTTGCAATCAAGCTCCCATGCATTATGAGCTCT GGGAGTTTCCTTTCTGTTATAGGAGGGCCTTATTTTAAGTCTTCTGGTAC AATATGTATGATATATTAAAAGATATCCATGTTCACACAGAACATGAAAA GAATTTGTTCTGTGAAATCCGTTCAGCGATCTGTCAAATCTTTGGTTGGT CAGCGGTTGTAGTATAGCCTCTAGTGGAGAGGGGATGTTAATGAACAAAA CCCACATTGAAGTTCAGTGTAGATGATGAAAGGCAGCAGGCTCAACATTG AATGATTTATCATGATGTAGGCTAAGTTGGGTCCATCTGTAGCACATCTG GCAATACATCATTGACTGGCACAGATGTCAGCTTAACCAATGAAACTACA GTTTTATGTTTGTCAATGATGAGGCCTGTTCATGTATTGATTTCTCCAGC CTGTAATCATCACACTAAGAGGGATCAAAGGTTATGGACCTGATTACATA TATATGATATAATATTATCATATTTTTAAAAGCAAGAAAAGATTGTATTG AAACCAGTCATTCATGACTGATATAAAATCAGTTGATACAGTTTTGAATT CCAAGGGTGTGCTGTGGTGCTATGATACATGGCCATGATCTGTACCCTGA GCCATCCAACTTGTGTGCTGTGCCTACTAATCTAAAAGTATATTACTTGT ATTAGAGTTTCAAATAGTCAATGTTTGCCTGTAGTTGAGTACAGAAATTC CAGTTGTGCCCCTTGTTTGTACATGAGGCTTTAATTCAATTACATTTTGA ATACCCTTGTATGCAAATGCATCTTGTTCAACACAACCTACCACAGACTG TTTTGTCTGTAAAGAGCTAAATTTCTAACTCCAAATCTGTTGCCGGCAAA CTATCTAGCAAAGTAGAGCCGTTTTAGATCCCAGATGCCGTATGGAAGAC TGGAATACACTGTCTGACGTACGACAAGGCCGAGACATTACTGTGTCACC ATTGTACGGTAGAGACCTTTCCCTCACACATCCCTGACCCCCGTTGTTGA CCTCTTGACCCTCATACCTCACCTTGCTGTAGGCTCGTTCTACTAAGTCA TCCCAGAATTATGATGGTGACACAGTTGTCCATGGGCAAAGTCTTTCTTT TCACCTCCAAAGAATATACATGCAGTGTTCCAAAGGCATGCAGAGTAAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000078:1127149..1152683+

>Blg00408.7 ID=Blg00408.7|Name=Blg00408.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=762bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000078:1127149..1152683+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGCAGGGGAGAGTTTGGTGCGTATGGGTCTGTGGAGACAGGTGGTTT
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GTGAGTACCAAAGATGGGAATTTCATACTGGGTACTCTGTGTCTTATATA
TCCTTCTTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1139314..1139404Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1139314..1139404Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1139714..1139788Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1139714..1139788Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1140234..1140296Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1140234..1140296Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1143369..1143524Blg00408.7-exon-Sc0000078-1570713199:1143369..1143524Branchiostoma lanceolatumexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00408.7Blg00408.7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000078genomeSc0000078:1127149..1152683 +
Properties
Property NameValue
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