Blg00397.24 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00397.24
Unique NameBlg00397.24
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000570:36691..62277-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00397.24 ID=Blg00397.24|Name=Blg00397.24|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=25587bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:36691..62277- (Branchiostoma lanceolatum)
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CAAATTATGCTAATTGGGACTTAATTTGCATAGCTAATGAGGAAAATCTA TATTTGCAGTGTTTTCCATTATCAGACTCAAATACATGCAACGTATGTAG TTTATGAAAAGTGGAACATCAAGAGACAACAATTATGCAAATAAATTCCT AATTTGCATAATTAATGCAAAACACCATAATTCATCTAATTGGAAACTTA TAGGACTGTCAATATGATATTTAGTATGCAGGTAGCTTAGACAGAGATAT ACATAATGTAGTGCAAGTTATGCTAATTGTGACTTAATTTGCATAGCTAA TGAGGAAAATCTATATTTGCAGTGTTTTTCATTATCAGACTCAAATACAT GTAACATATGTAGTTTATGGAAAGTGGAGCATCAACAGATACCAATTATG CAAATAAATTCATAATTTGCATAATCAATGCAAAAACACCATAATTCATC TAATTGGAAAATTATAGGACTGTCAATATTGCAACATGTGTAAGTTAGAT AAAGGTGTTTATGACCAAGCATAGATTATGCAAATTTGTCTATGTTATTA AACGATATTATTATGGTTCATGTAATTTCAGGAATTTTTTTCATTTTGAT GTCATTGGTGTCTTAAACACTTTAAGTTATGCTGACTACAAATATCCGGA AACACAAACAGACAGGTACACAGACAGACACACAAAAACAATGTGATTAT ACAATATTCATTGTATAATCATAGATTGGTTTTCACACCCAGTACTTTTG GAATCTACCATGCATGCTATTGACCAGAACTCCATTGTTTCTTCAGATAC CAGTCGGTGTTACGCTACTGTGCTGAGTCGAAAGCATCACCTGAAGAACA AAGATACGGGTGTCTTCTCTGCAGAGGAGTACGACACACACCCTGAGAGA TACATCTCAACGTTTGCACAAGAGGTACATATACTGTGAATAGTTTCATC AGGTTGGTAAGTCACTAAATAAAAAGATTCTTTTTACACAACCAAGAGAT TTATTCCAACCGACGTTTCGGTGACCATCTGTCACCTTCTTCAAGGCAAT TCTGACTGGTTCACATAGCAATTCAGTACGGGTGTTGCTGCTTATTATTA ATGACATCATCAAACGCAGACTGCAGGGCGACACAGAACTGAAGAAGAGA ACCAACCTGGGAGTAGATGACATCATAAAACTCCTTACCTTCATAGTGAC AACTAGCTACTTCTGCTTCAGAGGGGACATCTACCAACAGAACTTCGGGA CCGCCATGGGGAGCCCAGTATCACCAGTATTGGCTAACCTTTTCATGGAG TGGTTGGAGCAGCAGGCCATTGCTACAGGACCCATCAACTGTACACCCAA GCTGTGGAAGCGATACGTGGACGACGTGCTCGAACTTTTGAAAAGGGGAG CAGAGCAACAGCTGACTGACCAACACTATCGACTCTACATGTAACATAAA ATTCACCCATGAAACAGAAGAGAACGGTACCATGCCATTCCTGGACACAC TACTAGTTAAGAAAGAGGATGGCACGGTTAAACTGCTGATATGTAGGAAG AAGACCTCACAGATCAGTTCAATTCACACCATCCTCTCCACCAGAAGTTG GGAGTCATCCAAACACTGATGGACAGGTGCAAGTCAGTTGTTACTGAAGA AACGGACAGACAGTTGGAGATGGAACACATCAAGCAGGCCCTTTCCCGCT GTGGTTACCCTGACTGGACTTTCAAGAAAGTCGAACATCAGACCAACAAA ACCAAGCAGAAGAAAGACAGAAAGAAAGGAGAGGAGACGTCTAAAGGAAG GGTGACCTTACATGTACCTAACATCCAAGGCGTCACAGAACCACTAGAGA