BlTCONS00113468 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlTCONS00113468
Unique NameBlTCONS00113468
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



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Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000229:129162..148691+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>BlTCONS00113468 ID=BlTCONS00113468|Name=BlTCONS00113468|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19530bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000229:129162..148691+ (Branchiostoma lanceolatum)
CGGCACTGCAACAATGGCGGCCAAGAGTGGAACTTTTGACTTCGCCAAAG
CTCTCGCTGGGATTTCAACTAAAGACGACCATGTAGAGACAACTACAGGG
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CTTTAACTTGGGGGCTGATGACTTGATGGACTGTAATAGCTATGGAACTA
TGAGTTGCAAGGCAGAGGACTACTTTGAGAAGTTGGACAAAAAGAAGAAG
ACATCAGGTTGGAGCTCATTCATTGTGTCATGTAATTTGTTTGTTTGTTT
GTTTGTTTGAACCCTTGTTTATTTATGAGAAGCTTAAATCGGCATGTAGG
CCGCTTTTTGTTGAAGTCATGAGGGAAGAGGTAAGGGTCAGATGAAATAT
AAATTACGTTATTGTTTTGACTTACAAACAGTTGGACATGCTGCAACTCA
AGCTTACTCGTAAGCATATCAAAGATGTGTTACAGATACATGTATAAGGA
CTAGTGTCAGATATTGAATTGCAACTCTAGCTTCTCTAAGCCCTTGAGAG
TATTAACAGCTCCTTGATTGTTCTGTGGCTTGAGAAATACTCAAAGTCAA
AGTATGCTTTGGGTGGCATTACTAAAGATATCATGGATAATTTGAAATTC
TACCATTTACAGCCTTAGCCAAAACGTCAACTAAAGGAAACCACTGTAAA
ACAAAGACATCAGGAAAAGACAAGGCAAAGTGGAAGGTGTCACATCTACC
ATCACACTGGAACATTTACTTGTCAAGGATTGAAGAGCAACAAGCTCCCA
AGAAGCTGACATCTGAAGAAAAGGAAAAACTGAAAAAGGACTTCAAGGGC
TTGCCTTCAAGTGCCATCGTTGAGCTTGAGAAAGCTGTTGTGAAAGGCAG
ACAGAAGTACATGGAGATGTGCACACAGGACTACTCCAAACTGTTCAGAC
CTTGTGAGGACCATCCAGTTATCACTGTGAAGATGATGGTGCAGTATCTG
GTAGAGAATTTTGTGGAAAGGTTGGAAAGTGAAGATTGGGAGGGCGTGGT
CACAGGGATTGCAGACGACCCATATGAGGACACATGGTTTCGGACCATCA
AGCACACTGTGAAAGCCCTTGCTGTGCACTTCAATGTCTGCAGCAAGAAT
CAGGTTGGTGAAAATGTCTAAATGTGAAAACATAGAGACAATTGAGTGAT
GTCATGGCCGCCATGGTTAAAGTTGGAAGAGTCAGACCTACAAATTTGCC
AGGTTCTAATGTGTGATTAATGTCATACCGGTATTTGAGTATGTGACTGC
AGTTGAATTTGCAAATGTACCTCGCACAACTTCAACATATACTCATGTCA
TTACCTCAAAAATGCAAACACAGTGTATATACACTCGCTGAAAGTGTTGC
CTTTTGTTAAATCCTGATAGTGTTTGATATGCATTTTAACCAGATGTTGG
