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Blg00235.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00235.1
Unique NameBlg00235.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000151:20402..56593+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00235.1 ID=Blg00235.1|Name=Blg00235.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=36192bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000151:20402..56593+ (Branchiostoma lanceolatum)
GACCTTTCACCTCTTGACCAGGGCTGCACAAACAGAGACAAGGTCAGTAA GACTCTAATCTACCAATCGTTTTGTCTATGGTAAGAGTAGCCTGATTGGC CCTTGGATGGGGAACACAAGTTTCTATGCCTTATCCTAATTGCATTACGA GACGAGCTGACCCTGTACTATTTTTAGCAAGCAGCGTACATAAAAGGTAT GTCTACAGGCAGTCTAGGACAGCTGCATTGGTGACCTTTAAATTATTTCA ATGTCATATGTGTGTGGAGGGGAGGGGGTAAATGTGATTTGACGAGCTTG CGAGTATCTTCAGTGGCATCTGGGGTCAAGGAAATTGGCGGATAGCGTTA CAAGGCTGACTTCAAAGCACAGTCGGATGTTTTAATGCCGTATTTGTATT ACTATCTATGTATCTGTGTCTGCGATTCTGTGACCATGTAGTACAGCTAA ATGTGGTTGGGGGTCTATCATATACAAATGTTGAGGGGTGGTGGAAATAT TGCTTTTGACATCCTATTAGTTTTATAAGGAAAACCCCGCCATAAAAAAT GAACCATCCCCATGTTTGTTTATCACCTATACTGTTAACCAAGCAAACCG TGATGACGTATTAAATAAAGAAACCACGTGTGCAGTGCGTGTCAGTCTCT TAACCTAAAGCGAACACAAAGTCACACACCCTTAGAGGTCGCCAAAGTAC TCTCCAAGCAGAGGTTAGTGGAGAACATCGTGACCTTTTTAACAGTTAGT GGAGATGGCCGATGAAAAATGGGGCAGAGGATAAAAAAGGTAACGATCTT CTCCACTGACGTCTGCTTGGAGAGTACGCCAAAGACTCAGGCAAAACGAG ATAACCACAAACAAACAAAAGAAAATAAATTAAAGAAAAACAACTCCATT AGAATAACTCACTAAAGAATCCGGCCACGAGTTTTTGTATTATATGACGG 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TACTATGAATGTTCGAGCCACTTGCAATTGTTTCCAAGTGTAGACATATA ATGCACGTTTCATTTAATAGAAACAAGAAGAGAAAATGAAATATCGACTT CCGACGAAAATCAGAAGCATTGCTGACGTCACACCTGCGTAAGAAGTACG TTACAGAGCTTTGGTCAGACAGCGTCGAAACTCCCAGGGGGAATTCTATG AGCTTGAGAATAGATTATTTTCTCAGGAAACAGATGAAATAACTAATACG CATATATGTCACGTGAATTCAACATATCAGCTGGTCAATTGTCCTTGTCC ATTGCTATAACTTTTGGGTTTCCGTATATACAATGTCCATACTATGATTT CGTTATTTTAAGTTGATTTCTTAAATCTCTCGCTCACTTGTAATTAACTG TCTGACCATCGTATACGTTTTGTTCCTATATTTGATTTAATTGTTTTTAA AATGTAGGCGGAGTCGGACTTCAGGAAGGATAGTGTGAAATCTGTAAAAA ATTGTACACTATCGGAGATCTTAACCCTCAAACCACCATAGCTTTTTTAC GACTAATCTTACCGTATGGGGTCAAAACTGACCCCACAATGTTTTCTACA AATACAGCTTTATTTGTGACTATTTTTGTGGTTTGTATATATGTATAGTT TGAGTAATCTATAAGGGACAGTTTGACATGATTAGGTGTGAATAATTTCT GCTTATTATCATAATTTATGCAAAAATAGGAACATCGTCTTTTGCAACTA ACGCTATTCAGACAAGCGGGCTCTTTTGAAGCCTGCGCCTACACTTGATG TCATATAGCATCTGAATGTCTTACGCTAGAACAACCAAACTTGGTCACAT TTGCTAAAATTTCGTTGGCAACAATTTGAATTAAATGAAATAACTAATCA ATGTTTTCATGTTGCTATGGCAACCGGTTTCTGAGAGCCATATTTGGAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000151:20402..56593+

>Blg00235.1 ID=Blg00235.1|Name=Blg00235.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1740bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000151:20402..56593+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GGAAATCCGATTCTACTGAATGGATCCGTTCCACAGGATAATGAGACTTT
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AGGCCGGGAGGACTCACGTGTTCCTGGAGGGAAGGAGAGAGGTCTGCAGG
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GAACCTGAAGAACCCGGATGAAGCAAAGTGGGCTGACGTGTCGATGGCGG
TGTGGAATTCTGGGGGCATCAGAGCACCGATCCCATTCAGGCCGCCAGAC
GGTATCATCACAACGGCAGACGTTCTGACAGTTGTGCCTTTTCAAAATAC
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GCTGGAAGCTCGGTGTTCGGAATGCATGGTGCCGCAGTTCGAGCCAGTAG
AGAAACAGAAGCGATACAAGGTGCTGACAAGCAACTTCATCGCCGACGGA
GGAGATGGTTACACCATGATTAAAGAGAACACGCTTAGTCGGGATCCAAT
CGGGTATTTGGACTCGGACATCCTGTTTGCGTACCTGGAGGATGCAAGCC
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00235.1Blg00235.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:20402..20443Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:20402..20443Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:25592..25793Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:25592..25793Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:29777..29914Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:29777..29914Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:30501..30717Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:30501..30717Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:31414..31599Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:31414..31599Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:32567..32767Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:32567..32767Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:33309..33424Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:33309..33424Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:34303..34450Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:34303..34450Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:34775..34921Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:34775..34921Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:53897..54100Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:53897..54100Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:54566..56593Blg00235.1-exon-Sc0000151-1570713199:54566..56593Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000151genomeSc0000151:20402..56593 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00235