Blg00161.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00161.0
Unique NameBlg00161.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:1100032..1137301-

Legend: CDSexonpolypeptide
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>Blg00161.0 ID=Blg00161.0|Name=Blg00161.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=37270bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1100032..1137301- (Branchiostoma lanceolatum)
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TTGAATCCGTTCAGCCGTTCTTGATTTATCTTTGTGATTAGAAAACAGAC AAACATTTCCTAAAATATAGCCATCTTGGTGAAGGTAATTTCGGATATAC ATATACACATATGGAGAGATATAAGAGAAGTACAGATGTATATGAAATAA AAGTCAACCTGTCCAAATATGTGTGTTTACTTAGGTGCTGCAAACGGACG TGTCCAAACAGCGGAAAAGCCCAAGCCACCGGAAACAAAACGGATATCTT TAACCAAAGAATACAAAGCAGCAAGAACTCTGGGCGCCATAGTGGGCGCC TTCATCCTGTGCTGGCTCCCCTTCTTCGTCCTCGCCATCATCAGACCGTT CTGCAACGACACCTGCTGGATCCCACCGGTAGTAGATGGCGTAACGCTGT GGTTGGGTTACGCCAACTCAGCGCTCAACCCTGCTATATATGGAGGACTA AACAACGATTTTCGGGCCGCATTTCGCGCTGTTATATGCTGTTCCTTAAA AGACTTGAACAAACGGAACCAGGGTATGATCATCACAAGAAATTGTCGAA CTGAGATCAGACGAGGAAGCGAAGAATCGGCATCTTCTCCGATGGGAAAA TTGACATCTTTCAAATTGTCCTATATCACATTCAACAGGACACTCAGCCG TAGCAGTAATAAAGGCAGTGGGAGAAGCAACAAGCAGAAATTAGGAAGAA ACGTACAGACGACCCGTGTATGAGAGTGAACATACAAAATGTACATAGTG ATGATCTATATAGGATAATCCGTAAAGAGTTTCATCATGCCGGCAAATAG ATGGACAATGCAGTTGGCTATTGCATAGCCAAATGTAGTATATATCAGCC AGGGAAGTGGCAAAGGTTAAACAACAGAGGCTGTCTTTTCACTTAAAAGT CACCGTAGTCTACTTCTCCCTTAAACTACAAAGTACAGAGGGTATAGTAT CAGGCATGTGACCAAAAATGTTGTGAAAAATTAAGCCCCCTCTCGAATTG ACAAAGCACTAAACGAATTTCATCGACAAAAGACTAATATTTTTTAAGCG TTGTGTGTTTTGTTGTCTTTTTGTTCATACTTGTACGTTTTGAATGATAT TCCCATTATAAAGTTTTTGTTAATTATTACTATTTCCAGTGACACTGCCA GCGTGCAGTCTGTCCAGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:1100032..1137301-

>Blg00161.0 ID=Blg00161.0|Name=Blg00161.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=804bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:1100032..1137301- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGCCGGGCGGCCGTTGCGGATCTGCTGGTTGCCATGGCCGTGATGCC
ATTGTCGCTGACCAACGAGCTGGAGGGCAAGTGGGGACTTGGCAAGCCCC
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ATCAACCTCTGCATGATCAGCGTAGATAGATACCTGGCAATATCTCATCC
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CGTGGGATACACCATCTACTCAACACTCGGTGCCTTCTACATCCCAATGC
TGGTGATGCTGGTGCTGTACTGGCGGATCTACATCACCGTACAGAGGCAC
AAACACAGCAGCTTACGTCGCACCTACGTCACCAGGATGTCTCCTAGCGT
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CTAGTGGTGCTGCAAACGGACGTGTCCAAACAGCGGAAAAGCCCAAGCCA
CCGGAAACAAAACGGATATCTTTAACCAAAGAATACAAAGCAGCAAGAAC
TCTGGGCGCCATAGTGGGCGCCTTCATCCTGTGCTGGCTCCCCTTCTTCG
TCCTCGCCATCATCAGACCGTTCTGCAACGACACCTGCTGGATCCCACCG
GTAGTAGATGGCGTAACGCTGTGTGACACTGCCAGCGTGCAGTCTGTCCA
GTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1137290..1137301Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1137290..1137301Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1136899..1137065Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1136899..1137065Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1132352..1132443Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1132352..1132443Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1122012..1122142Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1122012..1122142Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1102714..1102867Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1102714..1102867Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1100801..1101017Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1100801..1101017Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1100032..1100062Blg00161.0-exon-Sc0000026-1570713199:1100032..1100062Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00161.0Blg00161.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000026genomeSc0000026:1100032..1137301 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00161