GGATCTTCAAGAAACACAACATTGCCACAGCAGTCAAGCCCAAAACCACG 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TAGTTCCGTTGTACAGATAATTGGGGGATTAATTTGATACCCTTTCTTGA GGCCGACTCCCCACAGGCTCTGTGGTTCGCGTGTTGTGCTTCCCTGCATA GCGGAGTACTCTTGGCATACTTTTCACTCTATTTGGCCGATTTCTACTAT TTTCCCAGCGATACGCGGAGCCTGGTAGAGGCTAACACTTCTGTACGTTT GGGACCGCATAGTGATGTCATCCCCTGTGATTGTACATATGTAAATACTT TCAGTTTGTGAATGCATCTCATTAATATGTATAAGCAGCAACACATGTAC TGAGTTGCTATGTGAAGATTCAGAGCTGTTGTGAGCTGTGCCTTATACAT GTATGATGTTTATGATAGCAGAGTTCCTATTTCCTGTAGTATGCTCCGTA TGTGTCCTGTCTGGTGAATGGAATCTACTGGCCGCCGAACGCACCACGTC TCCTGACCTTCTCCGACCTTCAGCACCTGCTCAGTCCAGACATGGCGCCC AAACACGTACCGGAGGGTCCGGGCATGCCCAGACTGCCTCACCGGCTGGT GGCAGTGTGCGACATCTCAGCCGATCCCGGCGGTTCACTGGAGTTCATGA CGGAGTGCACCAGTATCGATGTCCCCTTCATTCTGTACGACGCTGAACAT CACATCCTCAGACCAAGGACATCAAGGTACGCATTCTCGCATACAGTACC AGTCATTTACAATACATGAGTGTATATTTGTTATTGACCAGATCTAGAAT TCCCACAGATACCAGTCGATGTTATGCTATCGTGCAAGTCTAAAGCACCC CTGAAGAATACAGATATGGTGTCTCTCTCTGTGATTTTACTTTGGTAATT AGACCAGGGGTGCCTACAGAATTCATACAATTTTTTGCAGAATACATACA ATCCATAACTAAGAAACATATGAATTTGACAGAATTCATACAATCTACTA CAAAGAAACGTACAATGACAATGCTTAATAATTTTTTGGGCATAGCATCT GAGGCAAATTCAAGATGGTGGACTCAGGACTTTTGTTTCTTCCTACAATA TCATTTGCTGTAAAGAACTTATCCCATCCTGCTAAATGCCAATTTGAAAA TATGATGGCAATGTTAGTCTACAAAACTGTGTTTCTTAATCATGGACTGT ATAGATTCCGTAAAATCTGTTTATTTTTCTTTTAGAAAATTGTTTTAATT CCATAAACTTCTGGCAGCCGTGTATAGACCAAGTCCAGTAATTTTCTACT CTGTGCAACCTACACGCTCATGATACATGTACATTGTACTCTCAACCAAA TTATGGTCACAGCACTTTCTTCAGCTGCTACTTGTAAGTGTACATATTAA TAACAAGGCATTGCTGCTATGTTATAAACCATTGCTTGCAACTTACATCA TTAGCTTTTTGATAACACAGATCTGTTTTTGGCTGCAGTGTGTTTTTTTG GTTGTTTGCCCTTCTTTGCTATTGGTAATTTGCTTTTAGTTTTACCTAAA TGTTTTGGTTTTTTTTGTCCATTAAACCATATTCTTCTACCAGCAGTAAT GTTTCTGGATTTCTATCATTAATTTCTTTGATGAGTGTATTATTTTTTTC GCCTTTCATTCAACAATTTTTTTTCCAAATTGACTTTTAGGATGATAACC ACTCAAATTTGAAATCATATTGTATTCTCATTGGTATGTTTCAAGAGAAA CTGTTCAGGAACATACATGTGAAAGTTAAAAAAGGACAAAGTAAGCAAAA TTAGGCCACAAAAGAGGAGAAAACAATAACAGAATAAGAGTATCGGTTGG ATGTTACTTGCTGATGATTCCCTGTTAAAATTTTTCCTTCAAAATAAGTT CAGTCATTCATTTTGCATAGACGAAAAATGATTTTCATGCAGCAGTGAAA CATGAATCTAAACAGAAATATCATCTACTGTTATTTTATTCTGCACACTT TTTCACCAGTACACAGTTTCTTTAAACTGTTGTGTTTATTTTGTTGCCAT GTAGTCAAAGCAGAAAGTCTTACCAGAAAAGTCTTACTGTTTGTGTGCTG TTCCTCTCCCGTAGTCTGATCACGCCCTACGGTAGACCAGCCACACTGGC TGACCAGGACTCCAGCGAGTACATGAGCCGCAGGCAAGCACCTTAGCTTT ATCATAGCCTCCTTTAATTTGCAGCCTATTAGGAGCGCCAGCATTAGTTT