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The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at Sc0000009:1580091..1595556+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96543 ID=gene:BL96543|Name=gene:BL96543|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=15466bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000009:1580091..1595556+ (Branchiostoma lanceolatum) CGCAGGACTGTGCGGACCTGTTCGCCACCGGGACCCGTCAGAGTGGCACC
TACACAGTCGGCGAGCCCAGTCCGTACCAGGTCTACTGTGACATGAGCTT
CCTTGGCGGCGGGTGGACAGTTCTTCAGCGCCGCCAGGACGGATCCGTGG
ACTTCGCCAAAACATGGGAGGAATACCAGGAAGGGTTCGGCGATCTGGAA
GCAGAGTTTTGGTTGGGACTGAACAAGATTCACACATTGACTACGGCAAA
GACTAACATACTACACATTGAGCTGGAAGATTTCAATGGAGGGAGGAGGT
ACGCGCGGTACAGCACGTTTACAGTCGGGGATTCGATCGGTAATTATGTG
GTGTCCATCTCTGGATACAGCGGAGACGCAGGAAACAGTTTAACAAACAA
TGGTCGATCTGATATAAACGGAAGAATGTTTTCTACTATGGATCGAGACA
ATGATCCAAACAGTGCACATTGCGCGTCTTTGTTTAGCCAAGGCGGATGG
TGGTACCCACTTAGTTGTGGACAAACGTTCCTGAACGGACAATATAACTG
TCACGAGACTTCGGTTTCCTGTGACAACGCTCAGGGAGTGGCCTGGACGG
GATTTGTAGGCTTGAGTAACTACTTGAAGAAAACAACCATCATGATCAGG
CCTGCTGACTTCACAGGTAAAAGAGAACGTATTAAATGTTTGTAGGCATT
CTACTTTACATCTTGCTTAGTCGTAATCACTTGTTATTCGTTGAATGTTT
TCAAGTGGTCCCCAGTATACTTTATTTTGGCGACGCCTCAGGGGTGACCC
TAATTGTAAAGAACTGTGCAAATAAATACTATGTTGTTGTTGTTTTTTTC
ATCAGACTCTGACGCGCCCCAGGACTGTGCCGACCTGTACCAAGACGGGA
TCATAGAAAGCGGAATCAATGCCGTCAGCGATCCTCGCGTCTTTGTCTAC
TGCGACATGAGGAACTCAGGCGGCGGGTGGACCATGATCCAGCGCCGACA
GGACGGGTCCGTGGACTTCGCTAAGAACTGGGCAGACTACGAGGGCGGAT
TCGGTAACCTCGATGGAGAACACTGGCTTGGATTGAGCAAACAGCACCAA
ATCACGGGACAGAAGACGTACACTTTGCGTGTAGATTTGGAAGATTGGGA
GAGTCAGTTTAGGTACGCGACGTACAGCAGCTTTAGTGTTGGAGATTCAA
CTGGAGAATATGTGGTCAGCATCAGCGGCTACACAGGTGATGCCGGAGAC
AGTCTCACCAGCGGGACCAGCCGTTTTAACATAAACGGTAAAATGTTTTC
GACTTCAGACAACGACAATGACCCAAATGCGAACACAAATTGTGCAAGTA
GATACAGTGGCGGTGGATGGTGGTACCCAGCCAGCTGTGGGTACGCACTC
CTAAACGGAGAGTACAACAACTCAGCTACTGCAGAGGGTGTGAACTGGGA
AAGATGGACAGGTTACACTTATTCATTGAAGACAGCATCACTGAAAGTGA
GGCCAGCCGATTTCTCAGGTAAGATCAATTCATTAACATGATCAAGTAAA
AAGATCCTTATGAATCGAGCACCTATTACTTACTAAGAACGTTCCTGTCC
