|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at Sc0000088:461040..469259+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96896 ID=gene:BL96896|Name=gene:BL96896|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=8220bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000088:461040..469259+ (Branchiostoma lanceolatum)
GCGGACAAGGCGTCCACCGTGAGCGCCATACAGGGCGTCGCGTACCAGAA
AGGCGGCACGAAGACCGGGGCTGCTATGCAGTTCGTCCGTCAGAAAGCAG
CATGGAGGGGAGGTAATGTCCCGAAGGCAAGTACCGAAATGTTAAGATAT
TTCATTAGGTGCATAGATATAGTTGTTGTTGTTCACCTAGTAATATCTGA
TGGCACATAGGTTAGCAAGTTTCCTTGCTGTTTCAGTAGCAGGGTAATTC
GTGCTCAAAACAGCTCTTCGAATTCGGGCGTTAGACTCCTATTTTAACCA
GGAGCTCAACTGCTGTGCATTTGACGCCAGTTGAGCTGCAAGGACATCCC
TGTATAGATACAGTACTACCGGTATACTCTACTTTCCTCATCACGACAGT
CACAGACACGGATGTATCTATCTACTCCCACAGGTTTTAATCGTGGTGAC
AGACGGAGAGTCCTATGATTCCGTGACGGCGGCAGCTCAGAACCTGGCCG
CCGACGGAGTGAAAGTGTACGCCATCGGAGTGGGAGGCTTCGATCATAAG
GAACTCCTGCAGATTGCCAACAATGACCAGGACAACGTGATCGAGTTGAC
CGACTTCAATGCCCTGGCCACGAAGATTGACGAGATTGCCACAGCTGTCT
GCACATATCCGTCAGAAGGTATGTTCCAATTTGTTACTTACAGGGTTGGC
TGTTATATGGCTTATATACACATTGATTTTCGGCATGCTATGGAGGTATA
GTTTTGGATGGGTCTGTGGGTGAGACTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TTTTATGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GCGTGTGTTTCCGGATTTTTGTAGTCAGCATACTTCAAGAACCTCTGAAT
GGATTATGGTGATATTTAGTGTGTAGGTAGGTGTTGGTTAGACAAAGGTA
AAGGTCGATTTTGGGCTCCCTTGTATGTGACCTTGGTACTGCAGCAGATT
ATGCAACTTCAAACATCATTTCCACAATTAATAAAAATAAGTTTATTGCA
AATACATGCCCGAAGGCTAAATGCAAATAACATACATAAAAGAACAGTGT
ACAAAATAGGTATAAAAGCTGCTTATCTAAATTATACAAATGTAATTGTC
TATAACTAGTGAAGGGTTTGACTTCTCTTTTGTAAGCAATGGAAGACGTA
ATGTCCCACCTTTTCTATAATTTGTGGGTTTTTGGTAGTTAAAAGAAGAA
TAGTCTTTTCTTTGTCTGTAAGCTTAGGGAAATTCGGATAGATTTTAGTG
GTCTGAATAGACAACTCATTTCGTGCATTATCATGAAATGAACAGTTTGA
AATAAAGTGTATTTCGTCTTCCACGGCATTTGTATTGCAATACTTACAAA
GTCTTTCGTATATAGGTAATTTTCTATACCGGCCTCTCTCTATTTCAAGA
GGATGAGCACTAACTCTAATTTTGCTAATGGCTGAGCGCAGATCAAAATC
TGCAAGATCAAGATAACTCTCTAAATTGTACATGGTTTTACATTTTGCAT
AGAATCTTAACTTACCGCTGTCGTTTACCAAGGTATGAAAAAATGATTGT
ATATATATATCTGTTAGTCTCCTTCTCAGCGCTNGATGAGGGGAAAACTA
TACTTGCAGCGTTTTCCATTATAGGACTCAAATACACGTAACATATGTAG
TTTATGGCAGGTGGAACATAAGCCTGGATGCCAGACCCCCAATCTCTAAC
ATATCTATCGTTTGAGGGTCTGGTCAGATGGCTGGGGAAATTTTATCGAG
TCAGCTCAAATGCTGAGCTATGATTCCACCAATGGAGTAGCAGCAGGATC
