Blg00172.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00172.0
Unique NameBlg00172.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:1012150..1029417-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00172.0 ID=Blg00172.0|Name=Blg00172.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17268bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1012150..1029417- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGTGCGGCAGGCAGTTCAGTCAGCTGGGTTATATGAAGAGACACATGCGC ACTCACACAGGGGAGAAACCTTACAGATGTGAGGAGTGCGGCAGAAAGTT TAGTCAGCTGGGTCATCTGAAGAGACACATGCGCACTCACACAGGGGAGA AATCTTACAGATGTGGGGAGTGCGGCAGGCAGTTCAGTCAGCTGGGTTAT ATGAAGAGACACATGCGCACTCACACAGGGGAGAAACCTTACCGATGTGG GGATTGTAGAAGAAAGTACAGTAGCCAACAAAACTTGAAGAAACACATGC GGACTCACATGGGAGAAACCTTATAAGTTTGATGAGTAAACCAGGCTGAT CTTTGAACTGGGAACATTAAATACATGTAAATACTTGCAGACTCACAAAG GACAAACCGTCTAGGCCAGACCACTTTAGTTAGAAATCAGCTTAATCCGT TACTTTCTCGTCGGTTGATATGCAAGCTAACAAAGCTTATTGGTATCGTG GGTGCAGAAGTCAGTTCAGGTTCACCATGTTGGTTATATCGAAAATCATA CAGGTTTGACAAAGGACCAAAGCACTGGTCGAACTTGAAGTCAATTAATG GGGTTGTGGGTTGGAGATGAAGCGAACGTTGTAGCAAATAAACCTTATGA TTACCACAGAAATGTGTTCATGGTGGTTTAGTTGTTTCTGCTGTGTTAGT TGGTTCTGTTTTGGTACAAGATTTCTTCGGTTAAAAAGAAAACAACTTTT AACATTGCTGTAGAAGTACGAGGTTTAAAGTAGTGGAAGTACAATGTTTA AAGAGGTATTAGGAATTTTTCGCTAACAATAGCATCTTTTGTTATGGTAG CATTAGTTTATATGTTGTACATCACTTATCAATCCGTATAACATTTTATA CTGAAATTGTTAAGTTTAGCTTAGATATGTAGTTTGGTCTTACTTTTAAT 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GCTAGAGAAAAAAAAGTAAGTAAGTTGTAGAGGTATCTTTAGGGTATTGG TTATTTGAATCAATGTCAAGTGCTACAGTTTCTTAGTTGTCATGTATTTG TTGAGTTTTGTCATCTAGGTATAAAAGAAGTTCGCTGTTGAGAGTAATAA AAGAACCCAAAAAGATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:1012150..1029417-

>Blg00172.0 ID=Blg00172.0|Name=Blg00172.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=945bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1012150..1029417- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAACCACAGACAGCATAGAAGATTTGGATGTCGTCAAGAGAGGAGC
AGCAGGGGGTTCTGCCAACAGTGTTTCCACCTCGCAAGGTGAAAGACATG
AGGAGGTTGGGGAGTCTAGTAGGAGAGACAAAGGTGTGAAAGTCTACATA
TGTAAGAAGTGCAGCAAGCAGTTTGGTCAGCTGTGTCATCTGAAGACTCA
CATTCGGACTCACACAGGTGAGAAACCTTACAGTTGTGAGGAGTGCAGCA
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GGGGAGAAACCCTATCGGTGTAAGGAGTGCAGCAGGCAGTTCAGTCAGCT
GGGTCATCTGAAGGCCCACATGCGGACTCACACAGGGGAGAAACCCTACA
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CACATGCAGATTCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGTGAGGAATGCAG
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CAGGGGAGAAACCGTACAAGTGTGAGGAGTGTGGCAGGCAGTTCAGTGTG
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CAAGTGTGAGGAGTGCGGCAGGCAGTTTAGTGTGCTGGCTGTATTAAAGA
AACACATGCGGACTCACACAGGTGAGAAACCCTACAAGTGTGGGGAATGC
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CACAGGGGAAAAGCCCTACACGTGTGAGGAATGCAGTAGACAGTTCAGTG
AGCTTGGTCATCTGAAGAGACACATGCAGACTCACAAACAGCAGGCAGAT
GCTGCCGAACAAGGGAGAAAGTATCCTTCAGTCCAGAGCACTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00172.0-exon-Sc0000026-1570713199:1029400..1029417Blg00172.0-exon-Sc0000026-1570713199:1029400..1029417Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00172.0-exon-Sc0000026-1570713199:1012150..1014069Blg00172.0-exon-Sc0000026-1570713199:1012150..1014069Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00172.0Blg00172.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000026genomeSc0000026:1012150..1029417 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00172