GGAAAGGGTATACTTTTGAAAATACACTTGGCCATTTCTCACCAAGCATG
TAGTATTAATGTATTTTCTGTTTCATCATTATTACTTTCACTATTGCTAT
AACTACATTGTATATATACATTGTAGCGTTAAGGACTTTGTTATATACAT
TTTGTCATTAAGATGATGATCTGGAGGAAGCAGGAAATGCAGGAAATAAT
GTTTCATAGGGTCAAGATTTCAAACATGCCCAGGTGAAATTTCCTGCCGC
CGCCTCTAGATCTGTAAACACCAGGACGGGAATCAGACAAAACAGATACA
CGGCCTGTACAGCCAGTCTCTCAATGACCAGTGTCACATTCTTTGTTTTC
TCGTCAGTTTGTCCTGTTGGAACGTTTGGAGATTGTTCTCTCAACTGCCA
GTGTCTGGAAGGAGACGGTGACTGCAACCATAAGACCGGGTCCTGTTTAG
GACCATGTGCCAGAGGCTGGATGGGCAGCGACTGTCAAACAGGTAGATAC
ATGCCGATATCAAAAGTATACCAAAAGCCTGCACTAGCTATAGGCAGGTT
AAAGATGTCCTGATACTCAGAAAGAACTCTTCATGTGCTGGCAAGCATTT
GATTTCAGATCGATTTTGTCTGCCTATCTTTTTGTCATAGTATATTCCAG
TTCTACACAAAAGAAAAAAAGATAGCGGTTTGATCCAAAACGACATTCAA
TAGCCTGTTAGTCGCGACGTTCTGTACTTATGCGAATTCGTATTCAGATT
TTTCTTCTCTTGCCTAGCATGTTCTGAGGGAACCTATGGTCCTAGTTGCA
ACGGCACCTGTCGATGTGCGGGAGGAAATTGTAACGGAGAGACGGGTGTT
TGTGACCCTGCTGGGTGCATCGATGGATGGACTGGCGAGTCATGTGACAC
CGGTAAGTAACGTAATCTTCATCGGGCTTTGTCTTGTTTCCAATCTGTAC
AACGTGATTCTTTGGCAGGCTTACGTGGATACTATACTCTAATCCCGCGT
TGTTGTTCTTTTGTTGCTGTTGTTTCTAATCTCACACTTGGTTAATATTG
GCGTGGAATTTTAGGACAGCCGATTCATTGCTGACAAGATTGCATCCTAT
AGATGTGCTTAAAACTTACTATGACTTTGAAGAAGAAAAAACAACTCGAC
ACACGTGCCTGTGCTGATAGTTACAAATAGGCCTGTATATGACGTAATCA
ACATTTTTCATTTATTAGCGCCAGCCCAAATTGTGGTACCGGTGCCACAA
GACGTAGAAACAGATGCCGGGCAAAGTGTCTCTTGGACCTGCAAAGCAAA
AGGCTATCCCTTCCCCGTCATCACCTGGCAACACGAGGGCAATGACCTTA
CGACTACCGGAAGTGACATCATGATTGTCACGTCCTATAGCAGCAGCGGA
AACGACATGTACACCGAGAGTACCCTCTCCATCAGTAGTGTGGGACGGCA
ACATAATGGTGCCTATACCTGCTCAGCTAGTAACAGAGGAGCAAGTCCAC
AGACATCTTTCTCTTTGGCTGTCAGAGGTAGGTGTTTAATTACTCCGGGA
AGGAGGATGACCTCCTTCTGGGAGTATTGGGAATGCATTTGTTTGCGCGT
TCGCAGCTATTTCTCACGATCCCGTTGTCGCATTGGTGTGTAACTTGGCA
TATCGTTTGCCTGGTTCGGCGTGGGGATGCACAATAGCTTTGTTACACCA
TAACTACTTTAAACGTCAATCCAATATCGTAATTGCACCCCTATAATTAA
TGCTATGTCCCACTGCCCTGCCATAGGGACCATGTTATAATCCGTTATGC
ATGACTGGAATACTTCAGGCAGATACGGGGTATAAATCTTCCTTACTTGC
TGTGATCGTATAGTCACTGTTACATTGAAAAATAGACAACGTGCATCACC
ACACGCAACCTAGCAAACGATATACCAAGTTACATACCAATGCGGCAACG