AGCAGGGAGCCATTTACACCCCTACCCCGATTGGATAAAGACCCCCCGTT
TTATTTTTGAATCCACTAACAATAACAATAAATCTAAAAGGTAGAACTGC
CACCACTATATCTCAGTTTAACAAGCAGGCCAGCCAGAGGTACACTACTC
AATGTACTTTCAAGTTCTGCTGTTATTTTGGAAAATAACTCCATGGACAT
TTTGAAAATTGACTGGTTAATGATAAACTGTTGAGCTGTGTCTTGTCCAT
GATTCGCTATTGTTAATAGCCAGCTGACCAATTGTGGTGCCATGTAGTCG
GCTACCTGTGGTGTGCGTGAGTGGCCATCAATCACAGCTTCTCCTCCCAC
GGCAGCAGTCTGCTGAGAAAGTTTCTTCTAGGCTAAGGTCTACCATTCAC
AGGCTCCTATACTTCCTATTGTAAACATATACGAAAACGGCTATCAAAAG
TCACCTACCTGAAGTTTAGATCATGGAAAACTCACATTGGCAGCGTAGTC
TGACCTCTCAAGTGTCGATCTAAGGAGTTTCGCCAATTTTTCACCGGCGC
AAAGTGGTTAGATTCTATCAAAACATGGTGAGATGACCTTTGACCTCCGT
ACACAGAAACTGAAAACATCCAAATTACACCTATTTCAAAGTGTACCGGA
CACTCCAAACATGGCTGAAACCCTATTTTTCTAACTAAATAAAATAGCCA
CAACCCTTACCTGTCAATTCCAGCTCAACAACGCCAACATTTCCAACAAA
GAGGCCTCCTACAGCTACTTTGAACAAAGCTATACAAGGCTATTTCTATG
AAATTAAAATGGACCCTCTGCGCATGACTGTAATTGTGACCTTTGGCCCC
CAGCCATCTGACCAGACCCCCAAACGATAGATACGTTAGAGATTGGGGGT
CTGGCATAATCAAGACAAAAAACAAAACTACATTCACTTAATAATACTCT
ACATAAGTTCCTTATTGCTTTGCAGAAGAATGCGTTGTTTAACTTCATTG
TTATATATGATTTGCCATATCAGAAGACATTGATGGTACTAAAAGTGCTT
GGTCCCTGCATAATAGGTTTAACAAAACTTTGGGTGATTTTTGTTAGAAA
TTCATTTTTTTTACCATAGGAACGAGCTGGAACCCGATAGAAGGGTCGTT
GTCGTTCGTTTCAATCGGATTTTGTGGCGTTTGGGGCGTGAACACGGCCG
GAGAGGTCCTCTACCGAGTTGGCACGTACGGCAATGAGAAAGCTCCCGGG
ACGGAATGGCTTAAAGTGTCCGGGAACGTCAAGCTTGTACATATCAGTTC
TGGCAAGGGCATCGTGTGGGGAATCACCGCCAAGTACAGGGTTTATGTCC
GAATCGGTACGTACAATTTTTCAGGTTACTTTCACAAGAGAGCCACTGTT
GAACTGAAATTACTTGATTTGCGTCGTTACATGGATGTCGTTTGCATATA
CTTACTAGGTTGCTTTCACTTGGCAATGACTTTTCGGAACATTAGGAAGA
TTGACACAACAGCGTTGCATCTTCAACAGCGTTGTATCATCTTGTTAATT
TATTGGTACAGTTAATTCCCACCATTATTTTTCCCTGCAGTTTTGCCTAC
AGTAACGGTCTTCAACGTCTTTACTTCAAATTTGTATAATGGGTAAACTT
ACATTATATAACAATCGTAATTACCTTCTATAACTATTGTTGGAACTGCA
GGTGTCCGTTTGATTGTCTGTTTGTTCGTTTTCTTGTTTGTTTGTTGGAG
TAGGTTGATGAAATCTTTAACTTGCGATATTATCGTGTTTATCAGGTATC
TCAGCACAGCGTCCACAGGGCACGGGCTGGACAGAAATCAGGGGAATAGG
CCTGAAGTCCGTGTGCGTGTCAGGATACTACGTCTGGGGCGTGACAACCA
CCGGCAAAGTCTATTACAGGACCGGGGTAACCGCAGGAAAACTAACGGGT
GCGTATGTTAATTTCGATTTTTGTATAACGATGTTACATGATAGTACAAC
AGAGCAGTAGACAGGATATTACGGACAAGGAAGAGGCCATAAAACATTAA
TACATGCACGGGTTCTTTGTGTACAAATCTGCATGCGTAAATGTGTGAAT
ATTTGATTGTCACGATTCATCTGAGCTCTACTATCAGAGTTTCTCTCTGG
CACTTGTCTAAACCTTGAATGAACCTGGTCATCCAGTGCTAAGTAATATA
