BlTCONS00113908 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlTCONS00113908
Unique NameBlTCONS00113908
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000231:24354..40789-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>BlTCONS00113908 ID=BlTCONS00113908|Name=BlTCONS00113908|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=16436bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000231:24354..40789- (Branchiostoma lanceolatum)
CTACATCCCAAGGCCCCAAGTTCCGGATGAGCTTTTGTTTATGCAATTTC AATTTTATATCAAATTTCTGCAAGATTTCTGCAACGTTTGAACCATAACA TGTTCAGGTATTTTCTGGTAAGTACATTGCGCCATATGACACTTTCTTGA TGTCCAATTGTGTTTGTGAGTTTTGCAAACCGATAAATATTTAGCTGACC GCTGATGACCCCATTTTTTTTTCTGGCGGTGTGCCCCCCTCCCCATCCCC AAGTGAAAACAAAAAACTTTCTATCTACATCAAGTATAATGTTTCCAAAC TCTCTGGTGAATTCGTTGGTTTGAACATGATCTTGAGATTTAGCGGCCGT TAGATCTCCATATTTACGTAATGTCAAGGTGACCTTGTCTAAACCTCGTA AAATGTCAGGTTATATAAGCTGTACGCTAGACACGTTATATAACGTGTAC GTACAGGAAAGATACCCACGTTTGCGCACGTAAAAGACTATATTAACCAT TTTAACGTTATAGTTGATGTATGATATTTCTCAGAAGGACAGACAGAAGA TATCAGGATCCAGAATCGTCGCGTTTTGTGGCAAAAATATTTTATCTTTA TCTTTTTTTGATGTCTGTGGTCGTGCATTTGTTTGTTGTGGGGTATGTAT ATGAGTGTTTGTTTGCTTTTATTTGTATTTGGAAAATGGTAATATGTTTC ATATTATTTAAACTTCAATCTGTTGCTATTTTGATAATTCNCAAACCAAG GAGGTTATAGACACAGACATACAAAGTAACCAAGGAGTTCCTAATTAATG ATATAGCCTCCTTAATTGTACATGCTATTTGTGGTCTGATATATTTGATT GTATGATTTTATGTGATGTTCACTAAGAGTTGTACAAGTGTAATTATCTT GATTTTGTCACTTTGTACTGAGGAACAGGTTTTCACATTTATCATCAACA TTATGTCGGTGTAACATTTAGTCTTATTGTAATTCTAAACCTCCCAGGTT GTACATAACAATTTTCCTTTCAGGGACAAAAAGTGATAGAAAACGGTTAA AGAGGGAAAAGGATTTCTACAATTTTCCAGCTCGAAAGAGAGTCCAACAA TTTGCTGCTGTACTACTCCAATATGGTTATAAGAAATTGTTATTATTTTA GAGAATTTATAATGTCAAAGGAAAGCATGTGTTTAGATTTTTGCTTCTGA TATCTTCAAAGTATAGGAAAATTCTGGTGTTTTCTTTCTTCTTAGATTTG ATTTGATCCATATCATAAATTTCATTATAAGAGATTTTACATGTATTGTA AGGCATGATTTTTTGAAATTGAACAAAACATTGTTTTCAGCTGCAAGAGG CTTTATATCGCAGAAATATAGTCTGTTGAAGTCTGTGTTTGCATATCTTA TAACCCATTGTTTTTTTAGTATGTTTGTCATTATGCTCCATAAAAAAATG GAGGTATTGTTTTTGGGGTGTGTTGCTTGCATATTTGTGTTTCCGGTTAT TTGTGGTTAGCATAACTTAAGAATGGCTGGATGGATTGTAATGATATTTG GTATGTGGGTAGGTCTTGGGAAGATAAAGTTCAAGGTCAAGTTTGGGCCA GTGTTTGACCTTGTTTGTGATATCTTCTGCCACGAGGAAAGAGATTATGA TAGCCATCTTTAATTTCTTGTAAAGCATCTCTGGAGTAGTGCTGTGTACC TAAACCCGTGTTCAGGTTCAGGTCGGGATTTAGATCCAGAGGTTCAGGTT CAGCTCCAGACTTATACGTCCGGACCTGAACCCAAGGCATTACCATATGT GTGCTAAAATTTTTTTTCCAGTAATACATGTTAAATTGCATATTAGCATA TATTTTACATGCAATTTGAAAACTATATATGCAAAATTATATTCAGTCAG TAGTAAACACAAAAGTTCAGTTATAAACACAAAAACAGCAATGTTTTCAT ATTTTTCCAATGCAAATTTCAGGTCCAGGTTAAGTTCTTACAATTATATG TACATAGCCAACATGGGTAGTGGTTGTCAGAGAAGCTTAATTTGTTGACT AAATTATGTCCTTTTTTAAGCAACAAATGTTGACTGCACGTTGTACGACA