GGAATTGTGAGTTTTAGCTGCGAACATGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GGCCTGCAATAAATTGTGGAAAGAGGATTTACTGCATATTTGTGATTTCT
GATACATCTTAGTTGTAAGGCTGAATGGTTCGTTGATAATTGAAAAGGGG
CCATCTAGATCTAACTTTGTGACTTTTCCCGGAATTTCTAGATCCCATCT
GTGCCATGCTGTAAAAACATACTTTTCAGCAGGTTGACCACTCCTGTATT
GAAAGAAAAAGATAAACAAACACTTTTTCTTTACTTGCTCTAAAACACTA
CTTGGACTGAGCAGAGATGCAATTTGTGTGGGTCAATACTTGTACATACT
ATAAATACTTCACGGAGAATTGTGTCCTACGGACTCTTGTTTTAATTCAG
ATGGTATCAGGCTAACGAATTGTTTAATAGGTCTTATCTCCTTTTCTACA
TTACATATCTCTCATACATTGGGTGTTACTTCAACCAATATCACAGTAAA
TCGTATCCATGAACTCTTAATAGTGGGGGCTACAAACTCAGTTATGTTTG
GGACCGCATCACCTAACGACAGCGACACCTTGCGACAGTGACATGTAGAA
TCAGTCAATATTGTCCTCGGGAAAATGGCAGACAGTCCACCGCAACGTCC
TCGGGACAACAATGGTTGTATGCTACAAATTCTCTTAACCAACAACTGGT
GGCTTCTTATAACGGCGGAATGTTATTTGCAAAAATCATGATATAACACT
ACTTTTTTGTTTTTGCTCTGTTGCACAGACACACCAGACAAGCCAATCGT
CAACAGTGACTTCGCATCAGAACCTACAGCCATCACAATCACATGGTCGT
TCCCTTCATACACCGGCAACCTTGCCATTACGGAGAGCCTCATAGAGTAC
CGGAAAATGGGAGAATCCTCTTGGCTAGCCCAAACCATTGAAGGGCAGCT
CACGACTTACATATTCCAAAACTTGGAACCGTTTAGCGTGTTTAATATAA
GGGTGTCTGTGAGAAATGAACTTGGCTACAGTGACACAACAGATCCTATT
CGCATTTGGAGTGGTGAGTCGCGTAATACTTCCATTCATTCATAGTACTA
AAAGCAAATTTTAGAAAGAACCCATTTATCTAGCTTCAGACGCAGCAGTT
ATCCCATAGCCTCAAATGATTTGTCATCACATAATTTCAAATGAGATTAG
ATGTTTTATATTTCTCAGTGCAGCGATTGATAAGATAAATCAATTATTAC
TTTAATGAGCGATAGCTGATGATATTCATCCAACCATTCAATTCAGTGTA
TCCACCCTGATGTATTAACTTGAGATAACATAACAACAAGATTGAAAACA
ACATTTGTACTCTCAAATCACTCATGTCTTGAATTTCTTTTTCAGTCTCT
GACTACTTTTTTTATTACAGCTCCAGGGAAGGTACAACAACTCGACCGAG
TAATTCTGTCTTCGTCGGAGATGAGGCTAACGTGGAATTCACCAGACCCT
GCAAAACCCCAGGACATCATCTCACACTACGAGGTTGCCTTTGGGATCAG
CGTGGCCACAATTGGAGTCCCTATCAGAACCACCAACAGTGGGGAAACGA
CGAAGATATTATCCGACCTAACACCCGGCACCACCTACATCGTCAAAGTA
TGGGCGGTGACAGCCACTGGTAACGGGGAGGAAGAGTCTAAGATCATCAT
ATTTGAATATAGTAAGTGTTCTTTAGCTGTTTGGTTTTTAATCGTCGTTG
CTATAGGACATTTGGTTGCTCAAGGACATTTGGTTGCTCAAGGACATTTA
GTTGCTCTAGGACATTTCGTTGCTATATGACATTTGATGCGTGCTAGAAA
TCTCTTTCCACAATCAGCAAATCTCCATACTTTTTCATTTCACGTTACTG
CTGAAAAAAAGTTATATGTGCCTATCTTTTTCTCCTGTGTGCGGGGAGTT