TTTTCCACCCATGCGAACTAAGTACATAAGTATTAAGTTATGCTGACCGT
AAAGCAATATTTTATACAATTTTCTGTATCATATTACATAAAATGCTTGC
TTGTATTCCATGCAAATGAAAACTTTTGTAATATGTTCTCTTCTTTTTGA
TTCCGTAGGTAAAGAACATTGTTATTGGGCTGAATCTCCCATTCCTAATA
GCCAACAAGTTCACAACAGAACTTCTTCATGTCATGCTGTACTGGATAGT
GGACCCAGTGTTTGGGCCTATGCTAGCGGAGATCATTGGGGAAGTGGCTT
TGGAAGATGGATGCCGAATTTACAACTTCCTTGTGATGCCAATTGCAGAA
TACATTTGTCCACAACAAAAACCACTCCTGAAGTACAAGAAAGTCAGGGA
CATCCTAGTGTTCTACCTGTGTGCAGAACTGGCAAAATCCACTGGCAAAA
ACAACAGCAACATAGAGGTTATGAAATGTCTGGTGAAACTAGATGGTCAT
GAGAGCTGGGCTATTGTAGAGGATATCTTTGTCAACGGGAGGTACTGTTC
ACACTATGGCCACTACACCTACATTGACTATCTTGAAGGTCTGAATTTAG
GTGTCTCAAAAGACCCGGATTCACTTCACAAGGCCCGATTTNTATCTTCG
TCAACCGGAGGTACTGTTCACACTATGGCCACTACACCTACATTGACTAT
CTTGAAGGTCTGAACTTAGGTGTCTCGAAAGACCCGGATTCACTTCACAA
GGCTCGATTTGGTAAGTAGTCATAATTTCCTGTGCCTTGAGTCATTGGTG
TGAAACCAAGATCAAGATTTAATGCTACATAAATTCTGCATCATGTTCTT
TTGTCATTTTTTGAGAAAGCTTCAAGAAAATAACATGATACTACTGTGTG
AAATAGTTTTCGTCTGCCTAGCTTTAGGCTACACATAGCCCTTTTTTCTT
TTAAAAATACTTTCTACACATTTTGAAGCATGATACCTCTGCTGTATGTC
AGATTTGCTTGTATCTATCTGATCATGATGTTTTCACTCTTGTAGAGCGC
CAACCAGACAATCCCATTGTGGAGAAGCATTGGAAGTCATATGAGGTGCG
TCGCCTCAAATTAGAGATGCAACATGAGGAGAACTTAAAGGATCCCAACT
ATCACAAAATGCACCATTGCAAGACGGAAGATGCTGAGAAGATGTTCATA
CGAGTTTGTAAGTGTCATATAAAAGATTNGGCTGAATCTCCCATTCCTAA
TAGCCAACAAGTTCACAACAGAACTTCTTCATGTCATGCTGTACTGGATA
GTGGACCCAGTGTTTGGGCCTATGCTAGCGGAGATCATTGGGGAAGTGGC
TTTGGAAGATGGATGCCGAATTTACAACTTCCTTGTGATGCCAATTGCAG
AATACATTTGTCCACAACAAAAACCACTCCTGAAGTACAAGAAAGTCAGG
GACATCCTAGTGTTCTACCTGTGTGCAGAACTGGCAAAATCCACTGGCAA
AAACAACAGCAACATAGAGGTTATGAAATGTCTGGTGAAACTAGATGGTC
ATGAGAGCTGGGCTATTGTAGAGGATATCTTTGTCAACGGGAGGTACTGT
TCACACTATGGCCACTACACCTACATTGACTATCTTGAAGGTCTGAATTT
AGGTGTCTCAAAAGACCCGGATTCACTTCACAAGGCCCGATTTGGTAAGT
AGTCATAATTTCCTGTGCCTTGAGTCATTGGTGTGAAACCAAGATCTGAC
AAAGATTTAATGCTACATAAATTCTGCATCATGATCTTTTGTCATTTTTT
GAGAAAGCTTCAAGAAAATAACATGATACTACTGTGTGAAATAGTTTTCG
TCTGCCTAGCTTTAGGCTACACATAGCCCTTTTTTCTTTTAAAAATACTT
TCTACACATTTTGAAGCATGATACCTCTGCTGTATGTCAGATTTGCTTGT
ATCTATCTGATCATGATGTTTTCACTCTTGTAGAGCGCCAACCAGACAAT