TTCAACAAAGACACGGTTTTTGAAGTGCTGATTTTAACATGCACGACCCC TATGTGTCCATTTGGTACAGTCCTGAGCAGGCATGAAGGCTATATCTGCT ATCAGCACATGTGCTGTGTCGAGTACCCACTTCTGGTTCATAAGTGTGTC AAGAGATGCTTGTTGCTATTTATATATCACTCTATATGTGGAGGGTTTTG AAGTTTTAACATTTTGTATTGTATTTCGAACTCTTGTGAATGTATGAGAT GGAGTCTGAGTGAGAATATTGTCCATATTGGCAGAGGTGGTGGCAGGAAA TTTTAGATCTTGCTGACGAAATGTTTACCCCGTCGTGCGTCTCAGGATGG ACAATTGTTGCAGGGGGTAAAGACGTATAGAAATATCTCAAATTGACTAA ACCACGCCCAAACACTTGCCTGAAGATTGAATAGTGAATGAGGGAAGATA TTACACAGTGAAAAAAAGGATGGAAAGAAAAATTTGAGCTGGCTAGAGCT GGTTTTTCTACTTTTAAGAAAAAGTGTTACCTACTACATGTACAATACTA TGTCTTAATTCTCATCACATCTTTTGTGTGATAGGTTTTCGAAAAGAAAT TGAAGACCTTTGGATAGTCCAACTGTCTAGATAAATAGGTAAATTTTGTA AAATGCAATCATAGTCGTGTGGTTGCATTGTTCAAAATTTAGCTGTCTTG TGATACATACTTGTTGACGGTCAGTTCTCTCATATTCTTCCCGAAAACCC CATTACAAAGAATCGTAGGGAAACTGGACCATGCATTTTGTGGGCAACTT CCTCGGATGAATTGGACCTTCCTATCTATATAGTACATACATCTGATGAT GTACACATAGGAACATGATAATAGCATAACACGTAGAGGGAATTATGGTC AATAACAGATCGCTCTGGAAAATGTGCAGGCTTCTCATACCATTTCTGGC AGGGTTGTGCATGTGATAAGGGAAAAAAGGTACATTTCTGTAAGATATAT GGTAAATTTCTTGGTTGCCCAGTGCTACTTGTTAGCAGTCATGCTATCTC TGAAAACAGTTGGCTATCACCTAACATAGTACCATTTTATAAGGTTCTAA CATGTAACATTTTGGGACCACTTTATTTTGGCTCTGCTAATGCTTTGCCT GGCTTGTTCAAATTTACTCAATGTTCCTAATCATTACAATGCTACGTAAC TCTAATGGCAGACCCGTCTGCTAAATACATTTAGTATCTATGGCTAGGGG CTGGAAATACCAGCTACACATGCAGGTAACATTGCAGTTCTATATCTGTT ACTGAGGTCTACTTGCACCTAATCTGCACTGGTCCATGTACTGGGTATTT TTTCAGTTCACAGTTGAATTCCACGGCAGATTTAACATTTAAGATGGCTC CAGGAATATTTTTAAGATTCTCTTTGATGGTCTGAAAGGAGAAGAAAAGG ATTGATGCAGGTAAAATGTGTATGGTGAAGATGATTTTGAATGTTACCTG TACTTGTTCAGGTATTTCAAGCACTGTATATTTGAATTATATAGATGTTA TTTCCGTACACAAAGTAAAGCGTTCACCAACAAGCTTTCGATCACTCCTC TGATCCTTCTCAAGCTGAAATGACCTGAAGCCTACATCACATGACCTGAA CAGAAGTGTGACATCAGCAGCAGGTCAGAGGTGCCGAGCAGGCTGTATGG CCCCCCGTCTCGGTCCAGGGATGGTCGATGGGCTCTAATGTAGATGGCCT CTTTCACTCCTCTTAGAAGTACATGAAGTTCAGCCCTTTAGTCAGTTTTA CAGTTCAATCTATAGTTCTGAATAAATCGTGTCCTTTGTTGTCTACAGGT AGTGAAATGACGGACAAGGAAATCAACATGGATGTTCAGGGGCAGCACAA CACCATCCACTGGTTCCGCAAAGGCCTCCGTTTCCACGACAACCCGTCCC TCCTCCACGCCCTGCGTACGTCCCGCCACGTGTACCCCGTCTTCGTCCTG GACCTCGATTTCATGAAGGACTTCAAGATTCACTGCGGAGACAACCAGTG GAGATTCGTGGTCCAGTGCCTACAGGACTTGGATCACCGGCTGCGTATGT ACGGCCTGCGACTGTTCGTGGTTCGCGGGAATGCGGAGGTGTTCTTTAAA GAACACTTCCGGAAGTGGAACATCACACAGCTGATGCACGACATCGAAAC GGAACACTACCACCGCTTCCGTGACGCGGCGGTGAGAAAGATTGCGGAGG ACGCAGGAGTAGAAGTTGTCAACTATGTGGCACACACACTTTACAATGTC GACAAGTAAGTATGTTGTAGAAGTGTTGAACCAAACAATCTCAATATTAT CTGAAACAATCTTGAGATTTTTAATTTTCAGCAACACATGACGATTCTGC CGGGGGTCATTATGATCCATATAGTGACATGTGTATATGATATGTTAAGT CAATATGGTTGGACGGGAAGGTTTGAAAGAGTAGAAAGTTATTCTTGCCT