CAAACCTACTCTTAATCAAATGCAAACCTGAACTGTATTTTTTCTCTATT
TTGTATCATCTAAATGTCGATTGTCTTGTTTAACATTTCCATACCGTACA
CGTGCCGGCGAGGATATAGGTTGTAAATAACTTGAGTCCGTCGCCACTTT
GTCTTGTACCTTTTGTACGTTTGATGTTTTGTGAGCAAACAAAATATTAC
TTAAAACTAATTGTTTCTATTTTTCAGTGCCGAGCCAACCGTTGAACGTC
GAGGTTAACAACGTCGGAGACTGCGCCTGCGTATCTGGTAGGATAACAGA
TAGAGCCGCGGTGACAGTCAGGTGGGGTCAACCAGCAACACCCAACGGTC
AGATTCTCGGGTACCGCATTTCCTACAGCGCAGTGGGTCAAACTGAAAAC
ATGCTGACACTTACAACAAATGACGTTACGCTGCAAGTTGACAACCTGGA
GTTGGAATCCAAGTATACCCTAAAGGCAGGAAAAACATATCTTATTTCCC
ATTTACATTATACGACTAGTAATGTTATATGTACATGATTTAAATGCTTC
ACGTTAATTTTACTTGCCTCTTGTTTTCACACTGCAGGTTGCGGCTTATA
ATACTCTTTTCAATGGCACTGAAAGTGACGAGGCAACTGTGACGACACCC
GAAGGCTGTAAGTATACAACACATATTTCTGACATTGCCTAACTGTACAT
GTAACAGTAGTAATTTTCAGGCAGCCAATCTATGTGTAATATGCAGCCAG
CATTGCAACGTACATGTTTTGTTATTTCAAACAGGCCCGGGTCCACCTGT
TGGTGTCCGCGCCAAGCAGCTGTCTGTGGAGTCAGCTGTCTACTGCAACA
TTAGCTGGGATGCTCCTGTCGTAACGAAGGGTATTATCACCGGATATAAG
GTACCTTTATCTCTCACGATCCCGTAAGGTACCCTTAGACCACCTTATCA
AGATAAAACATGGATTTAAAGTGATCTTGAGGTGCATCATCAGTAAGGTA
TGCGCACTGAGGATACAAGTTTTCAAAACATTCACGAGAAGGCCTCATTA
TCATGACTTTTTTTCCAGAGGATACCTGAAGGGTACCCGGTGCAATTATC
TTAGCGGGTGTCACTTCATACTCTTGTCAACTTTGTTCCTATTTTGTATT
GTTTTGCTACGTTGAAATGAAATGTAACATTCATCTTTCTCGCCATAGGT
ACGATACCGTACATTGTGGAATCTAGTGCCAAGCTATTCCAACGAAAATA
CGGAAGGTCTCTCGGATGAAACAGTCACGGGCGCGATGGCTACAATAAAA
GAGATAGGTCCTAACAAGAAGGTCAGCGTCAGGGTCTCTGCAACAACTTG
CAACGAAGGCGAGCCTTCAGATGAACTGACATTCGCCTGTGTCAACAGTG
CTACCGGTATGGTCCTGTTTTCTAGTCTTTATCATGTTTTCTTTTTCTTC
TTTTCTTGCTGTGATCATAGATTAAAAGTCAATAAATGTAAACATATACT
TATACATGCGTATGTGAACACGCTGACACTCATTAACTTAAGCAAGTGGA
GTCCGATCTGGATTTAGAAACCACTAGAAAGACTGAGGAAAAGTAGTTGC
TGATAACAGGTGGTACTCAGAACAGGATTGGGTTAACTATGTAAAATTGG
ACGGGACTGTTTGATTGTGACTGGAGGTGGTTGCATGTGCCAGGTGATTG
CCCGATCAGACTTGATTTATTTGTGTGACCTTTGCTTACAATAGCCAAGA
TGGGCAAAAATGTACAACATAATGATGTCTTCTTTCTCTTGACAGCACCA
CCTCCTCCGCCTCCACCTCCTGATATTCCACAAGATGAAGTCAAATCGAC
ATCTTTCAAGATGGACATTCAACGGGCGTCATCTGAGAATGGTCCCATCT
GGTAACTAAAGACGTACACTTAAAACATATACCANTTTTACGCACAGTGT