CCCATTGTGGAGAAGCATTGGAAGTCATATGAGGTGCGTCGCCTCAAACT
AGAGATGCAACATGAGGAGAACTTAAAGGATCCCAACTACCACAAAATGC
ACCATTGCAAGACGGAAGATGCTGAGAAGATGTTCATACGAGTTTGTAAG
TGTCATATAAAAGATTTTTAGAACCTGATACATGTATTTTCTTAGGATTA
CTTGTGAAGTTCTTAAGTAAATTACTCAATCAAACGTTTCTCAAATAGCA
TACACCTCACAATGTCCTGTGCTATTGACAGAAGTGTTCTGCATCTTATT
TTAAAGGTATTTATAGTATAGTTTAGCATGATATTGCAGTTTGTCACCTT
ACTGCAAGGAGGCAGGGGAGCTGCACTGCCTATGGTTTAGCTACAGTTTA
CACTGACTGAATGAATATAAGAAGTCTTTACCTTTCCTCTGCAAGATGTT
AGGGATGTACACTTCAGAATTTCATAGTTGCCATCGCTAAAAGACAGCAA
AGGTACTGGTAGCATTGATGCAGAATAATGGACGTGATCGACTAATTTGT
ATCTTTCTCCAGACAAGTTTTTGCAGAAGAAGCAAGAAGGATGTAAATGT
AAGAAGATGGGTGAACACAGTGGGATGTCTAGCTCTGTGATTGAAGCAGT
TAAAAAGTTGCAAGAAGAAGGCACGAGTAATGACAAAGTTTCAGGCACAG
AGTCAAAGGTAGGTTTACCAGGAATATTAGAACACTTGAAACTACTATCT
ACTTTTCCACCGATAGACTTGAATCTGGCTAGGAGCTACAGTAAGAATAT
CATATATGTTCTTTTCCAAATTAGATATGTGTCTTAAAATCAGGATTTTC
TGCTGAAAAGGCAGGTGCAATCCCTGGAATTCAAAAGGTCAACTGAAGGA
TATGTTATTTCTTCCCTACACTTGTCATTATGTTNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCGATATTGACCTTGAAAGTGATTTTATTGAGGTTTTCCTGACCAAAAAC
GTACATTTTGGCCTCCTGTGCTCTGGAAATACATCCAAATGACCTGAAAT
TTGCCATGGGGGTACATTGAACAAATAGTCAAAGAACCCCATTCGCACTT
TTGGCATACATCACTTCGTGGCATCCCGTGGCGTAGTGGTTAGAACATTG
GACTGTCAAACAAGGAGACTCAGGTTCAATCCCGGCTTTCCCCCAGACAT
GTCTGGACATGCGTCCCAATGTTGTGCCCTTGGGAAAGGCACTTTACACG
ACTTTCCTCACTCCACCCAGGTGTAGAAATGGGTACCTGACTTCGGTTGG
GGAGGTAAAAGGCGGTGGAAGGAGAGGGATGGGCTCCGCCTTCCAATACC
GTGCCCTAGACACGGTGGGTAAAAACCCACTGCTCCAACGGCCCCAAAAG
GCTATGGTACCTTTACCTTTTTTTACCTACTTCAAAATACGATTTTGCAG
GGTATTTTGGGGAGAACATTGGGTATTTTCCTCATATGACCTAAAGGTCA
GTGACCCCAACCGCACCTGGCCTGCCTGTGGCCCTTGCAACCACCTGATT
GGCCAATTGAGTTAATTAAGTTATCTTGCATTTCTGGCATGGCTTTGTTC
ACTCTTTTTTTAACAAAGATACACATCTCCAGTTCCTATGTATTATGGAG
AGACTAATTGTTTTTAAACTCAATTTTGGACGGGGGTGATCCATTTTTTT
TAGTGGAAGTAATTTAGTATGGTCCATTGTTATTTGGGGATAGTCCATTT
TTGGCATGGCGAGGAGTATGGCTAAACATGCTGTATTTGCTCGCAAATGT
TGCCTTTCTAGTTGATATGTTGATATTGTATCTAAATCACAAACGTCTTA
ATTAAATTCAGGGTGTGAAGGAGAAGAAGAGTGGCTTAACCAAAGAAGCA
GAGAAGTTACCTGAAAAGCCAGTGGCAAATGGCAGCAGCATATGTCCTGA