AACGATGTGTCACTGACGCTTTGAACGGGTTATCCTTCATATTTGTAGGT
ACGCGGTGGACGATGCTGAGAGGAACGGCCATACGTGGTCTATCGTACGT
ATCAATCGGATACGCCGGTGTGTGGGGAGTGACCTCTAGCGGTGCGATCT
GGTACCGCAGCGGTACGTACGGAGGAAAGGGGTCGGCTGGGACACGCTGG
GTCCAAGTCACGGGCTCCCTGGTCAGCATCAGTGTTGGATACAACGTGGT
GTGGGGAGTGAGCGCCATTGGACAAGTGTTCATTCGAATCGGTAAGAACT
ACTTTTCTAATGGTATAATTGTTGCCTTTTTTCTTGAATCTAATGCAGAA
CTGTAAATACCTGCACCGGTCACATATACGGAATCCCGACAACATTTCTG
TGGCAGAAAGTGCAGTTTAGAGAATTGTGCATTTCGTTTTTTTGTGTGTG
TGCAACACAATTGCAACACCTGATAGATACCCCATACAAAATGTTTTACT
ATTTTTCCCCTCAGGAATAACTGCACAGACGCCTCTTGGAACAGCCTGGC
GATTGGTTGGAGGAAGCCTTACTCAGATCTACGTCAGTTCGCCGTCCAAT
CGCGTGTGGGGATGTGGACCGAGCTATCACATCTACATCCGTGTAGGAAT
TACATGGAGACCGCCGGCTCCCCCGCCCTCACCTGGTATGAATCTTGAAT
CCTCCTCCTGGTCCCGGTATCAATCTTGCTTCTAATGTTAGAGATTGATA
AGATTGAGATCAATTAAAGCAATCATGTCTTCTCCTCTATCACAATTTGA
CCATTGTTCTATCGCACACCGTTTGTACTATTTGATTAGATCGGATCAAA
ATACTGTCATGTTTATCTAATCGGGAAACCTTACTTTCAGAGATCACCTG
TCACTCAAAGGCAGACATCCATTTCTTAGTGGATGGATCCAAGAGTGTCA
AGACACGTAACTTCCCTTCAGTGCGGCAGTTCATCCTTAAGCTAGCAGCA
GGGTTTGAAATAGGATCCAACAAGGCCAGAATTGGCGTCTACCAGTTCGC
TAAAGACATGAGAACGGAATTCAAGATGAACCAATACAATGACAGAGGGG
TACTTGTACTTTGATGGCTTCTGATACAATGTCTTATAAATGTTGCCAAT
AGTATGCAGCTGTCACGAATTCTTTGTTCAATTGTGTGTTTCTGGGAAGA
CCTTGGTTCTTTGATGATGATGTTGAAGCTATCGTTGGTGAGGTTGTTGT
TGTTGATGTGGTTAAAGATGTTGGTGGTGAGGTTGATGATGTTACTGTTG
ATGGTGATGGCATGGATCGTCACGATAGTGATGATGTTCATGTTGATATT
GATGGTGATGACGTTGGTGGTGGCAGTGATGTTGGTGATGATGTTGATGT
GGAAGCTGTTTATGGTGACGATATTTATGTTGGTAATGTTGATGCTGATC
TGATAGAGATGATGATATTGACGTCGATGGTGAAGATACTGATGATTTTT
TCGTATATATTGATGGTGATAAATTTAGAGGTGGTAGTTATGGTGATGTT
GGGAATGATGTTGATAATTTGAAGGTGATTATATTAATGAAGATGGTGAT
CATGATGATGATGATAACCCTGTCGCAAGTGATGCCCAGATATAGCGAAG
ACAATTCTGTGATGAAATTATTACAATTGATTAATACGAATGGTATGTTT
CGACATAGGCCGTGTTGAATGCTATCAAGAAGATTGAGTTCATGAATAAA
GGGCAAACCCGGACTGGATCTTCTCTAAAGGCGGTTTACAATGAGTTCAC
TAAGGCTAATGGTGCACGTGACGATGCGACAAAGGTGACAATTCTCCTAC
ATTGAATAAGAGTTGTATACAATATTTGTCTACTTTCTATCAAGATTTAC
AGGTTTGAGATATCCAATGAGGAAACAAAAGTGAAACTGATAACCAATCA
TATAGATGCTAAACAAAGTGCAACAAACATAACAAATCAAGAAGATGACA
AAAGCCATTATTGAATTATGATATATAGTATGATAAGGTTAAGGATAGAT
TAATTTTTACCAATGCTTGTTGGTTACCTGGACTAACATGATAAAGGTAT
TATAATTTCACATATATATATATATATATATATATATATTTCACTCCATA
CCCCAGATATTTGTGAAATACATTGTTGTATATTTCACTCCATACCACAG