TTGTTGTGGTGAAAATGTGATAGAAGAATAGATTTGTCTAATATATAGGA TGTTTTTAAATCATAGCCTATGAAACGCATTCCTTAAAAATTGTCTGACT CTGTTATGTCTGTTGTCCGTAGGATAATAGAATACAACGGTGGGACAGCA CCACTAACATACAGGAAGTTTCAAAAGGTGCTGAGAGACTTCGGCAAGCC TCCGCAGGCCAGCGAAACGGCCACGGAGGAACACTTCGCCAGCTGCTCCG TACCTCCCGAGGCCTTACGCGACGAGAAGTACAACATGGTCACGCTGGAA GAGTTGGGGATAAGGTGCGAAAATCCCACCAAGTTTGTCGGAGGGGAAAC GGAGGGACTAAGAAGAGTGGAAAAGCATCTGCAGAATCAGGTAGAGCCAG ACTCTGTTGAAATGTTTGTGGTGCTTTCATGTTTGCGATTTTTGCGGTCA CCTTTTCACCGCAAACTTAAATCAGTGCAAAAACGCTTCTTCCGTTTTCT GCCTGCCTACCCCTTTGGGTTAATTGCGAACTTGAAACCACCGCAAATAC TCCATTTTCTCCCTAATTGAATCCCTGCAAGCTTAGATGCAGTTACAGTA TTTTCAGAATTCAGGCTTCCTTCTTCGATATTAGAAAAACGGAGAAATTT TGCCATGCATAGCCATATTTTTTACTTTCTAATTCTATTCTCGTGAGGTT TTTGCCTTTCCAGCAAAAGCAATAGCGGATGCTGTCTGAAACATCTGTTT CCAAATTATATTCAGTTGCTTGTGTAACTGTTACCTTGCGCATCTTATTA GTTGGATGTCTAACCTTAATTGACATACGTTTGTGAATATTAGTCGTCCA GGAAATTAAAGAAAAGATAGACAATTTTAATTCAATCTATACCATTGGAT TACAATATGAAAATATCAGATGTTTCAAATCTATCCGACATTTAACTGAT GAAAGATCTAAAAGGTCTGATATTTTGATATATTGAATAGATATTTTGGT AAAAATTTTGATACATTGAATTGAAATTTTGTTTTTCATCGTCGTATTGT GTTGTGTGTTGCAGGGTTGGATTACCCAGTTTGAGAAGCCGAAGACAGAG CCCACCTCCCTCCTACCCAGCACCACCGGCCTCAGCCCCTACTTCAGCTT CGGCTGCCTCTCAGTACGACACTTCTACCATCGACTGGACACCATTTACG CTAAGGTACTGTAAATGCAGAAATGTTCACGGTGGTTTTATGTTTGCAGT TTTCACGGTAAGCTCTTCGCCGCGAACTTAAAACCACCGTGAAATGCTTT GCCCTCCTACCCCCTTGTCTACTATTGTCTCTAACGCGAACTTAAAACCG CCGCGAACACTACATTTTCTCCCTGCCACAAAATTCAAACCATGCAAACT TAAAACTCAGCCCGTACTTCAGCTTTGGCTGCCTCTCAGTATAACACTTC TTCCATCTAGTGGACACCATTTACGCTAAGGTAGCGTACATGTATACGAC TGCGTGTGGCTTTTATAGGTTTTCTTTGGTGCTTGCAGTTATGTTTTTTT TTATTTTTAATTTCTATTTTTTATTCCAACATAAAAAAAGCAAGCACTAA ACGCAAAAGGCAAAAATGTGTAAGGAAGTATGAAACACTAACAGTACGGG AACAATACAGTAACTGGGGTGCAAAAAAATGGTTATGCTGTATTTGTTCA CCTGCCGGCATAGTTTGACTGGGTGCACCAGTGCACCTATATATTTCTAT GGGGTTACCTTCATAAAGATAGAATTTTTAAGGAAACTGTAGAATTTCAG ATTCATGTTCTAAAGAGAGGCAGTGAAATTTGTAATTAGGTTTGCCTGAC ATTCTACCTTACATGTATTTTATGCTGTGCACCCAATATTCTGTCTGCCT ACATTTTTAGGTTAGGTGCTGCACCAGCGCACCTGTTCCCAAGTATGATT TTTAAGCCCTGCTGTACATAGTCATGATTCAGACAGTCTAGAGCTCGACA TATGGCTTTAGTTGGAACTGAAGCAAGGATTCTGCAAACTTGGGCATAAC AGATTTCTAAAAATATTCTATTGGAATTGTCTTGTATTTCTTAGCCTGAG TGTCATCCTGATTAGTTCTGTGAAGGCAGAGCCTGGAACTAAACAGGATG ACACTCAGGCTATGTATTCCTGACACATTGAAAGAAGGCCAGTGGCATTT GACACATGGGTCAGAGACCTTCCATGATTTATGTAAGGGATACCTCAGGG CCAGTTCTTATTTGATTTGACAGTTGAAAGTAGTTCAAGCTATTCTTAAT TGTGCCCAAAGGCTCCTTAATAAGAACTGCTTACTGAAGCGTGAAGGCCG ATGAAATGAAGCAATTAACGCCTCAACTCTCTTACTGACAGATGGCTGAT ACTTGCTTCAACTAGATAGAAAACCTATTAAAAGATAAAAGAAAGACAAA CTTACAAGGCACAAATGCAATTAGAAAGTAATGAGGAACATTTACAGCAT GTGCGTACTTCTATCAACTCAATATTCCCGAACTGCAATTAGATGATACT