AAAAATACAAGTGAAGAAACGCAAGATTAGAGAGTGTGGCTTCTGTGGTA
AGCTGTCCACCCCCGAGCAGAAATTCTCCAAGTGTGGGTCCTGTCTCCAT
GTTTACTACTGCTCACGGGACTGCCAGAAACAGCACTGGAAGTCAGGCCA
TAAAAACCAGTGCCGCAAGAAATAGGTCATCTGAGAGACACAGAATGGCT
TCAAGTGCAGCTTCAATACTTTCAACTTTCCAGAACTGATGAGAGTTACA
TAACTGTTTATATTCATATTACTAATGATTGAGTTTGAACAATTTTCTAT
CTTGTTTGTATTTCATGTTAACATTTCTTTTCATCTATAAAAAACTTCTG
AATCAGATACCAATGACTTGTATCATTCAGTAGTGCTTATGGGTAGCATT
CTGAGATTTTTCATATGATAAACAGTGAATTGTATGAGTCTTGCCTTGTG
TAGACTTATTAGTTGCAATGTTGCAGAACTATTTTACTATCCTGGGGCAT
GTATACTTTGTCTCCACATTTCTTTTCACACAGTCAAATTTACTAATCAA
ACTTTCAACTAGCAGCCTTATTTGATATCACATGTGACTAAAAGCATGCT
AGGGGCAGAATTACTGATAGGTTTTAGCCTGCAGGATGTTTTGTCCATTA
GAGGGACAGTATCTGTGTCCAGATAAACAGTGACTAAGTCTTGCTGGTAA
GGCTCAAAGTTTTTGTCGAGAGACATACATGTATAAATGGTTTTCCCTCT
CAATACATCATCAGAAAGCTAGTTGAACTTATTCTGATAAGTTTGAGAAA
CTCCACGTGACATAAATGTATCTTGTTGGTGTCACTACACACTTGGATAT
GATCAGATATGTCAAGCAAAACCATTTGTGATTTATTATAGGGAATTGTA
CATCCATTACAGTTGTTAGCAATGGGCAACGGGGTGTCATTAGATCAGAC
ATTACATGTTGTATTAGATTGTAATGCAATGTTTGCAACTTTTGTTTAAG
TTCCGGAAAGAAAAACTATCTGCTCTTGTATATATTTTCAATAGAAGTCT
TGATCACAGTGCAGTCATAGTAGGGCAGTCGTTAATCCTTGTTGGACTAC
AAAGTGAGAAGGGTTACATGTGTACCTGCTTAGCTTGAAATCACATCATG
CAGATACATTACCAAGTTTTGTATTATTGAAAACCAGCACCTACTGGGTA
TATGGAAGCTAAGAAATCAGTTATATTTGCTTTTTGCAACACTTTGATGA
TGCAGGATGAAGAAGGCATACTTGTGTTTTAAATTATGTTTCTGTTCAGT
TTTGTTTTGTTTTGCTTGCACATGTAAGGGGGAAGTGGTCTAGTCACTGT
GACAGCAGAATGTGTCGGTGATGTTTCACTGCCTATTTTATCTGATTAAA
ATGTAGGTATTAGTTTCTCATTGAATTTATAGTGCCTTCCTGACTGTAGG
CCACTTTCCTTTTGTCAGTAGCCTTGGTAGAGCTGTAACAATCTTGTTCG
CTACAGTGCGTATCTATTTAGGGAGATGAAGCATTTAGGAGAGGCTGCCC
CTATACATTGAAGTAGTAGGGAATTATCTGCATCAAAGTAGGTCCAAGCT
AACTTGTACGCCATCATCAAATTAATCTCCTATATCCCAGCATTCCCTTA
GTGTATAATGTTTAATGAAAAAATAATTAAATCCACTTGANAAAAATAAG
TAAATCCACTTGATCTTGTAACCTTTAATAGAATATCAAGCTGTTGTTTC
GTTCGTTGAATTTGCAGATTTCTTGAACCAGACGTGGATGTAATTTTGTA
GCTATGTTTTGATTATACATGTATTTCCAGGAACCTAGAAGTCTCACTCT
TCCTGGCCAGGCTTACCTTTTCTGTAGGCTACATCACATATGTTATCTGC
CATATGTCACATTTCCATTCAGTCTCATCATGATAGGCAGATGCTGCTGG
TACCAGAGGTTATCAGGCAGTGTCAAGCCATAGGCTACTTCAATCAACCC
CGATGTCAATCCAGCACACTCGTGTATTGCTTTCAATGCCTAACATTATC