GAAAATGGCAAATCTCTGGACCTTCAAACTTACCACACTTGTAGTTTATA
ATACGGAGGCTGTGACAATGTAAAAAGTTTACACAGGGGATGAAAGATTG
TTGAGAAATATCTCTCAGAAAAGTGCGCGCGCCAGTGTCACTTCCGGGTG
GTTAGATCCGGTGACCTTTGACCTTCGTGAAATGTTACGATAATATAAAT
TAGCCTTTTTTATTGCAAATAGCTTGATAGCTATAGATCAGGCCGGCCTG
CAATAAATTGTGGAAAGAGGATTTACTGCATATTTGTGATTTCTGATACA
TCTTAGTTGTAAGGCTGAATGGTTCGTTGATAATTGAAAAGGGGCCATCT
AGATCTAACTTTGTGACTTTTCCCGGAATTTCTAGATCCCATCTGTGCCA
TGCTGTAAAAACATACTTTTCAGCAGGTTGACCACTCCTGTATTGAAAGA
AAAAGATAAACAAACACTTTTTCTTTACTTGCTCTAAAACACTACTTGGA
CTGAGCAGAGATGCAATTTGTGTGGGTCAATACTTGTACATACTATAAAT
ACTTCACGGAGAATTGTGTCCTACGGACTCTTGTTTTAATTCAGATGGTA
TCAGGCTAACGAATTGTTTAATAGGTCTTATCTCCTTTTCTACATTACAT
ATCTCTCATACATTGGGTGTTACTTCAACCAATATCACAGTAAATCGTAT
CCATGAACTCTTAATAGTGGGGGCTACAAACTCAGTTATGTTTGGGACCG
CATCACCTAACGACAGCGACACCTTGCGACAGTGACATGTAGAATCAGTC
AATATTGTCCTCGGGAAAATGGCAGACAGTCCACCGCAACGTCCTCGGGA
CAACAATGGTTGTATGCTACAAATTCTCTTAACCAACAACTGGTGGCTTC
TTATAACGGCGGAATGTTATTTGCAAAAATCATGATATAACACTACTTTT
TTGTTTTTGCTCTGTTGCACAGACACACCAGACAAGCCAATCGTCAACAG
TGACTTCGCATCAGAACCTACAGCCATCACAATCACATGGTCGTTCCCTT
CATACACCGGCAACCTTGCCATTACGGAGAGCCTCATAGAGTACCGGAAA
ATGGGAGAATCCTCTTGGCTAGCCCAAACCATTGAAGGGCAGCTCACGAC
TTACATATTCCAAAACTTGGAACCGTTTAGCGTGTTTAATATAAGGGTGT
CTGTGAGAAATGAACTTGGCTACAGTGACACAACAGATCCTATTCGCATT
TGGAGTGGTGAGTCGCGTAATACTTCCATTCATTCATAGTACTAAAAGCA
AATTTTAGAAAGAACCCATTTATCTAGCTTCAGACGCAGCAGTTATCCCA
TAGCCTCAAATGATTTGTCATCACATAATTTCAAATGAGATTAGATGTTT
TATATTTCTCAGTGCAGCGATTGATAAGATAAATCAATTATTACTTTAAT
GAGCGATAGCTGATGATATTCATCCAACCATTCAATTCAGTGTATCCACC
CTGATGTATTAACTTGAGATAACATAACAACAAGATTGAAAACAACATTT
GTACTCTCAAATCACTCATGTCTTGAATTTCTTTTTCAGTCTCTGACTAC
TTTTTTTATTACAGCTCCAGGGAAGGTACAACAACTCGACCGAGTAATTC
TGTCTTCGTCGGAGATGAGGCTAACGTGGAATTCACCAGACCCTGCAAAA
CCCCAGGACATCATCT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000009 | genome | Sc0000009:1580091..1595556 + |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | gff3_genes |
Gene id | BL96543 |
Biotype | protein_coding |
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