GTAAATGTTGAAAATTTCGCTGTGGTTTCATGCTTGCGACTTTCGTGGTG ATTTCTTCATCGCGAATTTAAGACCACGGCAAAATAGCGTCCTCTCCAAT GCTAGGACAAGTTTGGCTACCAACACTAAGGTTGTAAAAGTACTATCCAG AGACCAGATTTGGTACTGTAGTATACTAGTTTGGAGATGGGCTGAAGAGT GGTGGGTCGGAGTGTTGAACTGCAATACTGAGCCAATCCTCCTTTTGATT TGATCTAGATAAACGTGTCAGTAGATGGAAAAGTCGGTTGAAAGAACAAG TATGATGCCCAATTTGAGACAGTATATGAAGTACTTAAGTTAAGAAGAGT ATACTAAATGTAGTACTCTAAATACATGTAGTGACAGTTTATCATGCCAG TCAGCAATGCCAAAAGCAACTGTTCTGTCTGTCTATAGCACCCTTGCCGA GTTGCTAGTAGGTGTGAGGTGCCGGCTGGTCTTGGCATTTTGTGACTGTA GTACTACTATTGTTTCAGCAGCAAACATAAAACAACGGCGAACACTTCAA TTTCTTCCTACCTCAAAATTAAATCTCTGTGAACTTAAAGCCATGATTTA CAGTAAGGAGGAACATAGCCTTTCAAAATAAGTTTGAGAAGTTGTGATTA GATTTTTATCATATTTTGTACATGTGAGCAGGGAGACATTGGAAAAAAAG GGTAATTTTGATTTTTGGGCTCTCTATGGCACTAGTACTGCAGTTGTCAA GTTAACTCCTTCCTACACCTTGTATATGGGAGTGCCCATCTCCATTCAGG GCTCGAAATACTGGGTGCATGTGCACCCGAAATTGGATCTTTGCACCTAA TTTCTAGCATGTGGTGCGGGGGTTAGTTGTGCTCTAGTCTTATCATACTT TTAGCAGACCATTTAAAGCACTAAAAACTGCTGGTTCCCTCTCTGTCTCC CAATGGGCTCTATGGATTAACAATTTCCTGGTAGCCTTGCATGTCAATCA GTTTTCATGCTGTTCCAGTGTCTGGTAGGACTAAAAAAGTCCTCTGTGCG TCCAGCTGAAAAAGAGGGCGTTCAATTTCCTTGTTATTTTAGTTTTCCTT GTTATTTTAGTATCATCCGTCCAAAAGACGCATGGATGCATGCATAGCTA AAAACCTGCTTCCAGTTGCAGATTTCTGTATCTTTTGTTCTAAACTTGCT ATTGGTTGAAACTCTTCTCCAGGCAAAGGACCATTCGCTGCCGCCGGTGT CGCTCCAGGGCCAGCTGCTGTGGCGAGAGTTCTTCTATGTGGCGGCGGCA CAGACGCCGAACTTCGTGGTGATGGCGGGTAACCCGATCTGCCTCCAGAT CCCCTGGTACGAGAACAGGGAGCATCTCCGCAGGTGGCGAAACGGTGCGT TCTTCACGTCACTTTTGTGGATTCGTGTATTTTGAAAATACTGTGAAACC TGTGTTAGTGGACACCTGAATATTGCAGCCACCTGGCCACAGTGGTCAAT TTTTGTCGGTTCCTCGGATTTTTGCCATTAACATAAGCTGGTATAACACA GACATGCAGCGTGGTATCAGCTGTTTATATTACACTGACCAACCTGTTAC ATCTAACCTTTGCACATCTAGCTGCAAGTTGCCCTTGCTGTACTTGGTGG CAAGGAGTTCCACTATTCTGCTAGTTTTGGCGAGTAAACTCCATCAAAAG GACTAATTATATTATGTAATTTTTGTTTTTTTAACAGATGACGTTTTCTG ACTTTGTTGTCCTTGTTTGTTCCTCCTTAGGGGAGACAGGCTTCCCCTGG ATAGATGCTATCATGTCCCAACTACACAAAGAGGGGTGGATCCACCACTT GGCACGGCATGCTGTGGCCTGCTTCCTCACCAGAGGGGACCTGTGGATCT CCTGGGAGGAGGGGCAAAAGGTTTGCTAATCACTGTACACCCTCCCTCTC GTAGCCATCTACACTCTTCCTGACCTTGTAACCTATACACATTATTTTTC AAAAGGCTAGCTTAGTAGGGATTAAGTGACTAGTGGACCGTTTTTTTTCA CAAATATTTGGGAATATTACATGTACAAACAAAGTCTTGGAAGTCAATGT AAGCAAGGTATCATGATGTATGCTCTTTCAAATTCCATGTTTAACTTTAC CATTATGGTAAGAACTTTGAAGAAAGGGCTTCCAAGCTCAATACAATGTT TGAATGAAGTCATCTAGTTTTTCTGTAGAAATATCACTTTAAGGCCTGTC AAAAGTATGCCAATTTTGTGCATTTAAAAAAAAATCCCGGAAATCATGTT TCAGAGGGTAGAAAAATCATGTAACATTTAACTTGTACAGCATTTAAGAA TGTTTCTCTTAAAGCTTGTACCTTACTTCTTACCAATACTGTAAATGCAT TTAAGTTCGCAGTAGGGAGAAAATGGACTGTTCACCGTGGTTTTAAGTTC ATGTTTGAAACAATAGTAGCGCTACAGTCACATAATGGAAATACTGGTGG