TGTTACAACACTTGATATTCTGCTGAAGGCGTTCCTGTTGTCCAGGATGT
CCTTTCAATTCTACATACTAGACAGGAAAACATTTCCTATGGCAACACAA
GTTGTATTATATTCACTGATTTTTAAAAAGATAAGTTTACCTCTGCCAGG
TTTCAGACTGATCATGCTGGAATTCAGTTGGATATGACCCAAAAAATTGT
ATCCAGCTCATCTACATGCACTTCTGATTGAAAACTCCTTATGATGTGCT
AGACTAAGTCTATAATTAAATGCTTCAACAATTTATTGATTGAGAAACAT
AAAGTTCACATTCAAGATAGACTTTTTACATTGGCATGCCTTTAATGCAG
TGATGCATCACTAGTAGTTTCACACCAGTGAAAATCATTCAGATGCTTAC
ATTGAGTAGATGTCATCAGATTTTGGCCGTTTTTATTCAAGCAAGACTAC
CGCTGTAATGACTGGGTAGAGCAAACAATGAATTCAAGGTAAAAGAATGT
GAAGGGGCCAGTAATAATGTCAACACATCCTTTCCTGTGTCCCAGTCTTG
AGCATGTGTTGTTAGGCCCATAAGTCTTTTCCAATTTCAAATTCTGCTGA
GCCCCTTACTTTACCTCTGATACATAATGTCCCAAAGGCACTGACTTTAC
TATATGTAATAAGACTCCCTCCTCATGCATGTCCTTGGGAAACTTCCAGT
TGACTTTGAAAGTGTATAAGCTACACAGGTCAGTGACCACAGACAACACT
CGTCCATGATAGGAAGGATTACACGTTTTAGGGGCTGGTGGTCAAAGGCT
GCCTTGCATGCAAATTAACATTGAAACTACATGTACTTTTTACTGAAAGG
AACAACCTCCAAGCAATCAGAATGGTACAGCTACCTAATTTTAGCTTGGC
AGCTACATTTACATATCCACAAAACATAACATTGAAATCTATCAAAAACA
GTGTCTCAAAACCAGATCTAGCCACAGAAAATCAATAAATCCACCATGTG
ATAGTGGTGGGACGTGTCAATACTATCAATACCCCGGTAGTATCATGATC
AGTATCACCCAGTATTACGGGTGACTGCTAGGGAATAAATTGAAACTCCA
TCACTCAGCAGTGCATCTGTTGCACAAGGAGTTATATTTTGTCTCCTTAC
TTCAGGACCGTTTCTCACTGGTGCATCAAAACCATGCAATGACATTTGAC
GGAGCAGCTGGACATTTGTTGCTTATTTTACATTCAATATTCATGTAAGC
CACTAGCTTTGTTATAAAACTTGTGCTTAAAGTGCACTTGTAGAGTTTGT
GATAACCAGGGAAAGGCATGATGAATTCAGGTGTGACTTTCTGCAGCGTG
ACTTGCAGCATTTTGAGAAAAATTTTGTCAGATTACTCAGTCATCCAGAA
CACTGTCCAACCAGTCTTCCAAATCCACTGTCTCCTCCTTTGGCTGGGGA
ACGTCTGTAGGACAATGACAAAAAATCATAAGAATGGAAAATGTCTTCTA
ATCAAAACTGTACAAAACTACTGACTTCTTGGCTTCAGAATTTCTTAAAC
CAAGATGTCCAAACCACTGACACAGCAGCCACAAAATCTATCAATATGAT
TACTGGTTTTAAGAAAAAAAACTGGCTGGCAACATCTATCTCCTCATGGA
TTCCCATGAATCCATGAAGAGATAGATGCAATCCGTGACCTTAAATACAT
GTACAAAGATGTACATTTGTACATATAGGAAATGAAGTCTTTTATGCTTT
CAGTCTACTGTTTTCCATATGTTTTACCTGAAAGATATGTAAGGAAAAGT
AACATTCAGCATTCAGATATGAAAATAATGCTCCACAACACTACCATACA
AAATGCTGCATGACAAGTTGTTATTACTGGAACGTTTCGTCATGTGATGA
CAATATGCTCTTTCTTCCTCAACTGGGAATGATCCAGCAGGCAACATGAT
GCTAAATGAATATCCGATGACTTGCACTAGATTTACCATGATCCTCGGTG