TTTTTTTGAGTCCAGATTTACCACATGTTGGAGCCAGGATCTTTTGATGG GGAGGTTGTACATGTACATGACTATTTGCTGCCCGAGAAGGCCTGCTATC AGTTGACCACTACAAAGTTTTCAGACACCAGTATCACCATTTGGCACCTT TCTGTAATAAACACCACTAGTGCACTTTGAGCAGTGACCCATTACTTTCT AACAGTAACCGGGGTCACATAGCTCTCATCATAGCTTCCCAAACCATGAA GCATACCAAGGAGGTTTCTCTTTGTACAGTCAAATGGACTAATAGAGGGT TGCAAATACAATCTCCTCAGCATTAGAACCTAGCTGATATGTGGAAATTC AAAATTGTGAATCAGCACTCCCCCGAAAATAAACACCGGTGCTCCTAAAA GGCTGCAAAGGCTTTATTGCCTTTTTCTGCAGCTGTACTGTGTGTCTCAC TGTCACCCCTAGATTTAATATCAGGGCTTTCTGCAGCATCTGTATCCTGA TACCATCCCCATTACATTATAGCTTCCAAGTCTGTTTTGTCTTCTCTGCA AATGATACTCGGCAGCTATGATGGGGATGGAAACCTTGCTATAGCGTGTG TCCTTCTGCCACTGAATTTTGCTGCTGAGGACTGACAAGATTTCAACTGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000570:36691..62277-

>Blg00397.24 ID=Blg00397.24|Name=Blg00397.24|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1401bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:36691..62277- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTGGACTGTACGCCTGGAGCAGCTGGCCAGGGGTACCACATTCCTGAT
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CGTCCAATAGGAGGGCGTATCCCATGCAGGAGTATGAGAAAGCCGGTGCA
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GGTTCCCATCAGTGGACTACTGCCAGAGAAAACCTACGCCTTCTTCTCCC
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GAGGAGGGTTGTGGCTTTTGGCAAGTTTGCAGGGGTGTCAGGAATGATCA
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CCGTTCATGCACATCGCTCAGAGTCACAACTATCGGAACAGCGAGATGGC
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CCCCGAGGACCTAAAGGAAGTGTGTGAAACTGGAGATACCAGTCGGTGTT
ACGCTACTGTGCTGAGTCGAAAGCATCACCTGAAGAACAAAGATACGGGT
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A
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:51461..51545Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:51461..51545Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:43304..43431Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:43304..43431Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:38295..38363Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:38295..38363Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:36691..37091Blg00397.24-exon-Sc0000570-1570713199:36691..37091Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00397.24Blg00397.24-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000570genomeSc0000570:36691..62277 -
Properties
Property NameValue
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