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Blg00168.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00168.1
Unique NameBlg00168.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:1789955..1808397-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00168.1 ID=Blg00168.1|Name=Blg00168.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=18443bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1789955..1808397- (Branchiostoma lanceolatum)
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GAATTCGCAGTTTCTAGTTTACCTTGTTGTAACTTTTATCATAATATGTG TAGAGAGAGGTGATGGTGAAAGTTGATGATTATTCAACACTAATTTTTTA GCGTTAGATTGAAAAAAACACTGCTACGACCTACGCTAACTTTAAATATA TCTGAAATTACTATTACAAAACAGAAATACTCTATTGTATACATCAAGAA CTAACGGTGTGTGGCTAAATATTCTTCAGCTGACCGGGAGCGGTTTCCCT GCTGACGGCCCTGTGATGACCAACTCGCTGACCGCTGCGGACTGGTGTGT GGACAAGCTGCTGTACCCCAACTAGAACACCATAATCGCCAAATTCGACT GGACTTACACGTACGAGATTACATCATGTTCGATTCTAGTTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:1789955..1808397-

>Blg00168.1 ID=Blg00168.1|Name=Blg00168.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=447bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1789955..1808397- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCCTCTTCCAGCGACCCACGATTTACACATCTCCGGCTCTATCAATGG
ACATGAGTTTGACTTGGAGGGCAGTGGCAAGGGCAATGCAAAAGAAGGTT
ATCAGGAGCTCCACCTAAAGTCCAACAAGGGTAACCTTCCATTCTCCCCC
TGGGTCCTGGTCCTAAACATCGGCTACGGCTTCTACCAGTACCTGCCCTT
CCCCGACGGAGCGATGTCGCCTTACCAGGCCGCCATGCACGATGGCTCCG
GATACGTGATGCATCGTGCAATGCGGTTTGAGGATGGTGCCATGCTGCAT
TCAGACCACCGCTATACCTATAAGGGAAACCATATCAAAGGAGAGTTTCG
GCTGACCGGGAGCGGTTTCCCTGCTGACGGCCCTGTGATGACCAACTCGC
TGACCGCTGCGGACTGGTGTGTGGACAAGCTGCTGTACCCCAACTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00168.1Blg00168.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1808293..1808397Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1808293..1808397Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1803787..1803849Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1803787..1803849Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1803452..1803544Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1803452..1803544Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1802887..1803041Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1802887..1803041Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1802551..1802650Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1802551..1802650Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1789955..1790118Blg00168.1-exon-Sc0000026-1570713199:1789955..1790118Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000026genomeSc0000026:1789955..1808397 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00168