TGCAGCAGTATTTGAGTTTCATTTCTCATGAGAACACAATCAATGTACCC
TTTTCTCCCATCAGTTAATCACGACTAACTGCAGGCTAATGACTTAAAAC
TCCATACAGTTCATAAATTCCACACGATACTTATTCCCATAGCACATTAG
AATGCAGGTTATATTTAGGTCAATTTTCAGAGGATGAGTGATGATACAGC
TATGATCAGGATGTTGCAGAAAAATGACTTGAACCAGAAGAGAGGAAGCA
CTTATCATCACTCATACAACATGTGAAGTTGGTGACCTGTTTTTGCAAAT
TACTTTGTGATGGAAAATATAGCAAAAATGTACCGTGTTGTTTCTTAGTA
GGCTCCACCACTGAATCCTTCTTGAGGTCTTTTAGTTCCTCTTCATTTGG
CTGATATTCTTCCTTCTCAACATTGTTTATGATGATATCTGGAAGTTAAA
ATTGGCACAACATGCGGATTACATGCTAGTCAAAACCACTATCATCAACA
TGACCTATAAACATGATTATCATTGTTACTGCCATTCTTGTTTTTCTCCC
ATTCAGAAAGTGTCCAGCATAAAGAGAGTTACCAGTCCGTGGCATTGTAT
TTGTAACACAAGAACAAATCTATAAAAGGGTAAATCAGCCTGAAAATCAC
ATATCTGGTTAGACAGCTATATTTCTATATGAGCAGATTCTGCTTCTAAG
TACTAAATGTTTCACTAGGATAGCCAGACCTACTGTTAAGTCTCCTGGAC
TAAAGAAACATTCCATGCCTGGTTTCCATTTATTCCCAGATTAGAGTTAT
CTGTAATAAGTGGATATGGAGGTCAGGTCAGACTCCTGTTATTATCAGAT
TCAAATGTTGGCCCAATTTCACACTGGCAAAAAGTCCATTCTTACCTTCT
TTTTCCCTGTCTGTGGTGGGTGTATCTGGGTGTGTCGCAGAGTCCAGTGA
CAGGAGAACATCTAACTCATCATCTAACTCATCCTGTCCTCTGTCCAACA
TTGTGTCCTTTACAGGTCTGTCCACAGTCTCATCACTCGCCACTACACTC
TCCTCAGGGTCCTGTCCTGTTTCCAGGTCAGGTGACTCGACCAAAGCAAC
TGGCACTTCCTCAGAGGAAGCAGCTGGCACTGAGAAGTCAAACTTCAAGA
CATCAGCAGACTTGCTTTGCTGTTTGGGATTCAGGGACACATCCAGGTTG
AGCTGCAGAGGTTTGTGCTCCACCCTCCTGAGAAGATTGTCCAGGATGCT
GGATGCCGTTGACTCTGTGATGGACAACCTGGGTTTGAGGGGAGTGTGAT
GAAGCGTCTGCTGCTCGCATGATGCATGGCTGGCTGCTTCTTCATTGAAC
CTCTCTACTATATCCTCCTAGGAAAGCAAAGGTATGATAAATGTACAGGT
TTAGTTAATTCTCTCTATGTACCTTATTGTGTATTTCCTTAGTTAAAAGT
GTTCTTATAGTCCTAATTAGTATTTTCCCATGCCTTTGTTATCAACCATT
TGCTTTATGGTAAGGGCATACTCCTGACAGGAAAGCAAAGGAAATATATA
CTGCAGAAGCCAATATCATGCTTTATGTGATGGACCCTAAATGCCTATTT
CATGGACATTATCAAGAAAACCATTAGATGGCATTTCAAGATGAGGAGGA
TTGCAAGGTTTTGTGCTTTATGCTGTGATTGGTATCACCAGGTTGTCAGG
CGGCTAGTTTTCATCAGAGTCTGCACTTTATTGTACATCTATCATCACAA
AGTATCACCATGAACTGCAATAACTTTATCATGGGCGGAGACAGCCATTG
TAGGATAATATTTCCTGAGAAGAAAATTACCGGCAGCATTCCAGTGCCTC
TTTCAACACAAGAAGGAAGCTTGTATCAAGTTGAAGTTCATTTGTAGCAA
ATTGTATCATATTTCTGCCAAATAGAAAAACAGCATCAAGGTCACCACCT
TTGTTCACTAAACTTTGTTCTCAACTTGGTAGACATTTAACATGCAGTTT