TTTTGAGGACAGCCAGTCAGAAACCAAGATAGTTGCATATTTACCCTAAC ATACTGTACAATGTACATTACGTAGTGCGTAATCAAGGGGGTTGGTGGGC TAAAATTTTCATGGTGGTTTTAAGTTCACTCTGAAAGGTTCACAGCAAAA ACCGCGAACATAAAACCACCACCAACATTTCTGCATTTTCAGTTACCCTC ATTGAAATATCTTTAGATACAAGTTTGTCTTAAACACATTATGGAAACTG ACCAAGCTCCTGTGTCTCCTAACTCTCAGGTGTTTGAGGAACTATTCCTG GATGTGGACTACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAATAG ACAAATAAACAAACAATTATTTCCTACGAAAGCTGATTGATCTAATGTCT AACCCTAGGTGTTTGAGGAGCTCCTTCTGGATGCGGACTACAGTGTGAAC GCAGGGAACTGGATGTGGCTGTCAGGCAGCGCGTTCTACCACCAGTACAC GCGGATCTTCTGTCCAGTGAGGTTTGGCAAACGGACAGACCCTGACGGTA CCTTCATCAGGTACGTTGGATGGAGTAACAGTTGAAATCATAATGCGGTA TAATGAACCACTGCTGTAAGGCCCCGTTCATGATGCAAAAAGTAAAGTGG TTCGAACCTTTTCTGCAAAATAAATCATTTGTGAACATGAACCCTCCGTA ACCGTTTCGTTCCGTTTTATTCTGAACCTCCTCCCGAGGTAGTCTGCAAC GGTTCAAAATTAAAACGGTTTCGGGGAATTGTCACTATGAATGCAAAAGC GACGCCAAACTGTCTTGCCTCAGTGTTTATGACGTCATACACCGGGTATA AGTTGGCAAGTACAGTCTCCTGGCTCCAGGGGATCAAACTCGGGCCCACC AGTGCACAGGCCACACACCATAACTGCTAGGCTAAAAGGTCCAGACCAGT TAGACTGGTCATTTAGTGGCGCTTGTACCCCACTGTTACAACTGCATACA TGTCATTGATAAGTTACTGATAGATTTTGCAATCTCAGATTGCGACATAC CTTAGACCCTACAATGTAGTCTGTCTTTCCAGTGCCTTTTGGGTCGTCCT TTTCTTCAAGTGTATCCGATTTTGTGCTTCCTTTTGTGCTTGATGCCAGG ACTTTGTTGCAGAAAGGCTGGTACATGTAGGTCTTTCTCTTCGCCTGACT GACATGTCAGTCTTGGTCTTATCCTGTCCCGACATGGTTTCCAGTCAAAT ATGTCTCTGGCTGTTCTGTTTTCTCTCATTCACTAGATGTATCCTACCCA GACCTGTCTTATTTCTCTTATCAATTGGGGCATAACTGCATACTCTTATC ATTTNCACGCGGATCTTCTGTCCAGTGAGGTTTGGCAAACGGACAGACCC TGACGGTACCTTCATCAGGTACGTTGGATGGAGTAACAGTTGAAATCATA ATGCGGTATAATGAACCACTGCTGTAAGGCCCCGTTCATGATGCAAAAAG TAAAGTGGTTCGAACCTTTTCTGCAAAATAAATCATTTGTGAACATGAAC CCTCCGTAACCGTTTCGTTCCGTTTTATTCTGAACCTCCTCCCGAGGTAG TCTGCAACGGTTCAAAATTAAAACGGTTTCGGGGAATTGTCACTATGAAT GCAAAAGCGACGCCAAACTGTCTTGCCTCAGTGTTTATGACGTCATACAC CGGGTATAAGTTGGCAAGTACAGTCTCCTGGCTCCAGGGGATCAAACTCG GGCCCACCAGTGCACAGGCCACACACCATAACTGCTAGGCTAAAAGGTCC AGACCAGTTAGACTGGTCATTTAGTGGCGCTTGTACCCCACTGTTACAAC TGCATACATGTCATTGATAAGTTACTGATAGATTTTGCAATCTCAGATTG CGACATACCTTAGACCCTACAATGTAGTCTGTCTTTCCAGTGCCTTTTGG GTCGTCCTTTTCTTCAAGTGTATCCGATTTTGTGCTTCCTTTTGTGCTTG ATGCCAGGACTTTGTTGCAGAAAGGCTGGTACATGTAGGTCTTTCTCTTC GCCTGACTGACATGTCAGTCTTGGTCTTATCCTGTCCCGACATGGTTTCC AGTCAAATATGTCTCTGGCTGTTCTGTTTTCTCTCATTCACTAGATGTAT CCTACCCAGACCTGTCTTATTTCTCTTATCAATTGGGGCATAACTGCATA CTCTTATCATTTTTGTTTGATTTAGTGTGCTCAATGTGTGGTTATTCTCA AGTATGGGACAGATTGTTTAAAATATCATTAGCAACCTTATTGGAAAATT CCAAAATGTCGTTTGATACCTAATTTATTACCTGAAACATTTATTTGTAG AGATTTTATGTTATATCCATTCCCAAAATAAAGCTGTTACCAACAAGCTT TCAATCAGCTGCAGCCCTCTGATCCTTCTCAACTTGAAATAAGCTGACGT CACATATCCGTTAAGACACGTGGCAACAAAGTCATTGTGAGTTTACGTTC GGAAGTGATTGGTCATTATTGATCCTGAAGAAAGTGACAGTGGTCGTTGA