Blg00118.6 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00118.6
Unique NameBlg00118.6
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:14328..45180+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00118.6 ID=Blg00118.6|Name=Blg00118.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=30853bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:14328..45180+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CATGGTAAGCCTGACTAATCTTCAACATGGTCTCGTCACATACAAAACAC AGTGCAAGCCTATATTGAGATACATGTATTACACAGAGGTGTTAGTTCCC TATTTGAGATTGCTTTGGGTCTGTCTTGCTCTGACAACGTATGTTTGTCA CTCCAAAAACTGAATACGTGCCTTTTTTTTTCCACTGTACAACCTACTTC CAGATTCCACTCGGACTAACATGATATCTATTATAAGAACACCTGTCACC CAAAAGACTAACTTAGATTCTAACTTACTGCACTTACCACTGCTATTATG TATTGTGGTGTAACAATTCCTGAATGTCCGAACAGTTTCCTGTCTGAAAA TTTCTTACACAGCATTTAAATTCCTGCTGGCTAGACCTTTCTGCATGAAT ACCTCTCCTATATGCAAGGCAACATATTTGCAGCTTTTTTTATTTGGTTA CTAATGCTTGTGTTTTGATCTGCGGCTTCTCTGGAGGATTCACCAATCTG CCCTGGCCAAACTCAAACAAAGGCAGGACGAGTTGCAAAGACTCAGGTAC CTGTTTGGTACAACCATATTTCTTCTCTCTGAGGCTACATCATTCAGTTT TGTATCTTTGAAAAAGCATGGAGCTCTGCATGCATATTGGTGCACGGATC TAGAGTGAGAATTCATATATATATAGTACAAATGCACATCAGAGCATGTT TTAGGCTTGAAAGAGCAGAAATTTAAGGTTCAGTGTTGCATGTAAACATA CCAAATTGTAGTGACTGAGGAAACCTTAGTTTTCAAACTTAAAGGATGAA GCAATGCGTCTGCATGTATACGCCAAAAATAATTACTCAAGCAACTGGAT AAGATTTTGAAAGTTGCTTGAGTAATTATTTTTGGCGTATCTTATTACCT GGATGTCTAACCTTCATCAACGTCTGCATGTATATTTCATAATCTTTAGA ACTAGACTAAGTAGAAGTACAGATACCAAATGAATGTTTTTCACACCTGC TATCACAAACTTAAAGTTTGGTTAAAGAACGGCCTTTCTTTCTCAATGTA AGATGTAGTAACTAAGGGAAGGTAAAACAAGGTGACGGGGGAGGGGTGGC TCCTGGGTTATGGTAAAAGAAAAAGTAGACTAAAGATGCTTAAGTTGACT GAAAATGAAACCGGAAGACAACTAAAAGGGAAGGAAAACATCAGACTATA AGGACATTAATTTTGTGAGTTTCGCTCCAACCAACATTATATTTTTTTTG TGTATCATGGTTACAGTTACCGTTTAGTAGATGTTAAAGTAGCAAATTTT TAAGGTACATTCAAGAAAAAATTCAATATTGTTCAGTATGACCAATAGTT CCAGACATGTTTTTTGGGGCTGTAGTTATGATGACTGATGATGATGTTCT GGTGTTTACAGGGAGGCTGAGGAGAAGAAGAAGCAGGAGGAAGAACAGCA GAGTAAGCTGCAGAAAAGAAAATGTAAGTTTGCAGTCTTCAAAACACTCT GATTATATATATATACTAGCTATCAATCTCAGTCAAGACAATATTGTTTC CCTCCACATCTTTATTCCCAGATCGTTCAACATCTGTGTATCATGACTTT TTCTAAAGAGGGAACAAGGACCCTTTGATCACACACCCTGACCATGTGCC CCTTACCCAGGCCAGGGGAGTAGATTTTCTGACAGGCATAACATTTTGAT TTTCCAGGGATGCTACCAGGTCACATGTGGTCACAGTCTTCAACTGTGAC ATGTCTTAGTCAAGAGTAATCCCTCAGGAAGCCTTAGAATGCCCCATTTT AGCTTAGATTTCTTTAAAACCCTGCTGCTTGGTTGTTCCTCTTCGGCCAC TGCAATATTTTCCTAGAAAACCCCCTGATCTTCCCCAGGGCACTGTCTGC 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:14328..45180+