CATGACTGACTTAGAATGGTAACATGGACAACAATGCTATTAAAAAACTA
TAATGATTGATATTTGTCATGCAATATTCTATAGAAATGGGCTAGTATAT
ATATATAATATAGCTATAACTACATAGGTAGAGTTTGGCTTACATCATCA
TAACTCTCTCTCTTGGCTTGGCTTCAGGAACAAAGATTCAAGAACTTAAC
TAATGTTAAATGAAATTTCCAATGAATTACTACCACTACACACACACACA
CACAGAGAGATAGAGACACATACATATGGATACAATCAGATGCAGGGATT
ACAGCATGATAATGTAGTGTCACCCACACTGTATACTAGTACTGCAATGG
TGTTAATGTTTAGTGAAGCTCTTGCTTTGATCGCTTTCACTCTACTGACG
TCCCAGACTTTGAAATTGTTTTAATTGAGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000229:129162..148691+

>BlTCONS00113468 ID=BlTCONS00113468|Name=BlTCONS00113468|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1809bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000229:129162..148691+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGCACTGCAACAATGGCGGCCAAGAGTGGAACTTTTGACTTCGCCAAAGC
TCTCGCTGGGATTTCAACTAAAGACGACCATGTAGAGACAACTACAGGGG
ATGACGACTCAGATAATGACTCATGGGAGTCATGCCATGATCATGAGAAG
ACTTACTTTAACTTGGGGGCTGATGACTTGATGGACTGTAATAGCTATGG
AACTATGAGTTGCAAGGCAGAGGACTACTTTGAGAAGTTGGACAAAAAGA
AGAAGACATCAGCCTTAGCCAAAACGTCAACTAAAGGAAACCACTGTAAA
ACAAAGACATCAGGAAAAGACAAGGCAAAGTGGAAGGTGTCACATCTACC
ATCACACTGGAACATTTACTTGTCAAGGATTGAAGAGCAACAAGCTCCCA
AGAAGCTGACATCTGAAGAAAAGGAAAAACTGAAAAAGGACTTCAAGGGC
TTGCCTTCAAGTGCCATCGTTGAGCTTGAGAAAGCTGTTGTGAAAGGCAG
ACAGAAGTACATGGAGATGTGCACACAGGACTACTCCAAACTGTTCAGAC
CTTGTGAGGACCATCCAGTTATCACTGTGAAGATGATGGTGCAGTATCTG
GTAGAGAATTTTGTGGAAAGGTTGGAAAGTGAAGATTGGGAGGGCGTGGT
CACAGGGATTGCAGACGACCCATATGAGGACACATGGTTTCGGACCATCA
AGCACACTGTGAAAGCCCTTGCTGTGCACTTCAATGTCTGCAGCAAGAAT
CAGGTAAAGAACATTGTTATTGGGCTGAATCTCCCATTCCTAATAGCCAA
CAAGTTCACAACAGAACTTCTTCATGTCATGCTGTACTGGATAGTGGACC
CAGTGTTTGGGCCTATGCTAGCGGAGATCATTGGGGAAGTGGCTTTGGAA
GATGGATGCCGAATTTACAACTTCCTTGTGATGCCAATTGCAGAATACAT
TTGTCCACAACAAAAACCACTCCTGAAGTACAAGAAAGTCAGGGACATCC
TAGTGTTCTACCTGTGTGCAGAACTGGCAAAATCCACTGGCAAAAACAAC
AGCAACATAGAGGTTATGAAATGTCTGGTGAAACTAGATGGTCATGAGAG
CTGGGCTATTGTAGAGGATATCTTTGTCAACGGGAGGTACTGTTCACACT
ATGGCCACTACACCTACATTGACTATCTTGAAGGTCTGAACTTAGGTGTC
TCGAAAGACCCGGATTCACTTCACAAGGCTCGATTTGAGCGCCAACCAGA