AAATTCGATCCGTGAATGCCTTGGTGTTGGTAGAAAGTTTAGCACTGTAC TATGATTACTAACACAGATGAGTTTCCATGATGTTTATTATCATCACAGC TGAACTTTCATTACAATTGTTTTTCAGAGCGTACCTGCCAGTTCTGAAGG ACTTCCCAGCTCAGTACATCTACGAACCTTGGAAGGCGCCACTCAAGGTC CAGGAGGCGGCAGGGTGCATTGTGGGAAGGGACTACTCCTTCCCGATGGT GGACCACGAGATCGTGAGTCAGCAGAACTTGGAGCTGATGCGGGAGATAC GGGAACAGCAGCGACAGATCACGCTACTAACGCTAGGTAAGAACGACAGC GACAGATCACGCTACTAATGCTAGGTAAGAACGACAGCGACAGATCACGC TACTAACGCTAGGTAAGAACGACAGCGACAGATCACGCTACTAACGCTAG GTAAGAACGACAGCGTCAGATCACGCTACTAACACTCGGTAAGATACACT GCGGATGAAAAAATAAAGTATGTTACTAGTCTTCATTTTTCTCTGTCTAA TTTGTTTGATTTTTTTAAATCCTTATGTTACAAGTACAGTCAACAATTGT GAGAAATTATCTAAGGGACCTCCCAAAAGTGGTCACATTTGCCAGGTGGT CCTTATGTAGAGGTGGTCATTTGTACCGATTTGACTGAATTGTTCTTATA TGTAAATGTATTTTTATACACTGCAATCCTTTCTGCTCCATTCCTTTGGG ACAACAATGGTACGATCTTTGGTTTGGAACAACTGAAAATGACCAGGTGC TACAGATTGAGCTACAGGGACATTTCTTATCTAGTTGCTTGTTTAATTTT GTATTGCAAAATGTTCTACCAGGATGTCTAGCATTCATTGATGTACTCCA TGGTTTTCTGTATCAGAGTTAAACTGCAATTTCCAACACAAGAATTTGGA CTTATACCCAAATTTTTGACTGATCAACTCCAGTCCTTATCAAGGAATGA GCAATCCACTGTCTCTGTGACGTCACATTATGCAGATGTGACACGTGACT CGGTGAGCAGTAGACTATATGTTGAAGAAAGTGTATGGCCTCCACCAAGC CTTTCTACGGGCGTATGGATCATAGAATTCGGCAGAAAAAGGAAGAATTA GCCAGTAGAGTCAGTCCACGGCGAAGATCACATAACTGTGTGCCTGCGAA TGAAACCCTTCGGTGGCCAAACTCCCCTGGCAAATGTTCTTCCCACAGCC GGCGTGGTTAGTCTGGTAGAGACTGTCTCTGTAAAGCCTGGATATTTGTT GTTTTTCAGAGGGAAGAGAGGATGGAAGCAGCACCAGTACTGATGGAGCG GGCAGGAAGAGGAAACGACCAATCCACCCAGAGGGCGAAGACGAGATCGT GAAAGTTGTAGTCACCACGGCGTTGTGAGACTCCGGCAAAATGTTCTGTT CTTACCTCTCACGTTATCTGTAATTGTTTCTGTGATTCCAATAATCAAGG AATGAAATTCAGTTCTGACTTCTCAATGTCTTGTCTGAAATCTGATTTTT ATACAGGAAAACTGGTGATAAGAATGGAAGGGTACATGAACGGCATTCTG TTCTTACGTCAAGTGTGATAGTTTGTGTCAGCTTTTAGCTAGCAGGGCGT CATGGTGTCTTCTGATGACAGATTTAATCACAAAAATTAACAATATGGGC TCCCAAACATTGAGTTGAATGCAAAAAAAATTAAAGCTGGAGATTGCTCT GGGCAAAACGTTCTGTTTTTACGTCAAGTGCGGTGGATTTTGTGATTGTA CTCATTGCAATGATCAAGGAATGTAATTCAGTTCTCTCTTCTCAGTGTCT TGTCCAAAATCAGATCTTTATACTAGATTATAGTTGAAAACTGGTGATAG GAATGGAACGTTCTGTTCTTACTTCTTACACTAAGTGTGATCAGTGTTTC TGTGATTGTACTCATGACAATAATCAAGGAATGAAAGTCAGCTCTCTCTT GTCTTCTCTGAAATCTGATTTATATAGTTGAAAACTGGTGATAGGAATAG AAAGTTTAGTCGGTAAAACGTTCTGTTTGTTCATCAAGTGTGCTGGTTTT TCTGATTTTTACTTTTACAATAGTCAAGGAATGAAATTCAGTCCTCACTT CTCTGTTTCTTGTCTGAAATCTGATTGTGTTTTTGTTGAGAGGATCAAAT TTAGAATTGAAGACGAAAGTGGTCTCATTTATGATCTTCTCATTGACTTT TTATAAAGGAAAACAGGTGATAAGAATGGAAAGTTTGGTGATACATTGCA GAATATATCAGGATACATGTACTTATTTTTAGTGTACGACTTGTTTCAAA TACAGGATGTAACATTTGAGCTAATCGGTCCTATTTATCAAGCCCACTGT CGCCATTACAAACAAAAACTGCTCACTCACAAGTATTGTATTGTCGTGCA AGGTGTGGATTTTCAGGGATCGTAGTGGGATTGTCTAAGGTAGATTAATT