GTCGTATATTTCACTCCATACCACAGGTCGTATATTTCACTCCATACCAC
AGATCGAGTAGTTTGGCATTTATTCCTTCAAAATGTTTTGGGGGAATTTT
TACCTTCAACTGGGATGACCATTTTTGCTCAGGGTGATTTTGGAACAGTC
CATTTTTATGAAAAGTGATACAGAGGGATATCTGACGTCTTTACTAACAA
ATACTGCCTTTCTGATAAAGAACTATTTTCTTGAAGGTTATCATCTTACT
GACGGACGGGAAGGCAACCGACCAAGTGAGAGCGCCTGCGCAGTACGTCA
AAAACAAGGGTGCCCGCGTATTCGCTGTGGGCGTGGCCAAATACAAGATG
GATGAACTTAAAGTGAGAAAAGCCATTTAAGAATTATTTCTCCATATTTG
ATCTACGTCATACGTTCTATGCTAATGTGTGCTTTAAGGGTGACGACGTA
AGTAAGCGTTGTCATATCTTATAGCTCATGGCGTCGAAGGACGACTACGT
GGCTACTGCTAAAGATTTTGGTGACTTGGACCGGATCAGAGATACAGTGC
TGAAAGGCGTCTGTAACGGTAGTATTGAAATATCCATATTTCAACACTGA
GCTTCTGTAGAAGGGGGTGTCGGTAATTGACTTGCAGGGTGGTGGTAAGG
AATAGGAGTATCAATGCTGTGTTTCCGATTGTCGGTAGGTAGGTAGGGCC
TAAAGCTGTCGGGGACTCCCACTGAGTTGTCGGGCGACCACTCTGGACAT
GTTGGCTGAAATTTTCCCGACATCTGGAAAAATCCTCATTAAGACCACAA
AATTCCTTTTAAGACGCATGAAAAAGCTGTCGCCTGCCAGATATCTGCAG
TCCCGACATCTAGAAAACCTGTGTCTTAAGAAATGACAAAACACAATCCT
GTTTGAAGCGGTCGCATTATTTGGTGGCTTAACATGTAGGTAAGGTGTGT
GTTGCGCAGTGGTGATGTGCTTACTTCCTGCAGTTCCTGTGAAACTATCT
AAGGGTTATTGTCCAGCCCCAGGCTGTACATGGTAATATAAGGCCTGCAC
GGTTTCTATAACCACCTAATAAACCACCGAGCGGAACTGGTCAATGGTAA
TACGGCCTCATAATTAATATCAAATTGAGACATCTGATTGGTCAATCCCT
TGTAGCTATATCTTGATGCTTTTTTATTCCTTTTTCGGTCTGAAATTAGA
TATTGGTATCAATTTACCAACAACATGCAAATTTGTGGGGTTTTTTTTTT
TTATAAACAGCTGAAAAGGGCAAACGTAACATTGGAGCCGAGGTCGAGAA
CGGACTGCAGTACCTGAAGCGCACTGCGGTGGAACTGAGGGACGAACTGG
AAGGTCAAAAGAACCTGGGCCTGGAAACACTACAGACGGAAACTGGAGAG
AGAGCTGTTATGCATCTAAGAGAGGTTGGTTTTCTGAGCATGGCAATTCT
CTAAAGTAGCGATGATGTCTGTGGTCATGTTGCCCATATTGCTGTAATCT
TATGTAAGTCGGTACTACTCTAAATATGTCCGGGTCCGTTATACCCAATT
ACTTGTATTCTTAATTCAACAATAGCATTTAAAGTATATATATACACACA
TGTAATGTGAACCAAATGTAGCACACTAACTTGCCGTGTATTCATCATTA
ATACATGTATATCAGATGAACATCGAACGTCTGGAAGGTGACGCTGGATA
TAACTAACAGTTTCCCGTCTTTCTAGATATTAGATTCCATGTCCGAACTG
ACGACCGATGCCATCGAGCAGGGTGAAGAAGCCGCCCAGGAGGTATCACT
CGTCCTCAACGTGATCGACCAAAAGCTGCAGGAAGTCCGGGACCTGCCGG
ACATCCGGGACGAGCTGGAGGACGTCCAGGACCTTCCGGAACCTGACGGA
CTGGAGGATGTCCAGGACCTTCCGGAACCTGACGGACTGGAGGATGTCCA
GGACCTTCCGGAACCTGACG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000088 | genome | Sc0000088:461040..469259 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | gff3_genes |
| Gene id | BL96896 |
| Biotype | protein_coding |
|