CAATCCCATTGTGGAGAAGCATTGGAAGTCATATGAGGTGCGTCGCCTCA
AACTAGAGATGCAACATGAGGAGAACTTAAAGGATCCCAACTACCACAAA
ATGCACCATTGCAAGACGGAAGATGCTGAGAAGATGTTCATACGAGTTTA
CAAGTTTTTGCAGAAGAAGCAAGAAGGATGTAAATGTAAGAAGATGGGTG
AACACAGTGGGATGTCTAGCTCTGTGATTGAAGCAGTTAAAAAGTTGCAA
GAAGAAGGCACGAGTAATGACAAAGTTTCAGGCACAGAGTCAAAGGGTGT
GAAGGAGAAGAAGAGTGGCTTAACCAAAGAAGCAGAGAAGTTACCTGAAA
AGCCAGTGGCAAATGGCAGCAGCATATGTCCTGAAAAAATACAAGTGAAG
AAACGCAAGATTAGAGAGTGTGGCTTCTGTGGTAAGCTGTCCACCCCCGA
GCAGAAATTCTCCAAGTGTGGGTCCTGTCTCCATGTTTACTACTGCTCAC
GGGACTGCCAGAAACAGCACTGGAAGTCAGGCCATAAAAACCAGTGCCGC
AAGAAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:129162..129274BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:129162..129274Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:129919..130068BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:129919..130068Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:130474..130964BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:130474..130964Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:131420..131802BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:131420..131802Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:131922..132022BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:131922..132022Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:132307..132356BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:132307..132356Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:133295..133406BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:133295..133406Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:133824..133969BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:133824..133969Branchiostoma lanceolatumexon
BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:142123..148691BlTCONS00113468-exon-Sc0000229-1564993656:142123..148691Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BlTCONS00113468BlTCONS00113468-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000229genomeSc0000229:129162..148691 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlCUFF055678