CTTACATATTTTTGAATGCTAAATGTATTGAAACTCTTTCCTTCTTGAAC CCAGGACTGTCTCCAGGACCCGTCCCTCTGTCCTGGGACAGAAATTTGCT TGTTGGGATGGAAAAAAAATTAATCTTGTCTATCTAAAAAATCTGATATT GCTGGTAAAAATGTATTTTTCACAGCAATGACAGATCTAACCATATTTAA AGCTGGAGACAGCCCTGTTTTAACCTGATCTCATTGTTTGTAGACAATCA TGAACAGTTTAAAGATCAGAACAGTTTAAAGATCAGTCATCATATTGTGT AATGTAATGAAGTGATGACGATGTGAATGTCATGATCACTTGTTTGTACA ATATTTGTAGATGCCAGCTTTACAGACCAAAAACATCGAAGAGTGACGAC CAGAGGAGAAACCTTCAAACCTCTATCAAAGAAACGCACAATTGTTGTCA GTCAGGGTCGGTCAACATTGTACATATTTGTCTGTTTTTGATGGAGCAGA TTTTTAAAAAGACTTACAAACTTGGACAAATCAAACTGATAATCAGAAAC CTAAGATTCCAGTCCAAGTTGTAAGGTAAATGTGTTGTGTAAGTATTGAA AGAATATGTATAATTATGATTATTTGGTTGACAGTTAACTTGTTTTCTCT ATACATATTTCATGTGTAACAGTTGAAAAGAAATATCTGTCATGAAATTC AGTGGGTGAGGGCCATACATCAAAATACCTTGTGTTTGATCAATTGAGCA TGAAGCACTTTTAGTGTGAGTTTTACAGTTTTACAACTTGAACATTAATG TAAGTCTGTAGGATATTTGACTGTATTTGCCAACAGTACAAAATATTGCA AAGCCAACTAATTGAACAACTTCTCTAGACACAAGTGTACTTGAACCAAA AGCAATGGTCAACAATACTGTAGTTCAGTTCTACCTCAGAGCTCGTACAA ATACAACAAGTAGTCAACAGTTATAAGGAACGCAAACAAGTTCAATGTAT ATATATATTTATATATATATGCTAGCAACTGGAATGTTGTATTTATACTT TGTAATTTTGTGGGGAACATTGATGGCAATACTGTTAGATAAAGACGCAA AGCTGTTGAACAAAACTTAAGTCATAACAGAACATTTTAACTTAACTCTT CTTGATCAAAGCACTACTTTCATCAGAACTCCAACCATGCATGTGTTTGT GTCACTGTTTTTTCACCGCATATTGAATTAACATTGTTTTAAGGATACAG TGAATTATGTACTGATAATTGGTTGAGGAATACTAGTGTTAATGTGTTGG TTAGTATTTCAATGTTATGAAAGTGCTCTCAAATTATGCGGAAGTCATTG GTAGAAGTTATAATGAAGACTGAATCATTTTTAATGAGGAATGGAATGTT AGCCTGCTTCCAACCCTATTATAGCTTCTGACTTTCTTTCATCCTCGCAA AGCGAAGACAAAAGAGACTCGGCATCTATAATAGGTTTGGATACCAGGGT ATGAAGTGTAATTTTCACTCTTGTAAATGTTGTGTCACAAAAATGACCTG GTAAAAGACTTGCAAGGCCTTTGAATAGTTCCTCCGAATGGCTGAATTTT ATAACAGATGATCAGGAATGACATGGTCGAAGAAGAGTTGATGTTCTCCA AACAATGGAGACTTGTAACTATGTGGCAAAAAATAAAGTTTCCCACCAAT GACTTGTTTGTTTTTTGTGTGTGTTATATTGAGTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000231:24354..40789-

>BlTCONS00113908 ID=BlTCONS00113908|Name=BlTCONS00113908|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1650bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000231:24354..40789- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGACGGACAAGGAAATCAACATGGATGTTCAGGGGCAGCACAACACCAT
CCACTGGTTCCGCAAAGGCCTCCGTTTCCACGACAACCCGTCCCTCCTCC
ACGCCCTGCGTACGTCCCGCCACGTGTACCCCGTCTTCGTCCTGGACCTC
GATTTCATGAAGGACTTCAAGATTCACTGCGGAGACAACCAGTGGAGATT
CGTGGTCCAGTGCCTACAGGACTTGGATCACCGGCTGCGTATGTACGGCC
TGCGACTGTTCGTGGTTCGCGGGAATGCGGAGGTGTTCTTTAAAGAACAC
TTCCGGAAGTGGAACATCACACAGCTGATGCACGACATCGAAACGGAACA
CTACCACCGCTTCCGTGACGCGGCGGTGAGAAAGATTGCGGAGGACGCAG
GAGTAGAAGTTGTCAACTATGTGGCACACACACTTTACAATGTCGACAAG
ATAATAGAATACAACGGTGGGACAGCACCACTAACATACAGGAAGTTTCA