>Blg00118.6 ID=Blg00118.6|Name=Blg00118.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:14328..45180+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGAAACAAATCGCGCGACAATTCCGGCAAAAGGTCCAGGCACTGCT
GGAGGATGAGTCGGAGAGGGACACACTGTACACATCACTCAGAGAGTACC
ATGAATCCATGTCCCTGTCGGAGCTCATCACAGACCTCAGGAAAGTCGTC
AACTCCCCTGACAGGATGGAACTGTTCGAGGATGTCAGACCTTTAATACC
TCTGAAACATCAAGTGGAATACGACAAAATAGTACCAAACAGACTAGCAA
GAAAAGCACGAATTGTAAAACTGGTGAAGAATGGACCAGACAGCCTGGGG
TTTTCACTACGGGGAGGAGTTGAACACGGAGTAGGCATATATGTAGCACA
CGTTGTACCCAGTTCACCAGCAGAGATATCAGGACTAAGGGTGGGAGATG
AAGTCCTGAGAATAAACGGTTACTCGGTGAACGAGTCGACACACGAGGAG
ATCGTGTTGTTGACGCAGAGCACGAATTACATAGAGATGAAAATTAGACA
TATTGGAATGCTGCCTATAAAAAGAACGAGAACAGACCAGTTGAGATGGG
AGTACGTCCATCCTGTGCCAGGCTCCCCCGAATCACCAAATGGGACGGTC
CTACCTAGTGAGTCTGTTGCGAGCGTGCCGGACACTGACCACACTCACAA
CGCTGGACCTCCCCCTGAGCCTACCAGCTCTGGAGAAGTGATCAACAACA
TGTCGAACGGAGCTCCGTCCCCCAAGATGGGGAAGGAGGACAGGAGGGTG
TTTGTGAACCTGGAGGGAACTCCGGGGCTGGGATGCAGTATATGTGGTGG
GCCGGCCTACAAGCCTGGTGTGTTTGTGAAGAACGTGAAGCCAGGGTCCA
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GGGATAAATTTGACACATGCAGACTATGGCGAGGCTATCTCAGCTCTAAA
AGGCAGCAAACAGCTAACAATAACAGTGAGGCCGCAAGAGGGAGAAGAGC
TGTTCAAAGACAACATCATCCCCAAGAAGAGTATCCACCTGGACAGCGAG
CCCCAGCCCCAGGACTCGGAGGAGAAGAGGGCGGAGAGGGAGGAGCTAGA
GAGGCTCAGGCAGATCGCTGTCAACAGGGAGAAGAAACGCCAGAAGAAAG
AAACGGAAGAAAGGGAGGCTGAGGAGAAGAAGAAGCAGGAGGAAGAACAG
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TAGACGACGAGAAAAAACAAGAAGAGAGTCGTAAGCACCAGGAGAGCAGG
ACCCAGGCCCAGCGGAGGGAGAGTGAGAGGAAGGAGAAGCAAACACGACA
GGAGCTGGTAAGAGTTGCAACTCATCTACCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00118.6Blg00118.6-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32271..32354Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32271..32354Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32664..32723Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32664..32723Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32907..32974Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:32907..32974Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:33357..33430Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:33357..33430Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:33944..34052Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:33944..34052Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:34234..34258Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:34234..34258Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:34536..34614Blg00118.6-exon-Sc0000026-1570713199:34536..34614Branchiostoma lanceolatumexon
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