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Blg00168.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00168.2
Unique NameBlg00168.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:1789421..1808387-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00168.2 ID=Blg00168.2|Name=Blg00168.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=18967bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1789421..1808387- (Branchiostoma lanceolatum)
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GGATGCTGCCATCTCAGAAAAAAAATGTATTCCCTGTTATGTAATTCATT GTTTTTCGAGTGCTTTTCGATGCGAACGGGACTAGTGGGTACTTTATCGT ACTCATTTTTACTTCCTGAAATTATTATCTTTTAGAAAATATCGCCCCCT CTGGAGTTTCGGTCTCCTTTAATTAGCCTAAGATCATGGTAAATATACAT ATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTGTGATTTTGTGTATGTGTATGTGTTTGAGGTGGACATTT GCTTGTTTGCTTGTTTGTTTGTGAACTGAATGACCCACTCGAGAAGTGAA TACATGGTATTCTGTACGAACGTAGGTGTCAAACACAATGTATATCTAAT GTTTCTGTATGTAACGTGGATGAAATTATGTAACAACTTTATCTAACTTT TGTTTCCATCAGACTCCTGACGTTTCTACTCCGATCAATATCTGAGGCGA CGTCCAACACAACACATCACAACAAACATGGTAAAATATTCAGCACTTCA TTTTATTACCATGTTCATGATATAATAACCCTCATTTTGTAATGAACAGA GAAAGCCGTCACATCTATAGTGAGGAGAATTTTTTTTTTTTTGCATATTA GGAAGTAAAACAGACACTGCTGTATTACTCTACCGACTTTGTTCCAGCTT CATTATAACTCAAGTCCCCAACTGATGCATAGAATGTTGCCATATAGCTT GTATTAATCAGATGCACTGGCACACTTTGCTTGCAGCCACTTCCAGCGAC CCACGATTTACACATCTCCGGCTCTATCAATGGACATGAGTTTGACTTGG AGGGCAGTGGCAAGGGCAATGCAAAAGAAGTAAGTGTAGTTGAATTTTTA TCCTAGATTCCATCGTGCCAAAAATATGCATTGTGTTACAGAATTAAAGA 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TTTCTAGTTTACCTTGTTGTAACTTTTATCATAATATGTGTAGAGAGAGG TGATGGTGAAAGTTGATGATTATTCAACACTAATTTTTTAGCGTTAGATT GAAAAAAACACTGCTACGACCTACGCTAACTTTAAATATATCTGAAATTA CTATTACAAAACAGAAATACTCTATTGTATACATCAAGAACTAACGGTGT GTGGCTAAATATTCTTCAGCTGACCGGGAGCGGTTTCCCTGCTGACGGCC CTGTGATGACCAACTCGCTGACCGCTGCGGACTGGTGTGTGGACAAGCTG CTGTACCCCAACTAGAACACCATAATCGCCAAATTCGACTGGACTTACAC GTACGAGATTACATCATGTTCGATTCTAGTTCATAAGTAAATGATCGTTT CTTCTACATCGATATAAGTAATGAGCGTATGAACACTTTTCTTTAGACTT TTGAAAGCATACAAACTAAAGCAGTATTTCAGCACGTAGAAAATTATAAA TCCATACAGTATACCTCTATGTGGTAGCAAGAGGCACAGTTCAAAACGTA TGCTAGTCTTTCAAAATACTGACCATTGGAATTACTATAGATAAATATTT GAAGGAGATGCAGGAAACTCTGTGCTATTGCCTGACCATTACAAAGTAAA TTGTCTGAAAAGAAGATGGTAATATTGCTGCTAAAAACGCCTGGGTCCAG AGCAGTAATTTGTATTGTATACCTCATCCCTAATAGCACTACCAGTGGCA AGCGCTACCAAAGTGATGTGCAGACCAACGTCACATTTGCCAAGCCAATA TCGGCCGACATTCTGAAGAAGCAGCCGATGTTCGTGTTCCGCAAGGTGGA ACTCAAGCACTCCAAGACCGAGCTCAACTTCAAGCAGTGGCAGAAGGCAT TCCAGGACATCGTGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:1789421..1808387-

>Blg00168.2 ID=Blg00168.2|Name=Blg00168.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=597bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1789421..1808387- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCCTCTTCCAGCGACCCACGATTTACACATCTCCGGCTCTATCAATGG
ACATGAGTTTGACTTGGAGGGCAGTGGCAAGGGCAATGCAAAAGAAGGTT
ATCAGGAGCTACACCTAAAGTCCAACAAGGGTGACCTTTCATTCTCCCCC
TGGATCCTGGTCCCACACATCGGCTACGGCTTCTACCAGTACCTGCCCTT
CCCCGACGGAGCGATGTCCCCTTACCAGGCCGCCATGCACGATGGCTCAG
GCTACGTGATGCATCGTACAATGCAGTTTGAGGATGTTGCCTTGCTGCAT
TCAGACTTCCGCTACACCTATGAGGGTAACCATATCAACGGAGATTTTAG
GCTGACCGGGAGCGGTTTCCCTGCTGACGGCCCTGTGATGACCAACTCGC
TGACCGCTGCGGACTGCACTACCAGTGGCAAGCGCTACCAAAGTGATGTG
CAGACCAACGTCACATTTGCCAAGCCAATATCGGCCGACATTCTGAAGAA
GCAGCCGATGTTCGTGTTCCGCAAGGTGGAACTCAAGCACTCCAAGACCG
AGCTCAACTTCAAGCAGTGGCAGAAGGCATTCCAGGACATCGTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00168.2Blg00168.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1808293..1808387Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1808293..1808387Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1803787..1803849Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1803787..1803849Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1803452..1803544Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1803452..1803544Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790848..1791002Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790848..1791002Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790488..1790587Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790488..1790587Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790054..1790118Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1790054..1790118Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1789421..1789601Blg00168.2-exon-Sc0000026-1570713199:1789421..1789601Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000026genomeSc0000026:1789421..1808387 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00168