AAAGGTGCTGAGAGACTTCGGCAAGCCTCCGCAGGCCAGCGAAACGGCCA
CGGAGGAACACTTCGCCAGCTGCTCCGTACCTCCCGAGGCCTTACGCGAC
GAGAAGTACAACATGGTCACGCTGGAAGAGTTGGGGATAAGGTGCGAAAA
TCCCACCAAGTTTGTCGGAGGGGAAACGGAGGGACTAAGAAGAGTGGAAA
AGCATCTGCAGAATCAGGGTTGGATTACCCAGTTTGAGAAGCCGAAGACA
GAGCCCACCTCCCTCCTACCCAGCACCACCGGCCTCAGCCCCTACTTCAG
CTTCGGCTGCCTCTCAGTACGACACTTCTACCATCGACTGGACACCATTT
ACGCTAAGGCAAAGGACCATTCGCTGCCGCCGGTGTCGCTCCAGGGCCAG
CTGCTGTGGCGAGAGTTCTTCTATGTGGCGGCGGCACAGACGCCGAACTT
CGTGGTGATGGCGGGTAACCCGATCTGCCTCCAGATCCCCTGGTACGAGA
ACAGGGAGCATCTCCGCAGGTGGCGAAACGGGGAGACAGGCTTCCCCTGG
ATAGATGCTATCATGTCCCAACTACACAAAGAGGGGTGGATCCACCACTT
GGCACGGCATGCTGTGGCCTGCTTCCTCACCAGAGGGGACCTGTGGATCT
CCTGGGAGGAGGGGCAAAAGGTGTTTGAGGAGCTCCTTCTGGATGCGGAC
TACAGTGTGAACGCAGGGAACTGGATGTGGCTGTCAGGCAGCGCGTTCTA
CCACCAGTACACGCGGATCTTCTGTCCAGTGAGGTTTGGCAAACGGACAG
ACCCTGACGGTACCTTCATCAGAGCGTACCTGCCAGTTCTGAAGGACTTC
CCAGCTCAGTACATCTACGAACCTTGGAAGGCGCCACTCAAGGTCCAGGA
GGCGGCAGGGTGCATTGTGGGAAGGGACTACTCCTTCCCGATGGTGGACC
ACGAGATCGTGAGTCAGCAGAACTTGGAGCTGATGCGGGAGATACGGGAA
CAGCAGCGACAGATCACGCTACTAACGCTAGAGGGAAGAGAGGATGGAAG
CAGCACCAGTACTGATGGAGCGGGCAGGAAGAGGAAACGACCAATCCACC
CAGAGGGCGAAGACGAGATCGTGAAAGTTGTAGTCACCACGGCGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BlTCONS00113908BlTCONS00113908-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:40673..40789BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:40673..40789Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:36385..36841BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:36385..36841Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:35800..36067BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:35800..36067Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:34985..35125BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:34985..35125Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:32246..32417BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:32246..32417Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:31720..31859BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:31720..31859Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:30580..30731BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:30580..30731Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:28254..28462BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:28254..28462Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:24354..27280BlTCONS00113908-exon-Sc0000231-1564993656:24354..27280Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000231genomeSc0000231:24354..40789 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlCUFF055833